| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,622,519 | C→A | 26.8% | R127L (CGA→CTA) | rbbA ← | ribosome‑associated ATPase: ATP‑binding protein/ATP‑binding membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,622,519 | 0 | C | A | 26.8% | 642.0 / 239.0 | 313 | R127L (CGA→CTA) | rbbA | ribosome‑associated ATPase: ATP‑binding protein/ATP‑binding membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (119/110); new base A (46/38); total (165/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
CCGTTGTTGGCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGCTTCGGGTC > CP009273/3622370‑3622667 | ccGTTGTTGGCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTc < 2:2558154/150‑1 (MQ=255) cGTTGTTGGCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCg > 1:2073100/1‑150 (MQ=255) ttgttgGCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTCCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCa > 2:2631484/1‑150 (MQ=255) tgttgGCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCAc < 1:2147431/150‑1 (MQ=255) tgttgGCTCATCAAGGATCAAAAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCAc > 2:4368374/1‑150 (MQ=255) gttgGCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACt > 2:4159912/1‑150 (MQ=255) gttgGCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACt > 2:1282805/1‑150 (MQ=255) gttgGCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACt < 1:2703064/150‑1 (MQ=255) ttgGCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACtt < 2:1965806/150‑1 (MQ=255) gCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTccc < 1:1013588/150‑1 (MQ=255) gCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTccc < 2:4353204/150‑1 (MQ=255) cTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCccg < 1:3361585/150‑1 (MQ=255) cTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGATAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCccg > 2:1556805/1‑150 (MQ=255) atcaAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCccgctc > 2:4031840/1‑150 (MQ=255) atcaAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCccgctc > 2:29705/1‑150 (MQ=255) caAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCccgctccg > 2:3310053/1‑150 (MQ=255) aGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCccgctccgct > 2:4827423/1‑150 (MQ=255) aGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCccgctccgct > 1:4997731/1‑150 (MQ=255) gATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCttt > 2:4237784/1‑150 (MQ=255) aTCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTg < 2:1821307/150‑1 (MQ=255) aGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGa < 1:4618660/150‑1 (MQ=255) gTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGAc < 2:5005875/150‑1 (MQ=255) gggTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAAc > 2:3971437/1‑150 (MQ=255) ggTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACa < 2:4517990/150‑1 (MQ=255) ggTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACa < 1:4567232/150‑1 (MQ=255) ggTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACa > 1:832572/1‑150 (MQ=255) gTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAg < 1:1864338/150‑1 (MQ=255) gATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGgcgagc > 2:4684604/1‑150 (MQ=255) tAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGaa > 1:5041812/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGaaa > 1:880371/1‑150 (MQ=255) cgcAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAAt > 2:543876/1‑150 (MQ=255) cgcAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAAt < 2:2941522/150‑1 (MQ=255) cagcaCAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCg < 2:1482751/150‑1 (MQ=255) caGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGtt < 1:4397659/150‑1 (MQ=255) aGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGttt > 1:2922303/1‑150 (MQ=255) gCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGtttt < 1:1688183/150‑1 (MQ=255) gCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGtttt > 2:1106000/1‑150 (MQ=255) cccAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTc < 2:3146707/150‑1 (MQ=255) ccAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCa < 1:541265/150‑1 (MQ=255) cAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCAt > 1:4865301/1‑150 (MQ=255) cAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCAt > 1:2268441/1‑150 (MQ=255) aaGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATa < 1:1636305/150‑1 (MQ=255) aGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATac > 2:1348658/1‑150 (MQ=255) gTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATaca < 2:3863952/150‑1 (MQ=255) tttttGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATacac > 1:587099/1‑150 (MQ=255) ttttGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACAcc < 1:512584/150‑1 (MQ=255) tttGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCg > 2:3530167/1‑150 (MQ=255) tCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAgg > 2:3407351/1‑150 (MQ=255) aTCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGgtg < 2:5080544/150‑1 (MQ=255) aTCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGgtg > 1:2428827/1‑150 (MQ=255) tCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGgtgt < 2:3096382/150‑1 (MQ=255) ccgccgGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTgg < 2:771989/150‑1 (MQ=255) cgccgGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGt < 1:3012899/150‑1 (MQ=255) gccgGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTa > 2:4616067/1‑150 (MQ=255) cgGAGAGTTGCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCTCTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTaga < 2:2781457/150‑1 (MQ=255) ggAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTagag > 2:588525/1‑150 (MQ=255) ggAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTagag > 2:3784671/1‑150 (MQ=255) ggAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTagag > 2:1992678/1‑150 (MQ=255) gagaGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAgg > 1:3864243/1‑150 (MQ=255) agagTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGt < 2:1431344/150‑1 (MQ=255) agagTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGt > 1:3450535/1‑150 (MQ=255) agTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGttt < 2:4880947/150‑1 (MQ=255) gTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGtttt < 1:3551526/150‑1 (MQ=255) gTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGtttt > 2:5221671/1‑150 (MQ=255) tCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGc < 1:1949968/150‑1 (MQ=255) cTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCa > 1:725645/1‑150 (MQ=255) cGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGccc > 1:738183/1‑150 (MQ=255) ggACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGcccc > 2:4100079/1‑150 (MQ=255) aCGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTg < 1:4079032/150‑1 (MQ=255) aCGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTg < 1:4184760/150‑1 (MQ=255) cGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGc > 2:5137158/1‑150 (MQ=255) gATCGCGACACGGTGCTAACCCGGTGCGGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCg < 2:2821973/150‑1 (MQ=255) gATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCg < 2:2281664/150‑1 (MQ=255) gATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCg < 1:286650/150‑1 (MQ=255) gcgAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTCGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCAt > 2:2698079/1‑150 (MQ=255) gcgAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCAt < 1:1508906/150‑1 (MQ=255) gAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGATGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATcc < 2:3115048/150‑1 (MQ=255) gAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATcc > 2:141891/1‑150 (MQ=255) tGCTAACCCTGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGAt < 2:2347937/150‑1 (MQ=255) cTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATgc < 1:1594915/150‑1 (MQ=255) tAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATgcg > 1:3998820/1‑150 (MQ=255) tAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACATCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCACCTGCGGCATCCAGGCGATgcg > 1:4315323/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCa > 2:113406/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAg > 1:4845190/1‑150 (MQ=255) cTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACg > 1:4797424/1‑150 (MQ=255) gTCAGCAGCTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTcg < 1:1920780/150‑1 (MQ=255) agcagcTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCgcgg > 2:4586692/1‑150 (MQ=255) gcagcTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCgcggc < 1:4220956/150‑1 (MQ=255) gcTCATTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGAt > 2:19450/1‑150 (MQ=255) cTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATg < 2:2885595/150‑1 (MQ=255) tCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGc > 1:1268228/1‑150 (MQ=255) cATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGCt < 2:174556/150‑1 (MQ=255) aTTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGCtt < 1:1282805/150‑1 (MQ=255) aTTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTAGCGGCGATGCtt > 2:2740361/1‑150 (MQ=255) aTTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGCtt > 1:3234292/1‑150 (MQ=255) aTTGATTAGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGCtt > 2:18603/1‑150 (MQ=255) gATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGCTTCgg > 2:3328591/1‑150 (MQ=255) aTTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGCTTCggg > 2:3984100/1‑150 (MQ=255) ttCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGCTTCGGGt < 2:3550636/150‑1 (MQ=255) tCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGCTTCGGGTc < 2:1609743/150‑1 (MQ=255) | CCGTTGTTGGCTCATCAAGGATCAACAGTTCCGGGTCGTGGATTAACGCGCAGCACAGCCCAAGTTTTTGCTTCATCCCGCCGGAGAGTTTCCCTGCCGGACGATCGCGAAACGGTGCTAACCCGGTGCTGGTCAGCAGCTCATTGATTCGCACTTCCCGCTCCGCTTTGTCGTGACCGAACAGGCGAGCGAAAAAATCGACGTTTTCATACACCGACAAGGTGTGGTAGAGGTTTTTGCCCAGCCCCTGCGGCATCCAGGCGATGCGCGGGCAGACGTCGCGGCGATGCTTCGGGTC > CP009273/3622370‑3622667 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |