Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,511,877 | G→A | 22.9% | intergenic (‑40/+67) | yjhF ← / ← yjhG | putative transporter/putative dehydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,511,877 | 0 | G | A | 22.9% | 747.5 / 221.2 | 340 | intergenic (‑40/+67) | yjhF/yjhG | putative transporter/putative dehydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (151/111); new base A (37/41); total (188/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
ATGGCGACAGCAATCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCA > CP009273/4511728‑4512026 | atggcgaCAGCAATCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCg > 1:2466502/1‑150 (MQ=255) gcgaCAGCAATCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACt < 1:2497452/150‑1 (MQ=255) gaCAGCAATCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGa > 2:3137890/1‑150 (MQ=255) gaCAGCAATCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGa > 1:4718299/1‑150 (MQ=255) aCAGCAATCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAg < 1:768971/150‑1 (MQ=255) aGCAATCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCa > 1:5175663/1‑150 (MQ=255) gCAATCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCaa < 2:2907637/150‑1 (MQ=255) cAATCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCaaa < 2:447700/150‑1 (MQ=255) aTCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATa > 2:5182206/1‑150 (MQ=255) tCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTCTTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATaa > 1:2193421/1‑150 (MQ=255) gagaCAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACg < 1:3099566/150‑1 (MQ=255) gaCAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGaa > 1:1786473/1‑150 (MQ=255) aCAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAat < 2:2389933/150‑1 (MQ=255) aCAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATAAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAat > 2:1299309/1‑150 (MQ=255) aataatTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAatga > 1:3323830/1‑150 (MQ=255) aataatTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAatga > 1:3563849/1‑150 (MQ=255) ataatTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAatgat > 1:4280849/1‑150 (MQ=255) ataatTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAatgat < 1:3045096/150‑1 (MQ=255) ataatTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAatgat < 1:4460343/150‑1 (MQ=255) taatTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAatgatg > 2:1786759/1‑150 (MQ=255) taatTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAatgatg < 1:1451568/150‑1 (MQ=255) aatTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGc > 1:1395982/1‑150 (MQ=255) atTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACTAATGATGCa > 2:3177209/1‑150 (MQ=255) aaCGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCagag < 2:1090611/150‑1 (MQ=255) cGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTc > 1:1884855/1‑150 (MQ=255) aaacaaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCgg > 1:89043/1‑150 (MQ=255) caaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATa > 1:2404796/1‑150 (MQ=255) caaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATa < 1:3734806/150‑1 (MQ=255) caaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGAAGAGTCGGATa > 2:4768059/1‑150 (MQ=255) caaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATa < 1:2007201/150‑1 (MQ=255) aaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATaa > 1:2576786/1‑150 (MQ=255) acttATTAAGCTTATTGTTTATGGATAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAAtt < 2:4029742/147‑1 (MQ=255) acGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAAtt < 2:1501726/150‑1 (MQ=255) tATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAg < 2:3205780/150‑1 (MQ=255) aTTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAgg < 1:3685729/150‑1 (MQ=255) aTTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAgg < 1:1066583/150‑1 (MQ=255) aaGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGgtgt > 1:460349/1‑150 (MQ=255) gCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATCATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTAAGGTGTCt > 2:3969563/1‑150 (MQ=255) gCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCt < 1:4742728/150‑1 (MQ=255) cTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTg > 2:2135295/1‑150 (MQ=255) ttAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTgg < 1:2147052/150‑1 (MQ=255) tAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGa > 1:388917/1‑150 (MQ=255) aaTTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGAt < 2:2561925/150‑1 (MQ=255) aaTTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGAt < 2:1196322/150‑1 (MQ=255) aaTTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGAt < 2:513781/150‑1 (MQ=255) aTTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATCAGTCAGGTGTCTGGATg > 2:672755/1‑150 (MQ=255) aTTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATg > 1:5122846/1‑150 (MQ=255) tttATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGttt < 1:4330457/150‑1 (MQ=255) tttATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACATCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGttt > 1:1717849/1‑150 (MQ=255) tATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGttttt > 2:3455882/1‑150 (MQ=255) tATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGttttt > 2:3385547/1‑150 (MQ=255) tATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGACACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCTTAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATTATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGttttt < 2:3490038/150‑1 (MQ=255) aTGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTttta < 2:2606889/150‑1 (MQ=255) aTGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTttta > 1:1241589/1‑150 (MQ=255) tGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTtttat < 2:2037413/150‑1 (MQ=255) tGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTtttat > 2:4700217/1‑150 (MQ=255) tGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGAGAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTtttat < 2:2684382/150‑1 (MQ=255) aaaaGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATg > 1:288441/1‑150 (MQ=255) aaaGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATACCGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGc > 1:670881/1‑150 (MQ=255) aaGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCt < 1:1163140/150‑1 (MQ=255) cAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTCTTTATGCGTTc > 2:4930996/1‑150 (MQ=255) aGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCACATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCa > 2:1397164/1‑150 (MQ=255) ggAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAg < 1:5220632/150‑1 (MQ=255) ggAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAg < 1:1204444/150‑1 (MQ=255) aGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGtt > 2:1528458/1‑150 (MQ=255) tAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGtttt < 2:4962939/150‑1 (MQ=255) aGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTAt > 1:2913348/1‑150 (MQ=255) aTCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCAt > 2:845702/1‑150 (MQ=255) tCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATa < 2:2263347/150‑1 (MQ=255) ccTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATaaa > 1:1296993/1‑150 (MQ=255) tGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAAt > 1:1692711/1‑150 (MQ=255) gCCACAACGATAATTAGGGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATc < 2:3783091/150‑1 (MQ=255) ccACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATcg < 2:4635605/150‑1 (MQ=255) caACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCgcgc > 2:4449608/1‑150 (MQ=255) aTAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAAGAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATGCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGc > 2:416280/1‑150 (MQ=255) tAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGcc < 2:3671939/150‑1 (MQ=255) aaTTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGAGCAAAGCcg > 1:2741468/1‑150 (MQ=255) aGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGcc > 2:780804/1‑150 (MQ=255) tGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCaa < 2:4213710/150‑1 (MQ=255) ggCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGTTAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAAt < 1:5018634/150‑1 (MQ=255) gCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAAATCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTGATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAAtg > 2:2768691/1‑149 (MQ=255) gCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAAtt < 1:4010265/150‑1 (MQ=255) tAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTg < 1:3942730/150‑1 (MQ=255) aCGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTAATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGtt > 1:3494334/1‑150 (MQ=255) cGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGttt < 1:965150/150‑1 (MQ=255) gTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTa > 2:1408473/1‑150 (MQ=255) tCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTAc < 2:1615348/150‑1 (MQ=255) ccTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTAca < 1:2134136/150‑1 (MQ=255) ctcATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATACAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTAcatca > 1:4224848/1‑150 (MQ=255) cATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATa > 2:4243721/1‑150 (MQ=255) cATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATa > 2:1891485/1‑150 (MQ=255) aTAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATaa > 1:468688/1‑150 (MQ=255) aTAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATaa > 2:4367274/1‑150 (MQ=255) aaCAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAAt > 2:599753/1‑150 (MQ=255) aGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACa < 1:906548/150‑1 (MQ=255) gTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCGAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAAcc > 1:4503488/1‑150 (MQ=255) tcatTATCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTcc < 1:4237620/150‑1 (MQ=255) aTCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCccacca > 2:4718572/1‑150 (MQ=255) aTCCAACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCccacca > 1:278400/1‑150 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCa < 2:2824892/150‑1 (MQ=255) | ATGGCGACAGCAATCGAGACAATAATTAACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCA > CP009273/4511728‑4512026 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |