Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,194,365 | G→T | 15.9% | W72L (TGG→TTG) | lit → | e14 prophage; cell death peptidase, inhibitor of T4 late gene expression |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,194,365 | 0 | G | T | 15.9% | 1135.3 / 155.2 | 376 | W72L (TGG→TTG) | lit | e14 prophage; cell death peptidase, inhibitor of T4 late gene expression |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (143/173); new base T (28/32); total (171/205) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.88e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.55e-01 |
Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
GAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAACAACA > CP009273/1194216‑1194513 | ggAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGTATATATTTGGGc > 2:5469428/1‑150 (MQ=255) ggAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGc < 1:3492838/150‑1 (MQ=255) ggAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGc > 1:575437/1‑150 (MQ=255) aGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCAt > 1:4291660/1‑150 (MQ=255) gCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCAtt < 2:2351034/150‑1 (MQ=255) cAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCAttt < 2:4959739/150‑1 (MQ=255) cAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCAttt > 1:2323651/1‑150 (MQ=255) aGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTc < 1:5354481/150‑1 (MQ=255) aGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTc < 1:202635/150‑1 (MQ=255) gATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTcc < 2:4188825/150‑1 (MQ=255) aTCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTTTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCa > 1:663587/1‑150 (MQ=255) tCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCaa > 2:214530/1‑150 (MQ=255) ttAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑tt < 1:168025/150‑1 (MQ=255) aaCGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGATGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCTAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATATGGGCATATTCCAA‑TTTCtt > 2:2910517/1‑150 (MQ=255) cGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCtttt < 2:2411101/150‑1 (MQ=255) aGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGt < 2:2660448/150‑1 (MQ=255) cgacAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTAc < 2:3479731/150‑1 (MQ=255) cgacAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTAc < 2:5149885/150‑1 (MQ=255) cAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCa < 1:3775778/150‑1 (MQ=255) cAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTTCGCa > 1:1115364/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAag < 1:1492225/150‑1 (MQ=255) aaaTTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGt < 1:3432100/150‑1 (MQ=255) tttCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAAt < 1:5484157/150‑1 (MQ=255) tttCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAAt < 1:4773568/150‑1 (MQ=255) ttCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAAtc > 2:4175723/1‑150 (MQ=255) gTTGTGCGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAg < 1:2910380/150‑1 (MQ=255) ttGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGa < 2:3123902/150‑1 (MQ=255) gagtgaACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGaaaaa < 1:5634860/150‑1 (MQ=255) agtgaACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAaat < 1:4875912/150‑1 (MQ=255) agtgaACCTGGTTTTAATATCCGAGACAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAaat < 2:5096156/150‑1 (MQ=255) tgaACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAaataa < 1:847305/150‑1 (MQ=255) gaACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAaataat > 1:3891592/1‑150 (MQ=255) aaCCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAATTTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAaataat > 1:5111894/1‑150 (MQ=255) aaCCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAaataatt > 1:3623942/1‑149 (MQ=255) aCCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAatga < 2:3894369/150‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAatgat < 1:5285558/150‑1 (MQ=255) ggTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAg < 2:4905747/150‑1 (MQ=255) tttAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCAc < 2:4157740/150‑1 (MQ=255) tttatatCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCTCTTGAATATATTTGGGCTTTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCATGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACt < 1:1811539/147‑1 (MQ=255) ttAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACt < 1:5011846/150‑1 (MQ=255) aaTATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGACATTGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACttt < 1:2989358/150‑1 (MQ=255) tatCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGa < 1:5587444/150‑1 (MQ=255) atCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTTATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGAt < 1:3065169/150‑1 (MQ=255) tCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTATCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGAtt < 1:2672773/150‑1 (MQ=255) tCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGAtt < 2:3442986/150‑1 (MQ=255) ccGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATTGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGAttt < 2:4607012/150‑1 (MQ=255) ccGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGAttt > 1:3541547/1‑150 (MQ=255) ccGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGAttt > 1:2181087/1‑150 (MQ=255) gTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACa < 2:5635875/150‑1 (MQ=255) gTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACa < 1:104453/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAgg < 2:5358501/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAgg < 2:1265588/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAgg < 2:1904453/150‑1 (MQ=255) gaagaaTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGaaa < 1:227306/150‑1 (MQ=255) aagaaTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGaaaa > 1:3649658/1‑150 (MQ=255) aagaaTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGaata > 2:5246482/1‑148 (MQ=255) agaaTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGaaaaa > 2:3768926/1‑150 (MQ=255) gaaTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGaaaaaa > 1:1075682/1‑150 (MQ=255) aaTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAAt < 1:4345595/150‑1 (MQ=255) aTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATa > 2:352393/1‑150 (MQ=255) aTGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATa < 1:2504045/150‑1 (MQ=255) gagaGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAgg < 1:1014005/150‑1 (MQ=255) agagTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGc < 2:1197043/150‑1 (MQ=255) agTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCtt < 2:713518/150‑1 (MQ=255) gTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTa < 2:2738975/150‑1 (MQ=255) gTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTa < 2:1722980/150‑1 (MQ=255) gTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTa > 1:2477507/1‑150 (MQ=255) ataatTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTaaaa > 2:4376941/1‑150 (MQ=255) atTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGt > 1:3484109/1‑150 (MQ=255) atTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGt < 2:3604254/150‑1 (MQ=255) ttCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTc < 2:2710516/150‑1 (MQ=255) cacaTGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCtg > 2:2103015/1‑150 (MQ=255) caTGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCtgat < 1:925059/150‑1 (MQ=255) tGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCtgatga < 2:4107752/150‑1 (MQ=255) aaaTAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAAc > 1:2397449/1‑150 (MQ=255) aTAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATTATGAGGACTTTGATTTAAAAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAAcgt > 2:2942379/1‑148 (MQ=255) aTAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAActt < 1:870236/150‑1 (MQ=255) aTAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAActt < 2:5544661/150‑1 (MQ=255) aTAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAActt > 1:3761770/1‑150 (MQ=255) tAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAActtc > 2:1427400/1‑150 (MQ=255) gTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAActtctt > 1:2941572/1‑150 (MQ=255) gTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAActtctt < 1:4104415/150‑1 (MQ=255) gTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAActtctt < 2:1649424/150‑1 (MQ=255) tAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAAt > 2:3158106/1‑150 (MQ=255) tAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAAt > 2:4004836/1‑150 (MQ=255) aCAGTAGCTTCACTTGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATgg > 2:3324296/1‑150 (MQ=255) cAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATggg > 1:2146338/1‑150 (MQ=255) gCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAgg > 1:4629227/1‑150 (MQ=255) cTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGa > 1:1305364/1‑150 (MQ=255) ttCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGGTGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGaa < 2:4795410/150‑1 (MQ=255) ttCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGaa < 2:561748/150‑1 (MQ=255) aCTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGaaaaa > 2:1053132/1‑150 (MQ=255) ttGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACt < 1:4175416/150‑1 (MQ=255) tGAATATATTTTGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGTTTTTTACGCAAGAGTAATCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACtt < 2:1333169/150‑1 (MQ=255) tatatTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCaa < 1:2635181/150‑1 (MQ=255) atatTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAAATTGCaaa > 2:3278991/1‑150 (MQ=255) tttGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAaacaa > 2:2551538/1‑150 (MQ=255) ttGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAATAACTTGCAaacaac > 1:3323587/1‑150 (MQ=255) tGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAacaaca > 2:5075128/1‑150 (MQ=255) tGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGAAAacaaca > 1:3842543/1‑150 (MQ=255) | GAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACAGTAGCTTCACTTGAATATATTTGGGCATTTTCCAA‑TTTCTTTTGGGTTTTTACGCAAGAGTACTCCAAATCTCAGAAAAATAATGATGAGCACTTTGATTTAACAGGAAAAAATAGGCTTAAAAAGTCTGATGAACTTCTTAAATGGGCAAGGAAAAACTTGCAAACAACA > CP009273/1194216‑1194513 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |