| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,513,440 | T→A | 7.6% | Y53N (TAT→AAT) | curA → | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,513,440 | 0 | T | A | 7.6% | 1070.2 / 58.0 | 310 | Y53N (TAT→AAT) | curA | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (139/147); new base A (13/11); total (152/158) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
AACAAAAGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGG > CP009273/1513291‑1513589 | aaaaGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGtata > 1:55463/1‑150 (MQ=255) aaaaGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGtata > 1:2221118/1‑150 (MQ=255) aaaGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTatat < 2:837767/150‑1 (MQ=255) gcagcGTATTCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCTCCTGTTCCGGAGTATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCTCACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCg < 1:1299362/150‑1 (MQ=255) cagcGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGt > 1:4084676/1‑150 (MQ=255) agcGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTg < 2:6524/150‑1 (MQ=255) agcGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTg < 2:5210514/150‑1 (MQ=255) agcGTAATCGACGGTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGACTTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTg > 2:217319/1‑150 (MQ=255) gcGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTgg < 2:1132474/150‑1 (MQ=255) cGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTGTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGa > 2:5108556/1‑150 (MQ=255) gTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGAc < 2:2376626/150‑1 (MQ=255) tAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACg < 1:3636656/150‑1 (MQ=255) aaTCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGt > 2:1386984/1‑150 (MQ=255) cGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATg < 1:2486909/150‑1 (MQ=255) cGACGTTGGGTTCTGGCCGCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATg < 2:3208827/150‑1 (MQ=255) gACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGa < 1:2866933/150‑1 (MQ=255) ctttGGGTTCTGGCCTCGAGTCCACATGGCTCACCTGTTCCGTAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATTATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGTTTTTACTGCGCACAGTTTATTTTTCCCTGGAACCTTATATGCGTGGACGTATGatc < 2:1544595/148‑3 (MQ=255) tGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGAATATGCGTGGACGTATGAGCGAt > 1:3811450/1‑150 (MQ=255) gggTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATg < 2:532743/150‑1 (MQ=255) ggTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGa < 1:4817025/150‑1 (MQ=255) ggTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGa > 1:3282499/1‑150 (MQ=255) gTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAg > 2:3330199/1‑150 (MQ=255) gTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAg > 1:1555948/1‑150 (MQ=255) tCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGcc < 2:2561183/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCa < 1:969407/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCa > 2:3937141/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGAATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCa > 1:583099/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGAATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCa > 1:580123/1‑150 (MQ=255) cTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGTACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTa > 1:314896/1‑150 (MQ=255) tCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTAt < 2:5235062/150‑1 (MQ=255) tCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTAt < 2:3928922/150‑1 (MQ=255) cgcgTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTAtt > 2:197275/1‑150 (MQ=255) cgTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCa > 1:377962/1‑150 (MQ=255) gTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCAc > 2:2346403/1‑150 (MQ=255) gTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCAc > 1:5063789/1‑150 (MQ=255) caTGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCt < 2:2501922/150‑1 (MQ=255) caTGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCt > 2:311080/1‑150 (MQ=255) caTGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCt < 1:1910876/150‑1 (MQ=255) ggCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATCAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGtt < 2:1369273/150‑1 (MQ=255) gcgcACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTg < 1:130680/150‑1 (MQ=255) ggAGCATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGGCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGt < 2:5099457/150‑1 (MQ=255) agaATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGa < 2:4567389/150‑1 (MQ=255) gaATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGAt > 1:4771012/1‑150 (MQ=255) gaATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGAATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGAt < 2:3151107/150‑1 (MQ=255) cagttCCGTCTTGAAGCAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGAACCGTATATGCGTGGACGTAGGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATg < 2:4858466/147‑1 (MQ=255) aTTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATgg < 2:4154214/150‑1 (MQ=255) aTTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATgg > 1:4496019/1‑150 (MQ=255) ttGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTa > 1:2913598/1‑150 (MQ=255) tGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTAc > 1:1684155/1‑150 (MQ=255) gaagaaGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACg < 1:2181729/150‑1 (MQ=255) agaagaTGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGt > 2:4000400/1‑150 (MQ=255) gaagaTGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGATCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGAGTCGGGATGGTCGGCGGTACGGTg > 2:2713605/1‑150 (MQ=255) aagaTGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACCGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATCTTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGa > 1:2812481/1‑150 (MQ=255) agaTGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGGCAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAg < 2:2851565/150‑1 (MQ=255) gatgatGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGc > 2:4924987/1‑150 (MQ=255) gatgatGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGc < 1:2202602/150‑1 (MQ=255) tgatgTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGGTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCg < 2:1561928/150‑1 (MQ=255) gatgTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGAATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCgt < 2:4591351/150‑1 (MQ=255) tgTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCgtgt < 2:760135/150‑1 (MQ=255) tCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCg < 1:3339964/150‑1 (MQ=255) cGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGt < 2:1884568/150‑1 (MQ=255) gCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTg > 1:1705859/1‑150 (MQ=255) ccACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTgg > 1:1204545/1‑150 (MQ=255) ccACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTgg > 2:5153646/1‑150 (MQ=255) acacCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAg < 2:129635/150‑1 (MQ=255) acacCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAg < 2:4270447/150‑1 (MQ=255) acacCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAg > 2:4247590/1‑150 (MQ=255) acacCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGAATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAg < 2:4784638/150‑1 (MQ=255) cacCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGt < 1:4987747/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCg < 1:2166304/150‑1 (MQ=255) ggTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAat < 1:3586781/150‑1 (MQ=255) gACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTg > 2:3871772/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGAtt < 2:2079525/150‑1 (MQ=255) aGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGAATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGAtt > 1:3094197/1‑150 (MQ=255) gtgtTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTAt > 1:3006876/1‑150 (MQ=255) gtgtTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTAt > 1:368891/1‑150 (MQ=255) tgtTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATc > 2:2651633/1‑150 (MQ=255) accgcgcACAGATCCATTGTCCCCGGACCCGTAGATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATAGTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGGGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTc < 2:2804026/147‑1 (MQ=255) aCTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTc > 1:1077317/1‑150 (MQ=255) cTGCGCACAGTTTTTTTGTCCATGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCTTCTTTTTCTCCGCGTGTTGTTATTGGCGGCGTGATGGTCTTCTGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCTTCCTGTTTATCAGTCt < 2:297728/150‑1 (MQ=255) cTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGAATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCt < 1:339421/150‑1 (MQ=255) cgcACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGc > 1:4678977/1‑150 (MQ=255) cacaGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGa < 2:3496211/150‑1 (MQ=255) aGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTg < 1:866498/150‑1 (MQ=255) tttATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTggg < 2:781592/150‑1 (MQ=255) ttATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGt > 1:41356/1‑150 (MQ=255) ttATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGt > 2:2627018/1‑150 (MQ=255) tttGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCt < 1:1740801/150‑1 (MQ=255) ttGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTg > 2:4815567/1‑150 (MQ=255) tCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGc < 2:3282499/150‑1 (MQ=255) tGGACCCGTATCTGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGAGATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTCGCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTCCa > 2:3676256/1‑150 (MQ=255) tGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACa > 1:1020243/1‑150 (MQ=255) tGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACa > 2:2289315/1‑150 (MQ=255) ggACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAg < 1:4332123/150‑1 (MQ=255) aCCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTg < 1:4898470/150‑1 (MQ=255) cccGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTgg > 1:5352/1‑150 (MQ=255) ccGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGa > 2:4847936/1‑150 (MQ=255) cGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGAt > 1:2753593/1‑150 (MQ=255) gTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATg > 2:3826849/1‑150 (MQ=255) tataTGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATgg > 1:5132464/1‑150 (MQ=255) | AACAAAAGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGG > CP009273/1513291‑1513589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |