Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,070,058 | 0 | C | A | 17.4% | 675.4 / 105.3 | 240 | A90A (GCC→GCA) | yeeS | CP4‑44 prophage; putative DNA repair protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (125/72); new base A (25/17); total (151/89) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
CGGGACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTT > CP009273/2069913‑2070207 | cGGGACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTg < 2:1283480/150‑1 (MQ=255) gggACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAAtgctgctgc > 2:4886295/1‑150 (MQ=255) gggACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGc > 2:2589654/1‑150 (MQ=255) 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tAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACCGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCt < 1:2535023/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGa < 1:1574280/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGa < 2:4165661/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGa > 1:3220839/1‑150 (MQ=255) cgcgCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATa < 2:364590/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |