Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,835,413 | C→A | 17.6% | I355I (ATC→ATA) | ascB → | cryptic 6‑phospho‑beta‑glucosidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,835,413 | 0 | C | A | 17.6% | 955.0 / 152.3 | 332 | I355I (ATC→ATA) | ascB | cryptic 6‑phospho‑beta‑glucosidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (150/123); new base A (25/34); total (175/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.59e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
GTCTCTTTCAGCTATTACGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACATATCCGCGCAATGGGCGA > CP009273/2835264‑2835562 | gTCTCTTTCAGCTATTACGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATc < 2:4405967/150‑1 (MQ=255) gTCTCTTTCAGCTATTACGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATc > 2:3699310/1‑150 (MQ=255) cAGCTATTACGCCTCGCGCGGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGaa < 2:351755/150‑1 (MQ=255) aGCTATTACGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAat > 1:3902219/1‑150 (MQ=255) aGCTATTACGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAat > 1:4928462/1‑150 (MQ=255) cTATTACGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAatat > 1:3602439/1‑150 (MQ=255) cTATTACGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAatat > 2:4085452/1‑150 (MQ=255) cTATTACGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAatat < 1:110112/150‑1 (MQ=255) aTTACGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATatga > 2:174917/1‑150 (MQ=255) aCGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGt > 1:3033304/1‑150 (MQ=255) aCGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCAGGAATATGATGt > 1:2355167/1‑150 (MQ=255) gCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGTGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTAc < 1:2801066/150‑1 (MQ=255) cTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGa < 1:4357626/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCg < 2:5003075/150‑1 (MQ=255) tGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTAt > 1:1872462/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTAt > 2:2937743/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAg > 2:1359602/1‑150 (MQ=255) ggcggAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGcc < 1:840481/150‑1 (MQ=255) ggcggAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGcc > 1:1755716/1‑150 (MQ=255) gagaTGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTg > 1:2151282/1‑150 (MQ=255) agaTGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGt < 2:834883/150‑1 (MQ=255) agaTGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGt > 2:5107023/1‑150 (MQ=255) agaTGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGt < 1:2853266/150‑1 (MQ=255) gaTGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGtt < 1:1709027/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCtg < 1:2982974/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCtg < 1:4587868/150‑1 (MQ=255) cGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCtggt < 1:3110018/150‑1 (MQ=255) cGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCtggt < 1:4338769/150‑1 (MQ=255) cGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCtggt > 1:2294152/1‑150 (MQ=255) cagcagTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACgg > 2:3067378/1‑150 (MQ=255) agcagTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGc > 1:1421936/1‑150 (MQ=255) agcagTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGc > 2:292615/1‑150 (MQ=255) gcagTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGcc < 2:3254634/150‑1 (MQ=255) cagTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGTCTGTGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCt < 2:4332997/150‑1 (MQ=255) agTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTg < 1:3421958/150‑1 (MQ=255) agTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTg > 1:1055479/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTggg > 1:781236/1‑150 (MQ=255) gcggcgAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGACTTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGgc > 2:2460319/1‑150 (MQ=255) gcggcgAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGgc < 1:1666730/150‑1 (MQ=255) ggcgAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGACTGGgcgc > 2:2548600/1‑150 (MQ=255) gcgAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCa < 2:566499/150‑1 (MQ=255) cgAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGACGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCac > 1:3258876/1‑149 (MQ=255) aCGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAg < 2:3581655/150‑1 (MQ=255) aCGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAg < 2:3375298/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGa > 1:4041781/1‑150 (MQ=255) cGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTCGGCGCAAAAGa > 1:5104432/1‑150 (MQ=255) cGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGa < 1:1121034/150‑1 (MQ=255) gtggtgAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGAt < 1:952752/150‑1 (MQ=255) ggtgAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGa > 2:1862936/1‑150 (MQ=255) aaaTCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAAttt > 1:555737/1‑150 (MQ=255) aaTCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTtg > 1:2654783/1‑150 (MQ=255) aaTCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGATATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTtg > 2:1425413/1‑150 (MQ=255) cGCTGCGTTATCCGTATCTACTGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTtgctg < 2:2763240/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTtgctg > 2:3149632/1‑150 (MQ=255) cTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGcc > 2:457091/1‑150 (MQ=255) tGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCa < 2:689431/150‑1 (MQ=255) cGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAAt > 2:4954794/1‑150 (MQ=255) tAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATgg > 1:3641014/1‑150 (MQ=255) aagccGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGGTGGGGAATTGCTCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGAGGTACGATCGTGATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGACTTTGCTGCCAATGGc < 2:1934656/147‑1 (MQ=255) aTCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCg > 1:3455891/1‑150 (MQ=255) tCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCga < 2:1508100/150‑1 (MQ=255) cGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCgaga < 1:2240217/150‑1 (MQ=255) tATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGAtt < 1:3632060/150‑1 (MQ=255) aTCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTa > 2:2164669/1‑150 (MQ=255) aTCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTa < 2:934818/150‑1 (MQ=255) aTCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCAGGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTa > 2:3537694/1‑150 (MQ=255) tCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTaa > 2:1128393/1‑150 (MQ=255) cTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGTAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAac < 2:2585522/150‑1 (MQ=255) cTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAac < 1:3704048/150‑1 (MQ=255) cTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAac < 1:2486167/150‑1 (MQ=255) aGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAacgacg > 1:1531538/1‑150 (MQ=255) aGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAacgacg > 1:1250802/1‑150 (MQ=255) gTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACgacgac < 1:2199560/150‑1 (MQ=255) tGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACt > 2:2370620/1‑150 (MQ=255) aGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTAt < 1:4168279/150‑1 (MQ=255) aGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTAt < 2:4162982/150‑1 (MQ=255) aGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTAt > 2:3935402/1‑150 (MQ=255) gACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGc > 1:3720678/1‑150 (MQ=255) ctggggctggggAATTGATCCACTCGGTCTTCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGATTTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCAt < 1:2039854/150‑1 (MQ=255) ctggggctggggAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCAt < 1:2549398/150‑1 (MQ=255) tggggctggggAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATc < 2:841649/150‑1 (MQ=255) ggggctggggAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCa > 1:4700849/1‑150 (MQ=255) ttgtgatttGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGAAAAAGAAGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTAc < 2:4779067/143‑1 (MQ=255) ggggAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACt > 2:4239209/1‑150 (MQ=255) aaTTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTAcg > 1:597826/1‑150 (MQ=255) aaTTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTAcg > 1:4424846/1‑150 (MQ=255) tGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGa < 2:3853160/150‑1 (MQ=255) aTCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAAc > 1:4081306/1‑150 (MQ=255) aTCCACTCGGTCTGCGTATAACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAAc > 1:3499771/1‑150 (MQ=255) ccACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACat > 1:4729686/1‑150 (MQ=255) ccACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACat < 1:862050/150‑1 (MQ=255) ccACTCGGTCTGCGTATCAACATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACat < 2:3370376/150‑1 (MQ=255) aCTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACatat < 1:4868930/150‑1 (MQ=255) aCTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACatat > 1:1036502/1‑150 (MQ=255) tCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACATATcc < 1:1331206/150‑1 (MQ=255) tCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATCTACGATAGTTATCAGAAGCCGATGTTTCTGGTGGAAAAAGTCCTGGGCGCAAAATATGAATATGCTGCAAATGGCGAGATTAACTACGACTATCGAATCAGATACTTACGAGAACATATca > 2:407219/1‑149 (MQ=255) ggTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACATATCcgc < 1:1986776/150‑1 (MQ=255) cGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACATATCCGCGCAATg > 1:4253288/1‑150 (MQ=255) tATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACATATCCGCGCAATggg > 1:4491477/1‑150 (MQ=255) cACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACATATCCGCGCAATGGGCGa > 1:2453890/1‑150 (MQ=255) | GTCTCTTTCAGCTATTACGCCTCGCGCTGCGCCTCGGCGGAGATGAACGCCAACAACAGCAGTGCGGCGAACGTGGTGAAATCGCTGCGTAATCCGTATCTACAGGTGAGCGACTGGGGCTGGGGAATTGATCCACTCGGTCTGCGTATCACCATGAATATGATGTACGATCGTTATCAGAAGCCGCTGTTTCTGGTGGAAAACGGCCTGGGCGCAAAAGATGAATTTGCTGCCAATGGCGAGATTAACGACGACTATCGCATCAGCTACTTACGCGAACATATCCGCGCAATGGGCGA > CP009273/2835264‑2835562 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |