Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 255,899 | G→A | intergenic (‑88/‑200) | phoE ← / → proB | outer membrane phosphoporin protein E/gamma‑glutamate kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 255,899 | 0 | G | A | 99.5% | 715.5 / ‑3.2 | 214 | intergenic (‑88/‑200) | phoE/proB | outer membrane phosphoporin protein E/gamma‑glutamate kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (107/106); minor base . (0/1); total (107/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
CTGTACAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAGATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACCGACGACAGTCC > CP009273/255752‑256045 | tACAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAatata < 1:66193/150‑1 (MQ=255) tACAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAatata < 1:857330/150‑1 (MQ=255) tACAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAatata < 1:896710/150‑1 (MQ=255) aCAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAatatat < 1:1447627/150‑1 (MQ=255) aCAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAatatat < 1:1447139/150‑1 (MQ=255) agatgcagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTa > 2:3722431/1‑150 (MQ=255) atgcagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACa > 1:3660958/1‑150 (MQ=255) atgcagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACa < 1:1714141/150‑1 (MQ=255) tgcagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAg < 2:1503395/150‑1 (MQ=255) tgcagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAg < 1:2695060/150‑1 (MQ=255) cagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTCATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGAt > 2:2106398/1‑150 (MQ=255) cagatgcCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGAt < 1:544548/150‑1 (MQ=255) cacaATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAAAAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTaataat > 1:2843162/1‑150 (MQ=255) aaTGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATAtt < 1:3229067/150‑1 (MQ=255) aaTGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATAtt > 2:1986015/1‑150 (MQ=255) aTGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTc < 2:1808523/150‑1 (MQ=255) gCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCtt < 1:494457/150‑1 (MQ=255) cccATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTa > 2:31640/1‑150 (MQ=255) ccATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaa > 2:2586195/1‑150 (MQ=255) ccATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaa > 2:1858688/1‑150 (MQ=255) aTCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaaaa > 2:3637628/1‑150 (MQ=255) aTCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaaaa > 2:1527734/1‑150 (MQ=255) aTCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaaaa > 1:1177686/1‑150 (MQ=255) aTCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTaaaa > 2:3476984/1‑150 (MQ=255) tCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAAt > 2:1045500/1‑150 (MQ=255) caccacTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAAtg > 1:3577762/1‑150 (MQ=255) accacTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAAtgt < 2:1444688/150‑1 (MQ=255) ccacTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAAtgtg > 1:3026846/1‑150 (MQ=255) acTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGt > 1:163508/1‑150 (MQ=255) cTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTa < 1:3726858/150‑1 (MQ=255) aTGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAAtt > 1:364682/1‑150 (MQ=255) cAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACATATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATttatt > 1:2248804/1‑150 (MQ=255) agagTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATttatta < 1:2383084/150‑1 (MQ=255) gagTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTaa < 1:2644366/150‑1 (MQ=255) agTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTaaa > 2:3190775/1‑150 (MQ=255) tGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATc < 2:3510786/150‑1 (MQ=255) tctTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGt > 2:3616070/1‑150 (MQ=255) cattttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATaaaa > 2:2009892/1‑150 (MQ=255) cattttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATaaaa > 1:3760016/1‑150 (MQ=255) cattttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATaaaa > 1:1864199/1‑150 (MQ=255) ttttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGc < 2:2120444/150‑1 (MQ=255) ttttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGc > 2:2315638/1‑150 (MQ=255) tttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCg > 2:1683817/1‑150 (MQ=255) tttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCg < 2:2110563/150‑1 (MQ=255) tttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCg < 2:2980691/150‑1 (MQ=255) ttcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGt > 1:1030913/1‑150 (MQ=255) tcattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGACCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTa > 2:1824241/1‑150 (MQ=255) cattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTaa < 1:3384674/150‑1 (MQ=255) cattCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTaa > 1:3651185/1‑150 (MQ=255) attCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTaaa > 1:3295641/1‑150 (MQ=255) attCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTaaa > 1:1265137/1‑150 (MQ=255) ccTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAaacaa < 2:496479/150‑1 (MQ=255) cTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAaacaac < 1:1833596/150‑1 (MQ=255) cTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAaacaac > 1:1556329/1‑150 (MQ=255) tGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACt < 1:2525430/150‑1 (MQ=255) gATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTg > 1:784690/1‑150 (MQ=255) ttttAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGcc < 2:1348776/150‑1 (MQ=255) taattaaCGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCt > 2:3132319/1‑150 (MQ=255) aattaaCGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTa > 1:3066024/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCTCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCt > 1:750834/1‑150 (MQ=255) aCGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCtt < 1:3352803/150‑1 (MQ=255) cgcgcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTg > 2:1167371/1‑150 (MQ=255) cgcgcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTg < 2:2715559/150‑1 (MQ=255) cgcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAGTATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCt < 2:2089966/150‑1 (MQ=255) cgcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCt < 2:3805438/150‑1 (MQ=255) cgcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCt < 2:1790041/150‑1 (MQ=255) gcgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTg < 1:1207762/150‑1 (MQ=255) cgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGa < 2:2888492/150‑1 (MQ=255) cgAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGa < 1:814240/150‑1 (MQ=255) gAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGAt < 2:236744/150‑1 (MQ=255) aaTATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATc > 2:3084095/1‑150 (MQ=255) atatTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATcc > 2:889593/1‑150 (MQ=255) tatTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATccc < 1:2505632/150‑1 (MQ=255) tatTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATccc < 1:1027790/150‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCcgcg < 1:34307/150‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCcgcg < 1:3012199/150‑1 (MQ=255) gagTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAAc > 1:598189/1‑150 (MQ=255) gagTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAAc < 2:1089838/150‑1 (MQ=255) gTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGc > 1:2162397/1‑150 (MQ=255) tGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCtt > 2:804669/1‑150 (MQ=255) tGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCtt < 2:128192/150‑1 (MQ=255) tGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCtt > 1:1214328/1‑150 (MQ=255) tGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAAGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCtt > 1:3453500/1‑150 (MQ=255) aaaaCAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTg > 2:462462/1‑150 (MQ=255) aaaCAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGc > 2:581188/1‑150 (MQ=255) gAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAg > 1:950917/1‑150 (MQ=255) ttttAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGtt > 1:3566158/1‑150 (MQ=255) ttAACCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTgg < 1:2943222/150‑1 (MQ=255) aaCCTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCa < 1:1527734/150‑1 (MQ=255) aCCTGAGATTGATAAA‑ATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAAc < 2:613170/150‑1 (MQ=255) ccagagaTTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAAc < 2:2520542/147‑1 (MQ=255) ccTGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAAc > 1:2005118/1‑150 (MQ=255) catGAGATTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAAc < 1:452288/148‑1 (MQ=255) agaTTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACcgac < 1:2586195/150‑1 (MQ=255) gaTTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACcgacg > 2:529080/1‑150 (MQ=255) gaTTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACcgacg < 2:367319/150‑1 (MQ=255) gaTTGTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACcgacg < 2:3577762/150‑1 (MQ=255) gTTAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACCGACGACAg > 2:1537424/1‑150 (MQ=255) ttAAAAATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACCGACGACAGt < 2:596539/150‑1 (MQ=255) aaaaATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACCGACGACAGTcc > 2:1518605/1‑150 (MQ=255) | CTGTACAGATGCAGATGCCACAATGCCCATCACCACTAATGCCAGAGTGCTCTTTTTCATTTTCATTCCTGATTTTAATTAACGCGCGAATATTCAGCGGGAGAGTCCCGTTGAAAACAGGAAAGTTTTTAACCTGAGATTGTTAAAGATATATTACAGATTAATAATATTCTTAAAATGTGGTAATTTATTAAATCTGTAATAAAAGCGTAAACAACTGCCGCTAGGCTTGCTGATCCCGCGCAACAAAACGCCATGCTTTGCTCGCAGATGGTTGGCAACCGACGACAGTCC > CP009273/255752‑256045 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |