| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,767,403 | 0 | G | A | 15.2% | 1016.1 / 146.7 | 364 | D243N (GAT→AAT) | yfjW | CP4‑57 prophage; putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (155/152); new base A (31/24); total (186/178) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |