Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,822,626 | A→C | 5.7% | W456G (TGG→GGG) | astD ← | succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,822,626 | 0 | A | C | 5.7% | 803.2 / 29.3 | 238 | W456G (TGG→GGG) | astD | succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (117/106); new base C (8/6); total (125/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.89e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
GCCCTACCAGCCCGTCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAC > CP009273/1822477‑1822775 | gCCCTACCAGCCCGTCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCa < 2:3895618/150‑1 (MQ=255) gCCCTACCAGCCCGTCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCa < 2:1279690/150‑1 (MQ=255) cccTACCAGCCCGTCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAg < 2:2630258/150‑1 (MQ=255) cAGCCCGTCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTg > 2:855901/1‑150 (MQ=255) ccGTCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGc < 1:2143556/150‑1 (MQ=255) tCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCCTCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGAt < 1:1183762/150‑1 (MQ=255) tCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCCGGCGCTGGGGCGAt > 1:3947586/1‑150 (MQ=255) tCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGAt > 1:955352/1‑150 (MQ=255) tCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGAt > 1:64497/1‑150 (MQ=255) cGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATg < 1:4570892/150‑1 (MQ=255) cGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATg < 1:4385075/150‑1 (MQ=255) aaTTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGtt < 2:3023076/150‑1 (MQ=255) aaTTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGtt > 1:1560958/1‑150 (MQ=255) gACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCg < 1:3801277/150‑1 (MQ=255) gACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGACAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCg > 1:271504/1‑150 (MQ=255) cccAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGc > 2:3167521/1‑150 (MQ=255) cccAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGc < 2:511939/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCa > 1:849777/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCAcc > 1:2950561/1‑150 (MQ=255) cGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAAt > 2:4524469/1‑150 (MQ=255) cGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAAt > 1:4631933/1‑150 (MQ=255) gTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCCGGCGCTGGGGCGATGGTAACCGGAAGCACCAATg < 1:669660/150‑1 (MQ=255) gTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATg > 2:653175/1‑150 (MQ=255) ttCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATgc < 2:4026699/150‑1 (MQ=255) tCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCACTGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATgcc > 1:2693582/1‑150 (MQ=255) cATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCACTGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATgccg > 1:3513957/1‑150 (MQ=255) gCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGa < 1:4018054/150‑1 (MQ=255) ccaccTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATg < 2:1870096/150‑1 (MQ=255) accTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGgc > 1:183999/1‑150 (MQ=255) ccTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGgcg > 2:1347210/1‑150 (MQ=255) tCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGcgcg > 1:1673140/1‑150 (MQ=255) ggAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACt > 2:3938551/1‑150 (MQ=255) gAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCa < 2:3360996/123‑1 (MQ=255) gAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTg < 1:1257135/150‑1 (MQ=255) aaTCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGgcag > 2:4376705/1‑150 (MQ=255) tCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGgcagca < 1:5101836/150‑1 (MQ=255) cAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGACGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCAcc > 1:3900693/1‑150 (MQ=255) cAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCAcc > 2:2161182/1‑150 (MQ=255) atcccGGGGTTAAGCGTGGAGGGCAATGTGACAGAGTCCGTCTCCATGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCTGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCg < 2:5037428/148‑1 (MQ=255) cccGGGGTTAAGCTTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCAGCGGCATACCATGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAAAGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGt > 1:4219625/1‑150 (MQ=255) cccGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGt < 2:3756091/150‑1 (MQ=255) ccGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTa > 1:1948057/1‑150 (MQ=255) ccGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTa < 2:640185/150‑1 (MQ=255) cGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTaa < 2:1585705/150‑1 (MQ=255) cGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTaa < 2:4207075/150‑1 (MQ=255) ggTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCg > 2:3590128/1‑150 (MQ=255) ggTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCg < 1:3019162/150‑1 (MQ=255) ggTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCg > 2:2021248/1‑150 (MQ=255) ggTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCg < 1:2007679/150‑1 (MQ=255) ttAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGt > 1:3558116/1‑150 (MQ=255) ntAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGt > 2:1110750/2‑150 (MQ=255) aaGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGttt < 2:5240205/150‑1 (MQ=255) aaGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGttt > 1:2367813/1‑150 (MQ=255) aaGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGttt < 2:1360460/150‑1 (MQ=255) cGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCACTGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGtt < 1:2120466/150‑1 (MQ=255) cGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGtt < 2:2907291/150‑1 (MQ=255) cGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGtt > 1:2533257/1‑150 (MQ=255) gTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTc > 1:1008158/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTcc < 2:4658405/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCCGGCGCTGGGGCGATGGTAACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCa > 2:2853212/1‑150 (MQ=255) cGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGt > 1:3466719/1‑150 (MQ=255) ggCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTa > 1:2880100/1‑150 (MQ=255) cAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAAc < 2:1707897/150‑1 (MQ=255) cAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAAc < 2:3294434/150‑1 (MQ=255) tgatAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAAt < 2:5187656/147‑1 (MQ=255) tGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAAt < 1:462470/150‑1 (MQ=255) gTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATc < 2:4772865/150‑1 (MQ=255) gTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATc > 1:4937066/1‑150 (MQ=255) ttAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATcc > 1:520316/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATcccc > 1:5042560/1‑150 (MQ=255) aCGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCcccg > 1:2310912/1‑150 (MQ=255) aGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCcccgccc > 1:749020/1‑150 (MQ=255) gTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCcccgcccg > 1:2338029/1‑150 (MQ=255) gTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCcccgcccg < 2:563151/150‑1 (MQ=255) ccGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCcgcg < 2:101972/150‑1 (MQ=255) cGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCgagc > 2:3115917/1‑150 (MQ=255) aCTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCt > 1:3566650/1‑150 (MQ=255) cTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCCGGCGCTGGGGCGATGGTAACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTc > 1:337097/1‑150 (MQ=255) cTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTc < 1:5159640/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCa > 1:298106/1‑150 (MQ=255) cAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAg > 2:3509165/1‑150 (MQ=255) cAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAg < 1:4917129/150‑1 (MQ=255) aGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGc > 2:502116/1‑150 (MQ=255) cATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTg > 2:1980525/1‑150 (MQ=255) tCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGAt < 1:1118432/150‑1 (MQ=255) tCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGAt > 1:1353845/1‑150 (MQ=255) cGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATc < 2:1466507/150‑1 (MQ=255) ggCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCg < 1:50094/150‑1 (MQ=255) gcgcAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACttt < 2:2364506/150‑1 (MQ=255) cgcAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACtttt < 2:304410/150‑1 (MQ=255) cAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc < 2:2943043/150‑1 (MQ=255) cAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc < 1:2714730/150‑1 (MQ=255) cAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc > 1:3145541/1‑150 (MQ=255) aGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTccc < 1:3259510/150‑1 (MQ=255) aTCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTc > 1:1473224/1‑150 (MQ=255) cGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCggggg > 2:4722593/1‑150 (MQ=255) cGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCggggg > 1:3075399/1‑150 (MQ=255) ggCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGa < 2:748100/150‑1 (MQ=255) aCCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGACCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa < 1:1197404/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAc > 2:3433977/1‑150 (MQ=255) | GCCCTACCAGCCCGTCGAAATTGACTTCCCAGGCGTTCATCGCACCACCTCATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGGCTCGCCATCGGCCATGCGCAGTAATCTGCGGCATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAC > CP009273/1822477‑1822775 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |