| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 766,563 | G→A | 11.1% | intergenic (+496/‑351) | mngB → / → cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 766,563 | 0 | G | A | 11.1% | 980.3 / 85.8 | 317 | intergenic (+496/‑351) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (167/113); new base A (12/23); total (179/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.08e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.74e-01 | |||||||||||
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
AAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATT > CP009273/766414‑766712 | aaGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAgg > 1:4832375/1‑150 (MQ=255) gAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGaa < 1:5607675/150‑1 (MQ=255) aaTTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAAt > 2:4904527/1‑150 (MQ=255) ggTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGAAATTGatat < 1:5433496/150‑1 (MQ=255) gTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATAtt > 1:582630/1‑150 (MQ=255) gTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGAAATTGATAtt > 2:352651/1‑150 (MQ=255) aaCCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATAAACATAATTTGTAGAAATTGATATTTAt > 2:60325/1‑150 (MQ=255) aCCGTTCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATc < 2:5164247/150‑1 (MQ=255) ccGTGCTGATTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTATAATTGCCAACCGACACCAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAACCTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCa < 2:3057252/150‑1 (MQ=255) gTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAAt > 2:3239050/1‑150 (MQ=255) gTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAAAATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAAt > 2:2134863/1‑150 (MQ=255) tGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTACCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATg > 1:3418064/1‑150 (MQ=255) cTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGta > 2:3982728/1‑150 (MQ=255) ttttGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAg > 2:3701750/1‑150 (MQ=255) ttttGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGAAATTGatat < 2:3349708/135‑1 (MQ=255) ttttGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGAAATTGatat > 1:3349708/1‑135 (MQ=255) tttGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGt > 2:223952/1‑150 (MQ=255) ttGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTc < 2:1851301/150‑1 (MQ=255) ttGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTc < 2:2446089/150‑1 (MQ=255) ttGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTc < 1:199383/150‑1 (MQ=255) gCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCtt > 1:2073720/1‑150 (MQ=255) ttCGTCTCTTTTTATCTTTAAGTGCCAACCGAAAATAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGAAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTgg < 1:3414820/150‑1 (MQ=255) tCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAATTCTTGGa > 2:1081925/1‑150 (MQ=255) gTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACATTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGaaa > 1:3661425/1‑150 (MQ=255) ctctTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGAAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATg > 1:4277246/1‑150 (MQ=255) tctTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATgg < 2:3457607/150‑1 (MQ=255) tctTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATgg > 1:2159675/1‑150 (MQ=255) ctTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACTTAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATggg > 2:4629337/1‑150 (MQ=255) ctTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATggg < 1:3397091/150‑1 (MQ=255) ttttATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCa > 2:2649395/1‑150 (MQ=255) ttttATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCa > 2:5039630/1‑150 (MQ=255) tATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCa > 2:316828/1‑150 (MQ=255) aTCATTTATGGCCACCCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACCCATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCac < 1:2931186/150‑2 (MQ=255) tttAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCaaaaa < 2:245891/150‑1 (MQ=255) aaTTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAagag > 1:1805644/1‑150 (MQ=255) ttGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGAt < 1:5345433/150‑1 (MQ=255) gCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATCAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATaa < 1:3051800/150‑1 (MQ=255) gCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATaa > 2:1261349/1‑150 (MQ=255) aaCCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAAtt < 1:4096226/150‑1 (MQ=255) aaCCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAAtt > 1:3134079/1‑150 (MQ=255) ccGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGt > 2:160147/1‑150 (MQ=255) gAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTtc < 2:4593970/150‑1 (MQ=255) aaaCTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTtct > 1:742967/1‑150 (MQ=255) aaCTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTtctc < 1:4019275/150‑1 (MQ=255) aatAATTTAAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTTACATAATTTGTATGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCg < 1:3771550/148‑1 (MQ=255) aCTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCg > 1:4891974/1‑150 (MQ=255) aaTTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATc > 2:4411907/1‑150 (MQ=255) aaTTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATc < 1:1557258/150‑1 (MQ=255) cAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAAtt < 2:4678576/150‑1 (MQ=255) aGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTg > 2:2001637/1‑150 (MQ=255) aGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTg < 1:3097565/150‑1 (MQ=255) ccTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGAAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGc < 1:5040831/150‑1 (MQ=255) cTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGAAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCt > 1:4638804/1‑150 (MQ=255) cTTATAACTCACACAATTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCt < 2:2744226/150‑1 (MQ=255) ttATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTg > 1:116222/1‑150 (MQ=255) tataACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGa > 1:4998074/1‑150 (MQ=255) ataACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGaa > 1:2501682/1‑150 (MQ=255) aaCTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAg > 1:1703658/1‑150 (MQ=255) aCTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGAAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAgg < 1:352651/150‑1 (MQ=255) cTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTATCGATCAAATTGGCTGaaatga > 2:333475/1‑147 (MQ=255) cacacaTTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGATATAAATGGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCgg > 2:5226462/1‑150 (MQ=255) cacaTTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTa < 1:1480834/150‑1 (MQ=255) acaTTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTaa > 1:766485/1‑150 (MQ=255) acaTTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTaa < 1:2880577/150‑1 (MQ=255) ttttAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAAttt < 1:4943665/150‑1 (MQ=255) ttAAACATAAATGTCACTAAATTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGAAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAg < 2:2826654/150‑1 (MQ=255) ttAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAg > 2:5019054/1‑150 (MQ=255) ttAAACATAAATGTAACTAAAGTTACATTATTTAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTTATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGTCGGTAATTTAg < 2:4033653/150‑1 (MQ=255) aaaCATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCt < 2:5427367/150‑1 (MQ=255) aaaCATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCt > 2:645791/1‑150 (MQ=255) aaaCATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCt < 2:4237631/150‑1 (MQ=255) aaCATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCta < 2:2008759/150‑1 (MQ=255) aaCATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCta > 1:1938565/1‑150 (MQ=255) tAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATaaa > 1:3966388/1‑150 (MQ=255) tAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATaaa > 1:4133755/1‑150 (MQ=255) tGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGa < 1:1369344/150‑1 (MQ=255) cTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCAcc < 2:4084348/150‑1 (MQ=255) tAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCg > 2:1417802/1‑150 (MQ=255) tAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCg > 2:4093081/1‑150 (MQ=255) aaaGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGt < 2:3900972/150‑1 (MQ=255) aaGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTc > 2:1194929/1‑150 (MQ=255) gTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGa > 1:4194965/1‑150 (MQ=255) ccTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGaaaaa > 1:3016856/1‑150 (MQ=255) ccTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGaaaaa > 1:3841846/1‑150 (MQ=255) aaaCATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAAtt > 1:4495376/1‑150 (MQ=255) aaaCATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAAtt > 2:2206021/1‑150 (MQ=255) aCATTATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCACTGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTg < 2:4770764/150‑1 (MQ=255) aCATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTg < 2:1938889/150‑1 (MQ=255) aCATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGAAAATTTg > 2:1800593/1‑150 (MQ=255) aTGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCt < 1:5186956/150‑1 (MQ=255) gATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTc > 2:173404/1‑150 (MQ=255) gATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTc > 1:2736888/1‑150 (MQ=255) aTTAACATAATTTGTAGAAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTca < 1:2293575/150‑1 (MQ=255) ttAACATAATTTGTAGAAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTcaa < 2:1048946/150‑1 (MQ=255) aaCATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAATGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAATATGCAAATTTGCTTcaaca > 2:2814865/1‑150 (MQ=255) aCATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTcaacaa < 2:575031/150‑1 (MQ=255) cATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACaaa < 2:1867171/150‑1 (MQ=255) tGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGATATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGTAAGGAGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACATGt > 2:2344769/1‑150 (MQ=255) gTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGtt < 1:2805465/150‑1 (MQ=255) tAGTAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGttt < 2:3632064/150‑1 (MQ=255) | AAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATT > CP009273/766414‑766712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |