| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP009273 | 134,297 | C→A | S243* (TCG→TAG) | cueO → | multicopper oxidase (laccase) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 134,297 | 0 | C | A | 99.6% | 879.4 / NA | 270 | S243* (TCG→TAG) | cueO | multicopper oxidase (laccase) |
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Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
GGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATAACAA > CP009273/134150‑134441 | cAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCACTCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTc > 1:794087/1‑150 (MQ=255) cAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTc < 2:2243530/150‑1 (MQ=255) aGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTAGCTCa > 1:2431185/1‑150 (MQ=255) 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ggCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGtt < 2:1356677/150‑1 (MQ=255) gCTGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTa < 1:2846495/150‑1 (MQ=255) tGTAATGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAAc > 2:651304/1‑150 (MQ=255) gTAAGGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACg < 2:1639710/150‑1 (MQ=255) aaTGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGAt < 2:2191268/150‑1 (MQ=255) aaTGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGAt < 2:2962546/150‑1 (MQ=255) aaTGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGAt < 2:2818787/150‑1 (MQ=255) aaTGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGAt > 1:6882/1‑150 (MQ=255) aTGCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATa < 2:2002596/150‑1 (MQ=255) gCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATAAc < 2:2212093/150‑1 (MQ=255) gCCCGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATAAc < 2:2427974/150‑1 (MQ=255) cccGTTAGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATAACa < 1:51144/150‑1 (MQ=255) | GGCAGATTGATTATCAACTGGATGTGATGACCGCCGCCGTGGGCTGGTTTGGCGATACGTTGCTGACCAACGGTGCAATCTACCCGCAACACGCTGCCCCGCGTGGTTGGCTGCGCCTGCGTTTGCTCAATGGCTGTAATGCCCGTTCGCTCAATTTCGCCACCAGCGACAATCGCCCGCTGTATGTGATTGCCAGCGACGGTGGTCTGCTACCTGAACCAGTGAAGGTGAGCGAACTGCCGGTGCTGATGGGCGAGCGTTTTGAAGTGCTGGTGGAGGTTAACGATAACAA > CP009273/134150‑134441 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |