| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,495,992 | G→A | 8.5% | M98I (ATG→ATA) | frlC → | fructoselysine 3‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,495,992 | 0 | G | A | 8.5% | 1218.2 / 72.3 | 366 | M98I (ATG→ATA) | frlC | fructoselysine 3‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (168/163); new base A (18/13); total (188/178) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 | |||||||||||
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
ATCAAACAAATCAAGGCGCTGGCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCATGGATCTAATCCTC > CP009273/3495843‑3496139 | aTCAAACAAATCAAGGCGCTGGCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATg < 1:5170398/150‑1 (MQ=255) caaacaaaTCAAGGCGCTGGCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGc > 2:380794/1‑150 (MQ=255) caaacaaaTCAAGGCGCTGGCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATAGc < 1:738198/150‑1 (MQ=255) aaacaaaTCAAGGCGCTGGCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCa < 2:751054/150‑1 (MQ=255) aaacaaaTCAAGGCGCTGGCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCa > 1:125893/1‑150 (MQ=255) aaacaaaTCAAGGCGCTGGCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCa < 1:3112536/150‑1 (MQ=255) tCAAGGCGCTGGCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAgaga > 1:1779252/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAAc < 1:1990370/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCggg < 2:1113617/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCggg < 1:4562574/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCggg > 2:3562653/1‑150 (MQ=255) cgcAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGtt > 1:1002061/1‑150 (MQ=255) gcAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTta < 2:4356812/150‑1 (MQ=255) cAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTtat > 1:3931581/1‑150 (MQ=255) aGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTtata < 2:1291521/150‑1 (MQ=255) gACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATAc < 1:2204211/150‑1 (MQ=255) gACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATAc < 1:1278387/150‑1 (MQ=255) cGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGc < 2:2394990/150‑1 (MQ=255) gTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCt > 1:2683560/1‑150 (MQ=255) gTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCt < 2:4939772/150‑1 (MQ=255) gTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATAAGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCACAAGAGAAGAACGCGGGTTATACGCt > 2:3723742/1‑150 (MQ=255) tATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTg > 1:2402141/1‑150 (MQ=255) tATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTg > 1:1335439/1‑150 (MQ=255) aTCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCCGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGa > 2:4481363/1‑150 (MQ=255) atttGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATTATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGAttt < 1:3785853/147‑1 (MQ=255) aGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCACAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGAttt > 2:1150755/1‑150 (MQ=255) aGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGAttt < 1:3938199/150‑1 (MQ=255) aGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGAttt < 1:4816267/150‑1 (MQ=255) gATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATTGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTc < 2:4232660/150‑1 (MQ=255) gATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGc > 1:344016/1‑150 (MQ=255) aTCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCAc > 2:2155361/1‑150 (MQ=255) aTCGGATATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCAc < 2:1946473/150‑1 (MQ=255) tCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGCTGCTGGGCGATGACCATAGGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCAcg < 2:250471/150‑1 (MQ=255) cGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCAcgc > 2:2556275/1‑150 (MQ=255) cTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCggg > 1:3656124/1‑150 (MQ=255) cTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCggg < 1:4708993/150‑1 (MQ=255) cTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCggg > 2:3241284/1‑150 (MQ=255) gCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTAtct > 1:4292372/1‑150 (MQ=255) gCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTAtct < 1:4632582/150‑1 (MQ=255) gCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTAtct > 2:3038170/1‑150 (MQ=255) ccAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTAtctc > 1:4690824/1‑150 (MQ=255) cAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCa > 1:2508206/1‑150 (MQ=255) aGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATAGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCAc > 1:2351437/1‑150 (MQ=255) aaCCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGcc > 2:3954126/1‑150 (MQ=255) aCCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCa < 1:3520168/150‑1 (MQ=255) cGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTaa < 1:4100203/150‑1 (MQ=255) ggCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATAGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAAt > 2:328367/1‑150 (MQ=255) ggCTATACGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCACGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAAt < 2:874413/150‑1 (MQ=255) gCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATg < 1:3587100/150‑1 (MQ=255) gCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATg < 1:2254371/150‑1 (MQ=255) gCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATAGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATg < 1:783123/150‑1 (MQ=255) gCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATAGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATg < 1:4462867/150‑1 (MQ=255) ccGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATc < 1:1607393/150‑1 (MQ=255) cGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCt < 2:1685623/150‑1 (MQ=255) ataACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTggg > 1:2971605/1‑150 (MQ=255) taACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTgggg > 2:5166103/1‑150 (MQ=255) cATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACg < 2:4347732/150‑1 (MQ=255) tgatgCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGc > 1:645813/1‑150 (MQ=255) gatgCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCt < 1:1818132/150‑1 (MQ=255) atgCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTg > 1:5047105/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGc < 2:1885699/150‑1 (MQ=255) tGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCag > 2:2711092/1‑150 (MQ=255) tGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCag > 2:704091/1‑150 (MQ=255) tGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCag > 1:5217292/1‑150 (MQ=255) gggCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGATATCTGGGGACGGCTGGCaga > 2:4745704/1‑150 (MQ=255) cGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGaa > 1:326945/1‑150 (MQ=255) cGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGaa > 1:2075410/1‑150 (MQ=255) gATGAACATAGGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAAc < 2:4883528/150‑1 (MQ=255) gAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTa < 2:2081452/150‑1 (MQ=255) atatGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCg > 2:1625863/1‑150 (MQ=255) atatGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCg > 1:2155892/1‑150 (MQ=255) atatGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCg > 2:4591314/1‑150 (MQ=255) tatGCGTCGCGAAAGCCTCGGCATGATCAAGCTGGCGATGGATATAGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGa > 2:1243622/1‑150 (MQ=255) tatGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGa > 2:5019020/1‑150 (MQ=255) tatGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGa > 1:909285/1‑150 (MQ=255) atGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGaa > 2:469529/1‑150 (MQ=255) atGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATACGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGaa > 2:3504924/1‑150 (MQ=255) tGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAAc < 2:3375804/150‑1 (MQ=255) cGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATTGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACtg < 2:2294137/150‑1 (MQ=255) gcgAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACtgtgtg < 2:1496019/150‑1 (MQ=255) gcgAAAGCCTCGACATGATCAAGATGGCGATGGATATGGCAATAGAGATGAACGCTGGTTATACGATGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTAAATCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGACAtgtggg > 2:2815242/1‑148 (MQ=255) gAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAg < 1:4869225/150‑1 (MQ=255) ccTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAATAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTAcgc > 2:1389196/1‑150 (MQ=255) cTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGGACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTAcgcg > 2:156912/1‑150 (MQ=255) cTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTAcgcg < 1:1195073/150‑1 (MQ=255) gACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGaa > 1:2048888/1‑150 (MQ=255) aTGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAAc > 2:4558333/1‑150 (MQ=255) tGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACa > 2:3214689/1‑150 (MQ=255) gATCAAGCTGGCGATGGATATGTCAAAAGAGATGATCGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAAGTGTGTGAGTACGCGGAAAACAt < 2:4063759/150‑1 (MQ=255) gATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACAt < 1:1035032/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCgg > 2:2889055/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCa > 2:4967661/1‑150 (MQ=255) cTGGCGATGGATATAGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCATg > 2:4433697/1‑150 (MQ=255) gCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCATGGAt < 2:299016/150‑1 (MQ=255) gCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCATGGAt < 1:1724312/150‑1 (MQ=255) ggATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCATGGATCTAAt > 2:3466414/1‑150 (MQ=255) ggATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCATGGATCTAAt > 2:788713/1‑150 (MQ=255) atatGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCATGGATCTAATcc > 1:505657/1‑150 (MQ=255) atatGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCATGGATCTAATcc < 1:4481363/150‑1 (MQ=255) tatGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCATGGATCTAATCCt < 2:2329241/150‑1 (MQ=255) | ATCAAACAAATCAAGGCGCTGGCGCAGACGTATCAGATGCCGATTATCGGCTATACGCCAGAAACCAACGGCTATCCGTATAACATGATGCTGGGCGATGAACATATGCGTCGCGAAAGCCTCGACATGATCAAGCTGGCGATGGATATGGCAAAAGAGATGAACGCGGGTTATACGCTGATTTCCGCGGCCCACGCGGGCTATCTCACGCCACCTAATGTTATCTGGGGACGGCTGGCAGAGAACCTAAGCGAACTGTGTGAGTACGCGGAAAACATCGGCATGGATCTAATCCTC > CP009273/3495843‑3496139 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |