| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,516,949 | 0 | C | A | 8.9% | 1206.8 / 68.5 | 335 | F240L (TTC→TTA) | mrcA | fused penicillin‑binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (137/168); new base A (8/22); total (145/190) | |||||||||||
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Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
CTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCATTTACACCA > CP009273/3516800‑3517097 | gACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGa > 1:4383916/1‑150 (MQ=255) aCGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGAt < 2:536947/150‑1 (MQ=255) aCGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGAt < 2:4058869/150‑1 (MQ=255) 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atatCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACg > 1:1359097/1‑150 (MQ=255) tatCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACgg < 2:1877535/150‑1 (MQ=255) tatCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACgg < 2:3810992/150‑1 (MQ=255) atCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGt > 2:1027010/1‑150 (MQ=255) cccAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATc > 2:4224432/1‑150 (MQ=255) cccAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATc < 1:1961936/150‑1 (MQ=255) ccAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCg < 2:2360471/150‑1 (MQ=255) aacaacAGTTAGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCa > 1:3995212/1‑150 (MQ=255) acaacaGTTAGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCAt > 2:3952421/1‑150 (MQ=255) caacaGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCAtt < 1:1770717/150‑1 (MQ=255) 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aGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGGTATCGCATTTaca > 1:432221/1‑150 (MQ=255) ttCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCATTTAcacc > 1:904808/1‑150 (MQ=255) | CTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCATTTACACCA > CP009273/3516800‑3517097 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |