| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 599,256 | C→T | 8.2% | A288A (GCG→GCA) | ybdG ← | mechanosensitive channel protein, miniconductance |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 599,256 | 0 | C | T | 8.2% | 1029.4 / 56.1 | 307 | A288A (GCG→GCA) | ybdG | mechanosensitive channel protein, miniconductance |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (139/142); new base T (11/14); total (151/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
GGTTACGCAGATATTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCAGAGACCAGGTGGGAAT > CP009273/599108‑599405 | gTTACGCAGATATTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATgcgc > 1:1279717/1‑150 (MQ=255) ttACGCAGATATTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCt < 2:96560/150‑1 (MQ=255) aCGCAGATATTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCttt < 1:5135173/150‑1 (MQ=255) gCAGATATTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTAt > 2:2546573/1‑150 (MQ=255) aGATATTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTc < 1:1968322/150‑1 (MQ=255) gATATTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGTCTTTAAAAAATACGCTTTATTCa > 1:3240223/1‑150 (MQ=255) gATATTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCa < 1:3054730/150‑1 (MQ=255) gATATTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCAGTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCa < 1:5232745/150‑1 (MQ=255) atatTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAg < 1:3985897/150‑1 (MQ=255) atatTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAg > 2:2489530/1‑150 (MQ=255) atTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGAc < 2:5035036/150‑1 (MQ=255) atTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGAc > 2:3271571/1‑150 (MQ=255) atTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGAc < 2:1448209/150‑1 (MQ=255) gTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTg < 1:2957353/150‑1 (MQ=255) gATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCAttt > 2:236230/1‑150 (MQ=255) ggCTCGAACTGTTCCAATTTTGGTCATTCGGCGCTGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCTCTCATTAATTTCCTGATGGCTGCTGGTTAAATAAGGCTTTATCAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTc < 1:2837710/150‑1 (MQ=255) ggCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTc < 2:620653/150‑1 (MQ=255) gAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGTGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTtcat > 1:4460122/1‑150 (MQ=255) gTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGa > 2:837409/1‑150 (MQ=255) ttCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGCCTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGTGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGaa < 1:2032593/150‑1 (MQ=255) tCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGaaa < 1:2193477/150‑1 (MQ=255) tCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGaaa < 2:3729474/150‑1 (MQ=255) ccAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGaaaa < 2:4770254/150‑1 (MQ=255) cAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGGAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAAc < 2:3539584/150‑1 (MQ=255) aaTATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACg > 1:110620/1‑150 (MQ=255) atatTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTATCAAATGCGCTTTATTCAGACTTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGa > 2:882476/1‑150 (MQ=255) tatTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGaa > 1:1181231/1‑150 (MQ=255) tGGTCAGTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATAc < 1:1162816/150‑1 (MQ=255) cATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGt < 1:245005/150‑1 (MQ=255) cATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGt < 1:1259152/150‑1 (MQ=255) aTTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTg < 2:307460/150‑1 (MQ=255) aTTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTg > 2:4371650/1‑150 (MQ=255) ttCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGTGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGa < 2:2051292/150‑1 (MQ=255) cGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACa > 1:756175/1‑150 (MQ=255) cGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACa < 1:1828091/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACAt > 2:187680/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACAt < 2:1585118/150‑1 (MQ=255) gcgcAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATc > 2:215186/1‑150 (MQ=255) aTTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGTGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAatact < 2:4556886/150‑1 (MQ=255) aTTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGTGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAataat < 1:932383/150‑3 (MQ=255) aTTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAatact < 1:3329353/150‑1 (MQ=255) tttAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAatactg > 1:2789324/1‑150 (MQ=255) ttAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCTATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAatactga < 2:3381070/150‑1 (MQ=255) ttAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAatactga < 2:4963792/150‑1 (MQ=255) aaTACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAatactgata > 1:1017324/1‑150 (MQ=255) aTACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAatactgatac < 2:129562/150‑1 (MQ=255) ccGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTgc > 2:2095887/1‑150 (MQ=255) gACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTgcgc > 1:2586212/1‑150 (MQ=255) cTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCtt > 1:4324917/1‑150 (MQ=255) tCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTa > 2:2582469/1‑150 (MQ=255) cGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAAt < 2:3877793/150‑1 (MQ=255) cGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAAt < 2:2557531/150‑1 (MQ=255) tAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATAc < 2:3781446/150‑1 (MQ=255) tAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATAc > 1:1516066/1‑150 (MQ=255) tAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATAc > 2:1563312/1‑150 (MQ=255) aGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACg > 1:531807/1‑150 (MQ=255) aGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACg > 1:4363915/1‑150 (MQ=255) aCCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTcg < 2:4085469/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTcgcc < 1:3393767/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTcgcccgcc < 1:4679861/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGATTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTcgcccgcc > 2:1652624/1‑150 (MQ=255) cGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGAt > 1:3411621/1‑150 (MQ=255) gATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATg > 2:3899436/1‑150 (MQ=255) gATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATg < 1:2375023/150‑1 (MQ=255) ttCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCt < 2:1160870/150‑1 (MQ=255) ccACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGTGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGa > 2:3786613/1‑150 (MQ=255) ccACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGa < 2:1341095/150‑1 (MQ=255) cACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGAc > 1:1797320/1‑150 (MQ=255) cACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGAc > 1:4587936/1‑150 (MQ=255) aCTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGTGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACa > 2:2825041/1‑150 (MQ=255) aCTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACa < 1:2048852/150‑1 (MQ=255) aCTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACa > 2:3981071/1‑150 (MQ=255) cATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATcc < 2:5103014/150‑1 (MQ=255) aTTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATccc > 2:253053/1‑150 (MQ=255) tCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAg < 1:3581839/150‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGtt < 1:4859009/150‑1 (MQ=255) cTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGtt > 2:1959839/1‑150 (MQ=255) tGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGTGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGttt < 2:763227/150‑1 (MQ=255) tGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGttt < 2:3845471/150‑1 (MQ=255) gcggcTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTaaa > 1:1984557/1‑150 (MQ=255) cggcTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAg < 2:3052116/150‑1 (MQ=255) cggcTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAg < 1:3913985/150‑1 (MQ=255) ggcTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTATTAAAgg > 2:4458284/1‑150 (MQ=255) gcTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGa > 2:1100460/1‑150 (MQ=255) tGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGt > 1:3085126/1‑150 (MQ=255) tGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGt > 2:252681/1‑150 (MQ=255) ggTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCACACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAAAACTGGTGACATCAAAACTGATACTGCGCTTAATAAGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTc > 1:4600763/1‑150 (MQ=255) aTAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAATCGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGaaaa > 2:2627848/1‑149 (MQ=255) aTAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAAc > 1:2578216/1‑150 (MQ=255) aTAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAAc > 2:2952885/1‑150 (MQ=255) aTAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAAc > 2:1375428/1‑150 (MQ=255) aaGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCa > 1:3717825/1‑150 (MQ=255) aGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCag > 1:1660196/1‑150 (MQ=255) aGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCag > 1:4268651/1‑150 (MQ=255) cTTTAACAAATGTGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCAgaga > 1:1930647/1‑150 (MQ=255) tttAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCAGAGAc > 1:1630890/1‑150 (MQ=255) aTGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCAGAGACCAGGTggg < 2:4175408/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCAGAGACCAGGTggg < 1:592886/150‑1 (MQ=255) cgcTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCAGAGACCAGGTGGGAAt < 1:2269812/150‑1 (MQ=255) cgcTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCAGAGACCAGGTGGGAAt < 2:1017324/150‑1 (MQ=255) | GGTTACGCAGATATTCGTTCAGATAGGCACGAAAGGTTCCAATATTGGTCATTCGGCGCAGATTTAATACCGACTCCGTAGAACCTTGCTGGCGATTCCACTCATTAATTTCCTGATGGCGGCTGGTTAAATAAGGCTTTAACAAATGCGCTTTATTCAGACGTTGCATTTCGTCTTCATCAAGAAAACGAATACTGGTGACATCAATACTGATACTGCGCTTAATACGTCGCCCGCCAGATGCTGACATCCCGCTCCAGTTTTTAAAGGAGTCAGAAACCAGAGACCAGGTGGGAAT > CP009273/599108‑599405 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |