| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 376716 = | NA (NA) | 72 (0.240) | 48/278 | NT | 21.2% | intergenic (‑1/‑91) | yaiX/insC1 | pseudogene, interrupted by IS2A, acetyltransferase homolog; nonfunctional; interruped by IS2; putative transferase/IS2 repressor TnpA |
| ? | CP009273 | = 386403 | 267 (0.890) | pseudogene (697/1458 nt) | yaiT | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein | |||||
CTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/376860‑376716‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGTCTCATTTGTGTGCTT < CP009273/386403‑386256 CTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCG > 1:228410/1‑150 TTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTCGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGg > 2:2475465/1‑149 TTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGT > 2:2474669/1‑150 TTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGT > 2:2474725/1‑150 CCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGT > 1:2177070/1‑150 TGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGT > 1:3007441/1‑150 GGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGgt > 2:429561/1‑148 GTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTT < 2:61173/150‑1 GTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTT < 2:61089/150‑1 TACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTC < 1:1731354/150‑1 TACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTC < 1:1731367/150‑1 TACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTC < 1:1731383/150‑1 CTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAG > 1:2803653/1‑150 CTGAGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTACTCCAACGACTAGTCGAAAAACTATTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAG < 2:4076380/150‑1 CGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTAT > 1:2346658/1‑150 TTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTA < 1:1598860/150‑1 TCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTT < 1:2958856/150‑1 GCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGA > 1:2335798/1‑150 AAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATG < 1:401549/150‑1 GACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCA < 1:3361168/150‑1 GACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCA > 1:1935462/1‑150 AATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCT > 2:3925508/1‑150 AATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTGGAGATAATGCAATACCT > 1:3636433/1‑150 ATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTG > 1:485635/1‑150 ATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTG > 1:3118787/1‑150 CTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTGGAGATAATGCAATACCTGCAACG > 1:1695514/1‑150 CTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTGGAGATAATGCAATACCTGCAACG > 1:1695538/1‑150 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCG > 2:4326215/1‑150 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCG > 2:4961438/1‑150 CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGA < 1:3907375/150‑1 CCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGT < 2:4960517/150‑1 TGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATT > 2:5047861/1‑150 TGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATT > 2:5047925/1‑150 ACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGG > 1:5192029/1‑150 ACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTGGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGG > 1:5191417/1‑150 GTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAAT < 2:5207474/150‑1 AAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGAT > 1:2178284/1‑150 AAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCGGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGGGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCGTGAGATAAAGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAAGATTGAT > 1:2178385/1‑150 acgAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGT < 2:4957131/147‑1 ATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTT > 1:9092/1‑150 ATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTT < 1:3387167/150‑1 TAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCT > 1:5097930/1‑150 atACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTAC > 1:3454132/3‑150 GACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACA < 2:204789/150‑1 CTATCACTTTTTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTTCGGTTGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGTGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATC < 2:1306107/150‑1 CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATC < 2:1306320/150‑1 CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATC < 2:1306104/150‑1 ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGCGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACCTCAAGATTAAC > 2:3419383/1‑150 ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAAC > 2:3419323/1‑150 ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAAC > 2:3419382/1‑150 ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAAC > 2:3489656/1‑150 TGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACG < 1:1699600/150‑1 ATTGGTTGTCTGGAGGTTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTT < 1:5080512/150‑1 GGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCAC > 2:3689587/1‑150 TGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGGTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTG < 1:114610/150‑1 GTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGT < 2:2615329/150‑1 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTA < 1:4335589/150‑1 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTA < 1:3875791/150‑1 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTA < 1:3875687/150‑1 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTA < 1:4336194/150‑1 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTA < 1:3281964/150‑1 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTA > 1:5140996/1‑150 CTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTAT < 2:4955722/150‑1 CTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTAT < 2:4955739/150‑1 CTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCGTGAGATAATGCAATACATGCAACGCGGGAGTTAGTGGAAATATTGATGTTTCGTTCTACATCGAGATTTAGAGGACGGCCTTCGCTGGTgt > 2:4820343/1‑148 ttGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATC < 2:1605677/148‑1 GAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAA > 2:2930069/1‑150 GATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAAT < 2:997172/150‑1 ATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATG < 2:304949/150‑1 TTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGT < 2:2612294/150‑1 TTCAGGGGGCCAGTATAATTCGGTAGTTTAGGATTAGTTGTAAGTATTACCTTGATATAATTCAATACCTGCAACGCGGTAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGT < 2:3661654/150‑1 CAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGTCT < 1:4805436/150‑1 GGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGTCTCAT < 2:4822774/150‑1 TAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGTCTCATTTGTGTGCTT < 2:485635/150‑1 TAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGTCTCATTTGTGTGCTT < 2:3118787/150‑1 TAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGTCTCATTTGTGTGCTT > 1:2763053/1‑150 CTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/376860‑376716‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGTCTCATTTGTGTGCTT < CP009273/386403‑386256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |