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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,475,283 | 0 | G | T | 10.3% | 732.4 / 10.9 | 262 | P125T (CCA→ACA) | emrY | putative multidrug efflux system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (125/95); new base T (2/39); total (127/135) | |||||||||||
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Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
TATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAAC > CP009273/2475134‑2475431 | tatCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTgg > 2:1786864/1‑150 (MQ=255) atCCAACCCCAGATACAGTTATCACAAAGAGCCCCGCCCTATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATACTGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGa < 2:3243467/150‑1 (MQ=255) aCCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTaa < 2:1056001/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |