| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 657,177 | 0 | C | T | 5.4% | 1124.4 / 33.6 | 313 | A186A (GCG→GCA) | lipB | octanoyltransferase; octanoyl‑[ACP]:protein N‑octanoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (147/149); new base T (6/11); total (153/160) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
ATGTAAAGCATTAGCAGATATTATGAGTAATGACCCAGTGTAAATTGGGCCATTGATGTATGGAATTAAGCGGTAATATATTCGAAGTCCGGATTGTTTAGTAGCGCTAAAATATTTTCCAGTAAACGTGGAGCAATATTATTAGTCGTCGCTTCGGGTTTCCATTGTGATATTTTAGCCATTTCCATTCCGGCATACCCACAAGGATTAATACGTAAAAATGGTGAAAGATCCATATTGACGTTTAATGCCAGACCGTGGAATGAACAACCGCGTCGAATACGTAAACCCAGTGAGC > CP009273/657028‑657325 | aagTAAAGCATGAGCAGATATTATGAGTAATGACCCAGTGTAAATTGGGCCATTGATGTATGGCATTAAGCGGTAATATATTCGAAGTCCGGATTGTTTAGTAGCGCTAAAATATTTGCCAGTACACGTGGAGCAATATTATTAgtcgtc < 2:2950504/148‑1 (MQ=255) aaaGCATTAGCAGATATTATGAGTAATGACCCAGTGTAAATTGGGCCATTGATGTATGGAATTAAGCGGTAATATATTCGAAGTCCGGATTGTTTAGTAGCGCTAAAATATTTTCCAGTAAACGTGGAGCAATATTATTAGTCGTCGCtt < 2:1539186/150‑1 (MQ=255) aaGCATTAGCAGATATTATGAGTAATGACCCAGTGTAAATTGGGCCATTGATGTATGGAATTAAGCGGTAATATATTCGAAGTCCGGATTGTTTAGTAGCGCTAAAATATTTTCCAGTAAACGTGGAGCAATATTATTAGTCGTCGCTTc > 1:2308945/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |