| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 376716 = | NA (NA) | 112 (0.350) | 77/278 | NT | 40.0% | intergenic (‑1/‑91) | yaiX/insC1 | pseudogene, interrupted by IS2A, acetyltransferase homolog; nonfunctional; interruped by IS2; putative transferase/IS2 repressor TnpA |
| ? | CP009273 | = 386403 | 168 (0.520) | pseudogene (697/1458 nt) | yaiT | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/376861‑376716‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGTCTCATTTGTGTGCTT < CP009273/386403‑386256 TCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTC < 2:4281892/150‑1 CTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCG < 1:1589825/150‑1 TTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGG < 1:1148526/150‑1 TTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGG < 1:1148676/150‑1 TTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGT > 2:2288170/1‑150 TCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTTCGGTAG > 1:2758212/1‑150 CCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGT < 2:4085635/150‑1 CCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGT < 2:1246055/150‑1 TGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAG > 2:1173921/1‑150 TGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGT > 1:2404804/1‑150 ACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACCTCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCG > 2:2938535/1‑150 ACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCG < 1:4308006/150‑1 ACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGAGATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTCATTCGGTAGTGTAGGTTTCG > 2:2938530/1‑150 CCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTAGGTAGTGTAGGTTTCGTTG > 2:2930321/1‑150 CCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTAAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTG > 1:4129241/1‑150 CGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGT > 2:4185684/1‑150 CGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCAGCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGT < 2:2711206/150‑1 GTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTA > 1:391432/1‑150 TCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAA < 2:249636/150‑1 CTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAG < 1:1940005/150‑1 CTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAG > 1:1885100/1‑150 CTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGAAATCATTCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAATAACTAGTATTAAGACTATCTCTTTTTTAAGTGATTTTGGTTGTCTGGAGATTCAGGTGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAG < 1:4903829/150‑1 TGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGT > 1:1764987/1‑150 GCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTA < 2:1596796/150‑1 GTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATT < 1:650118/150‑1 TTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTA > 1:2786867/1‑150 CGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGA > 1:2625736/1‑150 CGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATAACCTTGA > 2:3078137/1‑150 CCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATA > 1:3308583/1‑150 CTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAA > 1:3705761/1‑150 TAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAAT < 2:3713666/150‑1 TAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAAT < 2:5361920/150‑1 TAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAAT > 2:4905321/1‑150 AAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATG > 2:3981243/1‑150 AGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGC < 1:1803535/150‑1 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TTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAG > 2:4784123/1‑150 TAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGC > 2:118204/1‑150 AAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATAAAGATTAACAGCA > 2:4417283/1‑150 GTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAAC > 2:3035447/1‑150 GTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAAC > 1:4152487/1‑150 ATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCC > 1:1054829/1‑150 TATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCT < 2:3308583/150‑1 TATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCT < 1:1422012/150‑1 TATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCT < 1:2100707/150‑1 TATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCT > 2:2609444/1‑150 TTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTC > 1:1325312/1‑150 TTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTC > 1:1325276/1‑150 TTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTC > 1:1325205/1‑150 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTA < 1:4111430/150‑1 CTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTAT > 2:2501980/1‑150 AGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAA > 1:1796623/1‑150 GATTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAAT > 2:3662455/1‑150 TTCAGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTTTCAAATGT < 1:3981243/150‑1 AGGGGGCCAGTCTAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCTATACCTGCAACGCGGGTGGTATTGGAAATATTGATGTTACTTTATACTTGAAGAGTAACAGCAACGCCTTCAGTTGTCTCAAATGTCTC > 2:2968054/1‑150 AGGGGGCCAGTCGAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCGTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTGATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACGTGTATCAAATGTCTC > 2:1149674/1‑150 TAATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGTCTCATTTGTGTGCTT < 2:81171/150‑1 TCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/376861‑376716‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTCGGTAGTGTAGGTTTCGTTGTAAGTATTACCTTGAGATAATGCAATACCTGCAACGCGGGAGTTATTGGAAATATTGATGTTACTTTCTACATCAAGATTAACAGCAACGCCTTCACTTGTATCAAATGTCTCATTTGTGTGCTT < CP009273/386403‑386256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |