Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,587,029:1 | +G | 63.7% | coding (101/699 nt) | ypfH ← | palmitoyl‑CoA esterase activity, uncertain physiological substrate |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,587,029 | 1 | . | G | 63.7% | 745.1 / inf | 306 | coding (101/699 nt) | ypfH | palmitoyl‑CoA esterase activity, uncertain physiological substrate |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (61/50); new base G (105/90); total (166/140) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
GATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAAT > CP009273/2586881‑2587178 | gATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑tttg > 1:3004297/1‑149 (MQ=255) tCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑gcc < 2:3850948/150‑1 (MQ=255) gCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑gcccc > 1:3590661/1‑150 (MQ=255) cATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑tttgacccc > 2:1858522/1‑144 (MQ=255) cATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑gccccc > 2:4700770/1‑149 (MQ=255) aTCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑gccccca > 2:2921819/1‑148 (MQ=255) aTCCACACGCGCCTGGCGAGTATCTTCCGTAAGACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCAt < 2:2260214/150‑1 (MQ=255) tCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCAt > 1:410348/1‑150 (MQ=255) tCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCAtt < 1:1102454/150‑1 (MQ=255) ccACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCAtt < 2:3779853/150‑1 (MQ=255) ccACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCAtt < 1:209845/150‑1 (MQ=255) tcgcgGCTGGCGATGATCTTCCGTAATACCCGGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCTCGCCACCGACACTCACCAACAGCGCATCTGGTAACTGCGTTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGcct < 2:1672923/149‑2 (MQ=255) tGGCGATTATCTTACTTAATACCCTGCTCCGTAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCTCCGACACTCACCACCATCGGATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGtt < 1:2813689/150‑1 (MQ=255) gCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTAt < 2:4394889/150‑1 (MQ=255) gCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATc < 2:2616854/150‑1 (MQ=255) cGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATc > 2:549731/1‑150 (MQ=255) gATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATccc < 2:2567447/150‑1 (MQ=255) aTTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATccc < 1:2031053/150‑1 (MQ=255) tATCTTCCGTAAGACCCGGCACCGCAAACCACCGCCGCCCCGCCGGATTACCGCGCGGCTCCGCGCCACCGACACTCCCCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCg < 2:321198/150‑1 (MQ=255) aTCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGa > 2:2971603/1‑150 (MQ=255) cTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGacac > 2:2214215/1‑150 (MQ=255) ttCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGAcccc > 2:4245887/1‑150 (MQ=255) ccGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCg > 1:4857815/1‑150 (MQ=255) ccGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCg > 1:994672/1‑150 (MQ=255) cGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGt > 1:2307514/1‑150 (MQ=255) cGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTg < 2:1373177/150‑1 (MQ=255) gTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTgg < 2:4482200/150‑1 (MQ=255) aaTACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGa > 1:2662148/1‑150 (MQ=255) aTACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGaa > 1:660189/1‑150 (MQ=255) gCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGt > 2:1381707/1‑150 (MQ=255) gCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGt > 2:4165274/1‑150 (MQ=255) ccGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaac > 2:4755037/1‑150 (MQ=255) ccGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaac < 1:3132144/150‑1 (MQ=255) ccGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGGTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaac > 2:2152303/1‑150 (MQ=255) cGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaacaa > 1:2949955/1‑150 (MQ=255) aaaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaacaac > 1:915845/1‑150 (MQ=255) aaaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACt < 2:2774797/150‑1 (MQ=255) aaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAATGCAGTAACAACt > 1:403837/1‑150 (MQ=255) aaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTg > 1:1526081/1‑150 (MQ=255) aCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGt < 2:337586/150‑1 (MQ=255) aCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGtt > 1:1205174/1‑150 (MQ=255) ccACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGtt < 1:2159094/150‑1 (MQ=255) ccACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGAGGAAAAGCAGTAACAACTGtt > 1:3472329/1‑150 (MQ=255) cACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTg > 1:508780/1‑150 (MQ=255) gCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGt > 1:2628455/1‑150 (MQ=255) gCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACAACGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGt > 2:2867672/1‑150 (MQ=255) gCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGtt > 2:315212/1‑150 (MQ=255) cccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGttt < 2:1972473/150‑1 (MQ=255) cccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGttt < 1:1805998/150‑1 (MQ=255) ccgccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTAt < 2:4658807/150‑1 (MQ=255) cgccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTAt > 1:4648259/1‑150 (MQ=255) cgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCg > 1:1442708/1‑150 (MQ=255) cgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCgg < 1:4189897/150‑1 (MQ=255) gATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCggg > 1:3827666/1‑150 (MQ=255) tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCtt < 2:4681195/150‑1 (MQ=255) tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCtt < 2:4023333/150‑1 (MQ=255) tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCtt < 2:462144/150‑1 (MQ=255) tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCttt < 1:5156889/150‑1 (MQ=255) tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCAACAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCAACCGGGTTATCCCCGACACCGTGTAAAAGCAGTAACAACTGTTCCGCAGCTTTATCCGGGCta > 2:1834719/1‑149 (MQ=255) aCCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCttt > 1:4515585/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaa > 2:711559/1‑150 (MQ=255) cTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaaca > 2:2363982/1‑150 (MQ=255) cGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaacaa > 2:4285470/1‑150 (MQ=255) cGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaacaac > 1:3713412/1‑150 (MQ=255) gcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGt > 1:571179/1‑150 (MQ=255) aCCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCGGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCAt < 2:4234649/150‑1 (MQ=255) aCCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCAt < 2:814068/150‑1 (MQ=255) aCCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCAt < 2:3437463/150‑1 (MQ=255) gACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCAGTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGtt < 2:36033/150‑1 (MQ=255) gACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGttt < 1:2432967/150‑1 (MQ=255) acacTCACCACCAGCGCATCAGGAATCAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGttt < 2:2045958/150‑1 (MQ=255) cTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATg < 2:4992772/150‑1 (MQ=255) tCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATg < 2:2126388/150‑1 (MQ=255) caccacCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGc < 2:3159468/150‑1 (MQ=255) caacaccaGATCATCAGTAAACAGCGGTTCAAACCATTTGCATA‑TTTGCCCCAATTTCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATgg < 2:4529973/147‑1 (MQ=255) caccaGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGa > 1:4425407/1‑150 (MQ=255) caGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGTCACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACt < 2:410355/150‑1 (MQ=255) caGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACt > 2:3901453/1‑150 (MQ=255) gcgcATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTcc < 2:4323435/150‑1 (MQ=255) cgcATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCtt > 1:972445/1‑150 (MQ=255) gcATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCtt < 2:3459090/150‑1 (MQ=255) cATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTa < 1:1157392/150‑1 (MQ=255) aaaCAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATg < 1:4566138/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGt < 2:4963644/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTa < 2:3476059/150‑1 (MQ=255) cGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTa > 2:1283160/1‑150 (MQ=255) ggTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTaa > 2:1629138/1‑150 (MQ=255) ggTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTaa > 1:1068612/1‑150 (MQ=255) gTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAAt < 2:5209096/150‑1 (MQ=255) gCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAAtttt > 2:2497673/1‑150 (MQ=255) aaaCCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTa > 1:3765004/1‑150 (MQ=255) aaaCCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTa > 1:4935339/1‑150 (MQ=255) aaaCCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTAc > 1:702212/1‑150 (MQ=255) aCCAGTTGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTAcg > 1:2325439/1‑150 (MQ=255) tGCCTA‑TTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTg < 1:3304865/150‑1 (MQ=255) tGCCTA‑TTT‑CCCCCAGTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGa < 2:4149937/150‑1 (MQ=255) ccTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGGTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGAGGTCCTTAATTTTACGCCGCTGACt > 2:3979049/1‑150 (MQ=255) tA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTca > 1:1669695/1‑150 (MQ=255) tA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAAATTTACGCCGCTGACTca > 2:1261115/1‑150 (MQ=255) a‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTcac > 1:1309706/1‑150 (MQ=255) | GATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTA‑TTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACTCACAAT > CP009273/2586881‑2587178 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |