| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,576,869 | G→A | 15.6% | intergenic (‑88/+314) | ydeN ← / ← ydeO | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase/UV‑inducible global regulator, EvgA‑, GadE‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,576,869 | 0 | G | A | 15.6% | 900.8 / 136.2 | 327 | intergenic (‑88/+314) | ydeN/ydeO | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase/UV‑inducible global regulator, EvgA‑, GadE‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (128/148); new base A (28/23); total (156/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
CCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTGAG > CP009273/1576720‑1577018 | ccAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAagag < 1:485341/150‑1 (MQ=255) aGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAAGTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGAt < 2:4856481/150‑1 (MQ=255) gATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATa < 2:3705340/150‑1 (MQ=255) gATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATa < 2:2469588/150‑1 (MQ=255) tGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGc < 1:2842803/150‑1 (MQ=255) tGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGc < 1:89772/150‑1 (MQ=255) tGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGc < 2:1185550/150‑1 (MQ=255) gTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGAtt > 2:3697657/1‑150 (MQ=255) tATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGAttt < 1:947614/150‑1 (MQ=255) tATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGAttt < 1:864362/150‑1 (MQ=255) aTCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTa < 2:5167689/150‑1 (MQ=255) tCAAAGATATCGAGGTACTTACTACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACTAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAg < 1:5037066/150‑1 (MQ=255) aaaGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGTAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCt < 1:3799424/150‑1 (MQ=255) aaaGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCt > 2:591768/1‑150 (MQ=255) aaGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTa < 2:240495/150‑1 (MQ=255) aaGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTa < 1:4298594/150‑1 (MQ=255) aGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGAATTAGCTaa > 2:4953921/1‑150 (MQ=255) tatCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTaaaaa > 1:1322939/1‑150 (MQ=255) atCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTaaaaaa > 2:3559704/1‑150 (MQ=255) tCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTaaaaaaa > 2:1663288/1‑150 (MQ=255) tCGAGGTACGTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATACATGTTCCTCGTCTTAGTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATCAGTGGATGTACGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTaaaaaaa > 2:399243/1‑150 (MQ=255) aGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAggg < 2:1046232/150‑1 (MQ=255) aGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAggg > 1:3652088/1‑150 (MQ=255) gTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGaa < 2:4168347/150‑1 (MQ=255) aCGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACa < 2:3155866/150‑1 (MQ=255) gACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGt > 1:83043/1‑150 (MQ=255) acacTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTc < 1:343861/150‑1 (MQ=255) cacTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTcc > 1:4352909/1‑150 (MQ=255) cacTTTTCTTTAATGCAGAATTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTcc < 1:467709/150‑1 (MQ=255) acTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCa < 1:341913/150‑1 (MQ=255) acTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCa > 2:1671356/1‑150 (MQ=255) acTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTGATTGTACTTATTTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCTGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAATACAGTCCa > 2:130558/1‑150 (MQ=255) cTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCAt > 1:4172643/1‑150 (MQ=255) ttttCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGATATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATa < 1:3263866/150‑1 (MQ=255) cTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTATCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGc > 2:1141776/1‑150 (MQ=255) tttAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCg < 2:4914157/150‑1 (MQ=255) aaTGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTg < 2:1553558/150‑1 (MQ=255) cAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGATAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACAt > 2:2581524/1‑150 (MQ=255) aGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACAtt > 2:1905496/1‑150 (MQ=255) aCTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTAc < 1:3345878/150‑1 (MQ=255) ttCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACtt < 1:2991387/150‑1 (MQ=255) actGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGtt < 2:4452141/148‑1 (MQ=255) aaTGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGtt < 2:4451934/150‑1 (MQ=255) aaTGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGtt > 1:1741338/1‑150 (MQ=255) aTGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTc > 1:4803872/1‑150 (MQ=255) aTGGTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTc < 2:1521415/150‑1 (MQ=255) gTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTa > 1:200861/1‑150 (MQ=255) ttCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTACATAAAGCGTTTACATTACTTTCTGTTCTAt > 2:3284685/1‑150 (MQ=255) cttcttATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGt > 2:2886933/1‑150 (MQ=255) ttcttATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTa > 2:3651421/1‑150 (MQ=255) tATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAAttt < 1:1001609/150‑1 (MQ=255) tACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTATGTTCTATTAAGTAATTTCTCGc > 2:2288739/1‑150 (MQ=255) cTTAATTCCACAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCg < 2:2249524/150‑1 (MQ=255) cTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCg > 2:1445994/1‑150 (MQ=255) cTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCg > 1:1616198/1‑150 (MQ=255) tAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGAt > 2:4324820/1‑150 (MQ=255) tAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTAAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTAGCAAAAAAAAGGGAAAAAACAGACCATAAAGCGTTGACATTACATTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGaa > 1:428329/1‑149 (MQ=255) aaTTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATa < 1:2331510/150‑1 (MQ=255) aTTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATaa > 1:1163179/1‑150 (MQ=255) ttCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATaaa > 1:5162857/1‑150 (MQ=255) tCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAaac < 2:2130396/150‑1 (MQ=255) aaGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGTATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGTGAAAAAACAGTCAATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAATTAATTTCTCGCCGATAAACAACt < 1:4878302/150‑1 (MQ=255) aGTAATTTTTCGAAGTGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTTGTCACATAATGAGTTAGCAGTTTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACACCTa < 1:1554136/150‑1 (MQ=255) aGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTa > 1:2114559/1‑150 (MQ=255) tttACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTAt < 2:4500912/150‑1 (MQ=255) tACGAAGATAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTg < 2:3435997/150‑1 (MQ=255) tACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTg > 2:1997466/1‑150 (MQ=255) tACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTg < 1:66697/150‑1 (MQ=255) tACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTg < 1:2719033/150‑1 (MQ=255) aCGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTCAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTATCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCTCCGATAAACAACTAATTAATTGa > 1:3980571/1‑150 (MQ=255) cGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGat < 1:2523485/150‑1 (MQ=255) gAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGata < 2:842851/150‑1 (MQ=255) gAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGata < 2:1858072/150‑1 (MQ=255) gAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCAAATAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGata < 1:3691656/150‑1 (MQ=255) gagaAATATGTGGATGTAAGTGTAGTTAGTATCATATAGAGAGAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAATAACAGTCCATAAAGCGTTGAAATTACTTTCTGTTCTTTTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATAttt < 1:45331/150‑1 (MQ=255) gagaAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATAttt > 2:4389427/1‑150 (MQ=255) gagaAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATAttt < 1:45615/150‑1 (MQ=255) aaaTAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTaaat > 2:5103454/1‑150 (MQ=255) aaTAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTtaata < 1:239760/150‑1 (MQ=255) aaTAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTtaata < 1:239981/150‑1 (MQ=255) aaGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAat > 2:314151/1‑150 (MQ=255) aaGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAat > 1:1422126/1‑150 (MQ=255) aaGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAat > 2:2064384/1‑150 (MQ=255) aaGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAat > 2:2077550/1‑150 (MQ=255) aGTGGCTGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATGTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGACCATAAAGCGTTGACATTAATTACTGTTCTATTAAGTAAATTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTaattaatt > 2:2821411/1‑150 (MQ=255) gATGTAAGTTAAGTTAGTCTCTTTAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAACAACAGTCCATAAAGCTTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATTAACTACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTg < 1:3035756/150‑1 (MQ=255) aTGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGc > 1:3289970/1‑150 (MQ=255) tAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCAtt < 1:111615/150‑1 (MQ=255) aaGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCAttt > 1:3191304/1‑150 (MQ=255) gAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACt < 2:4516371/150‑1 (MQ=255) gAAGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTaat > 2:2550105/1‑148 (MQ=255) aGTTAGTCACATAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGa > 1:533185/1‑150 (MQ=255) gTCACATAAAGAGATAGCAGATTGAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACaaaa < 2:4675533/150‑1 (MQ=255) cacaTAAAGAAATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATg < 2:3004992/150‑1 (MQ=255) aTAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAg < 2:3905955/150‑1 (MQ=255) aTAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTCTTCTATTAAGTAAATTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTAAATAAATTCTTTCATTTTACTTACAATATACAg > 2:4089641/1‑150 (MQ=255) aaGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTTCATTTTACTGACAAAATTCAGAAt > 1:1941752/1‑150 (MQ=255) aaGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAAt > 2:643539/1‑150 (MQ=255) gagaTAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTg > 1:3472277/1‑150 (MQ=255) gagaTAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTg > 1:4036500/1‑150 (MQ=255) | CCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTGAG > CP009273/1576720‑1577018 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |