| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,197,734 | 0 | C | T | 9.1% | 869.6 / 54.9 | 264 | R219K (AGA→AAA) | cohE | e14 prophage; repressor protein phage e14 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (109/131); new base T (12/12); total (121/143) | |||||||||||
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Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
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cttcttGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCACCTGTa > 1:4928573/1‑150 (MQ=255) cttcttGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCACCTGTa > 1:1196908/1‑150 (MQ=255) | TTCGTACGTACCGGGCGGGCTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCACCTGTA > CP009273/1197585‑1197883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |