| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 153,472 | G→T | 48.7% | intergenic (‑102/+268) | yadN ← / ← folK | putative fimbrial‑like adhesin protein/2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 153,472 | 0 | G | T | 48.7% | 86.0 / inf | 315 | intergenic (‑102/+268) | yadN/folK | putative fimbrial‑like adhesin protein/2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (96/65); new base T (86/67); total (182/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
CATCGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATT > CP009273/153323‑153619 | cATCGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATg < 2:3422228/150‑1 (MQ=255) aTCGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAATAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGa > 1:30762/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGa > 1:2264151/1‑150 (MQ=255) cAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATAttt > 2:5216826/1‑150 (MQ=255) aGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTg < 1:3944450/150‑1 (MQ=255) cATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGtt < 1:265022/150‑1 (MQ=255) aTAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTa < 2:1828884/150‑1 (MQ=255) aaGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTAcc < 2:1123375/150‑1 (MQ=255) gACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCa > 2:3470465/1‑150 (MQ=255) ccAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCaaa < 2:1213869/150‑1 (MQ=255) cAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGGTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAt > 2:3100230/1‑150 (MQ=255) gACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTAGCCAAAttt > 2:4214838/1‑150 (MQ=255) aCAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTa < 1:1549692/150‑1 (MQ=255) aCAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTa < 1:1354146/150‑1 (MQ=255) gtgCAAAACCTAAATTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACaa < 2:278243/148‑1 (MQ=255) gCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAAcc > 2:1720071/1‑150 (MQ=255) gCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAAcc < 2:2527780/150‑1 (MQ=255) aaaaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAAAGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTGGTTACCCAAATTTACAACCAt > 1:3040288/1‑150 (MQ=255) aCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGt < 1:2483170/150‑1 (MQ=255) ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGtt > 2:3885529/1‑150 (MQ=255) cTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTGATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTc > 2:2610932/1‑150 (MQ=255) aaTTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCAt > 2:3563543/1‑150 (MQ=255) aTTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCAtt > 2:672199/1‑150 (MQ=255) aGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGc < 2:4690943/150‑1 (MQ=255) aCATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCt < 2:4177334/150‑1 (MQ=255) aTAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAt > 1:441072/1‑150 (MQ=255) tAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAtt > 1:1520685/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATtg > 2:3185786/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATtg > 1:1133499/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATtg > 1:4235628/1‑150 (MQ=255) aaaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATtgt < 1:1197886/150‑1 (MQ=255) aaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGc > 1:5151736/1‑150 (MQ=255) aTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCa < 2:3043908/150‑1 (MQ=255) ttAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTa > 2:2397595/1‑150 (MQ=255) aaaaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGc > 1:1310121/1‑150 (MQ=255) aaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCtt < 1:650617/150‑1 (MQ=255) aaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCtt > 1:2544427/1‑150 (MQ=255) aaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTGTATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCtt > 1:4157758/1‑150 (MQ=255) cttCCATGAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCttt < 1:3141771/149‑1 (MQ=255) aTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCttt < 2:806572/150‑1 (MQ=255) tCCATTAGTCAGAATACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATTTTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTg < 2:4938527/150‑1 (MQ=255) ccATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGa > 1:3428761/1‑150 (MQ=255) cATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGaa < 1:3899480/150‑1 (MQ=255) aTTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATTTTAGATATTAATGAGCAAATATATTTTTTACCCAAATTTACAACAATTGTTAAATAGTTCGACTATTGTTAACTATATAAGCTTTTGAAc > 1:2811177/1‑150 (MQ=255) aTTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAAc < 1:3947521/150‑1 (MQ=255) ttAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACa > 1:5199025/1‑150 (MQ=255) ttAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACa < 1:851028/150‑1 (MQ=255) tAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaa > 2:1625581/1‑150 (MQ=255) tAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAAGTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaa > 2:3823545/1‑150 (MQ=255) gTCAGACTACATGTTTGAAGACTGACTATTCATGACACACATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATTCGCAATGATATTTGTTCCACAAATTTACAACCATTGTTCATTATGTCGCCTAGTGTGCCCTTTAGAATCTTTTGAACaaat > 2:846090/1‑150 (MQ=255) gTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaat > 2:5111715/1‑150 (MQ=255) tCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaatt > 1:4473205/1‑150 (MQ=255) gACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaaa < 2:1438660/150‑1 (MQ=255) aCTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaaat > 2:2467492/1‑150 (MQ=255) cTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaaatt > 2:4001481/1‑150 (MQ=255) cTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaaatt < 2:2339149/150‑1 (MQ=255) tACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAAttt > 2:4476068/1‑150 (MQ=255) aCATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTa > 2:703081/1‑150 (MQ=255) aTGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACt < 1:23783/150‑1 (MQ=255) gTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTTATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTa < 2:3227655/150‑1 (MQ=255) gTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTa > 1:9583/1‑150 (MQ=255) gaagaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTc < 2:4275079/150‑1 (MQ=255) aagaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCa > 1:2942644/1‑150 (MQ=255) gaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCaaa > 2:2567033/1‑150 (MQ=255) aaTGAATATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCaaaa < 2:4241451/150‑1 (MQ=255) gACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAACTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTa < 1:2866755/150‑1 (MQ=255) cTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAg > 1:5021389/1‑150 (MQ=255) aTTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTa > 1:3688517/1‑150 (MQ=255) cATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTaaaa < 1:1720071/150‑1 (MQ=255) cATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTaaaa < 1:579134/150‑1 (MQ=255) aTGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTaaaaa > 1:4953508/1‑150 (MQ=255) tGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAAt < 1:2046420/150‑1 (MQ=255) tGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAAt < 1:3320297/150‑1 (MQ=255) caAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGtt < 2:1281387/150‑1 (MQ=255) aaaTAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTc > 2:2912407/1‑150 (MQ=255) aaTAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTca > 1:3853992/1‑150 (MQ=255) gagaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCTTTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGt < 2:2959090/150‑1 (MQ=255) agaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTg > 1:345285/1‑150 (MQ=255) aaaCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCa > 2:4073028/1‑150 (MQ=255) aaaCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCa > 1:323754/1‑150 (MQ=255) aCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTAACCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAAt < 2:2129820/150‑1 (MQ=255) aaaTGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTg < 2:1595377/150‑1 (MQ=255) aaTGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAATTGCAAtttg > 2:47491/1‑148 (MQ=255) aTGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGt < 1:1004916/150‑1 (MQ=255) gTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTa < 1:2845955/150‑1 (MQ=255) tAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAgg < 1:3578791/150‑1 (MQ=255) tAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAgg < 1:4800749/150‑1 (MQ=255) gATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGt < 1:3470465/150‑1 (MQ=255) atTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATg > 1:1835645/1‑150 (MQ=255) atTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATg < 2:1567969/150‑1 (MQ=255) atTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATg > 2:1360525/1‑150 (MQ=255) atTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAATTTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATg > 1:4595784/1‑150 (MQ=255) tAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGga > 1:260718/1‑150 (MQ=255) aaTGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGgag > 2:2177742/1‑150 (MQ=255) aGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATgg > 2:1898312/1‑150 (MQ=255) aGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATgg < 2:1261743/150‑1 (MQ=255) cAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGa < 1:3290311/150‑1 (MQ=255) aaTGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAt < 1:3563543/150‑1 (MQ=255) aTGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACACGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAtt > 2:5049408/1‑150 (MQ=255) aTGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGAtt < 2:3310054/150‑1 (MQ=255) | CATCGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGGATT > CP009273/153323‑153619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |