| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 13,327 | G→T | 5.9% | V389L (GTA→TTA) | dnaK → | chaperone Hsp70, with co‑chaperone DnaJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 13,327 | 0 | G | T | 5.9% | 1154.3 / 34.6 | 303 | V389L (GTA→TTA) | dnaK | chaperone Hsp70, with co‑chaperone DnaJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (152/133); new base T (7/11); total (159/144) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.31e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |