| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 4,303,256 | G→T | 8.7% | V30V (GTG→GTT) | rpiB → | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 4,303,256 | 0 | G | T | 8.7% | 1054.1 / 55.1 | 294 | V30V (GTG→GTT) | rpiB | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (135/131); new base T (9/17); total (146/148) | |||||||||||
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Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
AATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAATGAAAAAGATTGCATTTGGCTGTGATCATGTCGGTTTCATTTTAAAACATGAAATAGTGGCACATTTAGTTGAGCGTGGCGTTGAAGTGATTGATAAAGGAACCTGGTCGTCAGAGCGTACTGATTATCCACATTACGCCAGTCAAGTCGCACTGGCTGTTGCTGGCGGAGAGGTTGATGGCGGGATTTTGATTTGTGGTACTGGCGTCGGTATTTCGATAGCGGCGAACAAGTTTGC > CP009273/4303107‑4303405 | aaTTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAATGAAAAAGATTGCATTTGGCTGTGATCATGTCGGTTTCATTTTAAAACATGAAATAGTGGCACATTTAGTTGAGCGTGGCGTTGAAGtg < 1:857580/150‑1 (MQ=255) ttCATTAACATCACAAATGTTTTTTTATTGTGAATTTTTGCACGTACGGTGAAGATGAATGAAAAAGATTGCATTTGGCTGTGAACATGACGGTTTCATTTAAAAACATGAAATAGAGGCACAGTTAGTTGAGAGTGGCGATGAAGagat > 2:3452137/1‑150 (MQ=255) tCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAATGAAAAAGATTGCATTTGGCTGTGATCATGTCGGTTTCATTTTAAAACATGAAATAGTGGCACATTTAGTTGAGCGTGGCGTTGAAGtgatt < 2:141750/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |