New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
TATGCCGAAGGACAAAAGAAAACTTGCCAGACCGATTTTACTTATGCCCGAGGACTTTCCGGTAAAAGCTTTCCTGCCAGCTGCAACAATGTTGAAAATGCCAGCCAACTGCATGAAGTATGGCAAAAAGGGGCTGATGAAAATGCCAGCACAATACGATTAAATTAATTAAAACCCCACAAATAAATTAAACATAAGATTTTACTCATTGTGTTTTATTTCTCACATTGATGACGGTCGCATGAAAAAATGATATTTTAATGAGCATTCTGAAAAAATATCGATGCATTTCGAGCGAA > CP009273/2734917‑2735215 | tatGCCGAAGGACAAAAGAAAACTTGCCAGACCGATTTTACTTATGCCCGAGGACTTTCCGGTAAAAGCTTTCCTGCCAGCTGCAACAATGTTGAAAATGCCAGCCAACTGCATGAAGTATGGCAAAAAGGGGCTGATGAAAATGCCAGc < 2:2546471/150‑1 (MQ=255) gCCGAAGGACAAAAGAAAACTTGCCAGACCGATTTTACTTATGCCCGAGGACTTTCCGGTAAAAGCTTTCCTGCCAGCTGCAACAATGTTGAAAATGCCAGCCAACTGCATGAAGTATGGCAAAAAGGGGCTGATGAAAATGCCAGcaca > 1:225547/1‑150 (MQ=255) gCCGAAGGACAAAAGAAAACTTGCCAGACCGATTTTACTTATGCCCGAGGACTTTCCGGTAAAAGCTTTCCTGCCAGCTGCAACAATGTTGAAAATGCCAGCCAACTGCATGAAGTATGGCAAAAAGGGGCTGATGAAAATGCCAGcaca > 1:1705881/1‑150 (MQ=255) 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gatgaAAATGCCAGCACAATACGATTAAATTAATTAAAACCCCACAAATAAATTAAACATAAGATTTTACTCATTGTGTTTTATTTCTCACATTGATGACGGTCGCATGAAAAAATGATATTTTAATGAGCATTCTGAAAAAATATCGAt > 2:1006003/1‑150 (MQ=255) atgaAAATGCCAGCACAATACGATTAAATTAATTAAAACCCCACAAATAAATTAAACATAAGATTTTACTCATTGTGTTTTATTTCTCACATTGATGACGGTCGCATGAAAAAATGATATTTTAATGAGCATTCTGAAAAAATATCGATg < 2:2710491/150‑1 (MQ=255) aaaaTGCCAGCACAATACGATTAAATTAATTAAAACCCCACAAATAAATTAAACATAAGATTTTACTCATTGTGTTTTATTTCTCACATTGATGACGGTCGCATGAAAAAATGATATTTTAATGAGCATTCTGAAAAAATATCGATGCAt > 1:5497469/1‑150 (MQ=255) aaaTGCCAGCACAATACGATTAAATTAATTAAAACCCCACAAATAAATTAAACATAAGATTTTACTCATTGTGTTTTATTTCTCACATTGATGACGGTCGCATGAAAAAATGATATTTTAATGAGCATTCTGAAAAAATATCGATGCAtt < 2:2155758/150‑1 (MQ=255) aaaTGCCAGCACAATACGATTAAATTAATTAAAACCCCACAAATAAATTAAACATAAGATTTTACTCATTGTGTTTTATTTATCACATTGATGACGGTCGCATGAAAAAATTATATTTTAATGAGAATTCTGAAAAAATATCGATGCAtt > 2:4525013/1‑150 (MQ=255) 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gCACAATACGATTAAATTAATTAAAACCCCACAAATAAATTAAACATAAGATTTTACTCATTGTGTTTTATTTCTCACATTGATGACGGTCGCATGAAAAAATGATATTTTAATGAGCATTCTGAAAAAATATCGATGCATTTCGAGCGa < 2:82711/150‑1 (MQ=255) cacaATACGATTAAATTAATTAAAACCCCACAAATAAATTAAACATAAGATTTTACTCATTGTGTTTTATTTCTCACATTGATGACGGTCGCATGAAAAAATGATATTTTAATGAGAATTCTGAAAAAATATCGATTCATTTCGAGCGaa > 2:4890690/1‑150 (MQ=255) | TATGCCGAAGGACAAAAGAAAACTTGCCAGACCGATTTTACTTATGCCCGAGGACTTTCCGGTAAAAGCTTTCCTGCCAGCTGCAACAATGTTGAAAATGCCAGCCAACTGCATGAAGTATGGCAAAAAGGGGCTGATGAAAATGCCAGCACAATACGATTAAATTAATTAAAACCCCACAAATAAATTAAACATAAGATTTTACTCATTGTGTTTTATTTCTCACATTGATGACGGTCGCATGAAAAAATGATATTTTAATGAGCATTCTGAAAAAATATCGATGCATTTCGAGCGAA > CP009273/2734917‑2735215 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |