| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,216,183 | C→A | 8.0% | pseudogene (1127/2648 nt) | ycgH → | pseudogene; putative ATP‑binding component of a transport system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,216,183 | 0 | C | A | 8.0% | 1250.8 / 58.1 | 349 | pseudogene (1127/2648 nt) | ycgH | pseudogene; putative ATP‑binding component of a transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (153/167); new base A (12/17); total (165/184) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.64e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |