Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,611,821 | C→A | 6.3% | I179I (ATC→ATA) | ydeA → | arabinose efflux transporter, arabinose‑inducible |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,611,821 | 0 | C | A | 6.3% | 1293.8 / 42.4 | 339 | I179I (ATC→ATA) | ydeA | arabinose efflux transporter, arabinose‑inducible |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (171/146); new base A (11/11); total (182/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
CCGGCCGGGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATA > CP009273/1611675‑1611970 | cggccggGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCAccc < 1:1001177/150‑1 (MQ=255) ggccggGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCt > 1:3619644/1‑150 (MQ=255) ggccggGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCt > 1:4577706/1‑150 (MQ=255) ccggGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCttt > 1:2005263/1‑150 (MQ=255) cggGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCtttt < 2:4865594/150‑1 (MQ=255) gggAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTtg > 1:1397680/1‑150 (MQ=255) aaGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGc > 1:3931493/1‑150 (MQ=255) aGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGcc < 2:12692/150‑1 (MQ=255) aGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGcc > 1:4616546/1‑150 (MQ=255) gAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTCTTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGa > 2:5545239/1‑150 (MQ=255) gAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGa > 2:1104092/1‑150 (MQ=255) gAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGa > 1:680847/1‑150 (MQ=255) aGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGAt > 1:1723603/1‑150 (MQ=255) acaGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTaa < 1:2199147/150‑1 (MQ=255) gCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCCCTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTa > 1:1729845/1‑150 (MQ=255) gCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATAACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTa < 1:1532139/150‑1 (MQ=255) ttGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACtt > 1:5649069/1‑150 (MQ=255) ttATTTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTTGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTa < 2:3414051/150‑1 (MQ=255) ttAATAGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTCTGGGCCAGTAATTCGGTTGGCGAATGACCTACTTCGCGATAGGACTTGGGGCGCATATCACCCTATAGTGCCTCATTAAGTTACTTaccgaa > 2:5053209/1‑147 (MQ=255) aTTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTg < 2:1675874/150‑1 (MQ=255) aTTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTg < 2:557838/150‑1 (MQ=255) ttGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGc > 2:4515344/1‑150 (MQ=255) tGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGcc < 1:4379567/150‑1 (MQ=255) gCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGccc > 1:3095197/1‑150 (MQ=255) cACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAg > 2:4869822/1‑150 (MQ=255) aCCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATAACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGt > 1:2568474/1‑150 (MQ=255) ccGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTg < 1:5364803/150‑1 (MQ=255) ccGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTg < 1:2525219/150‑1 (MQ=255) gTACAGCACTGGCGTTGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGc < 1:3382691/150‑1 (MQ=255) aGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTc < 1:650728/150‑1 (MQ=255) cACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCg < 1:3148893/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGt > 2:4729091/1‑150 (MQ=255) ggCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTc > 1:2639108/1‑150 (MQ=255) ggCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTc > 2:777480/1‑150 (MQ=255) ggCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTc < 1:3701401/150‑1 (MQ=255) gctGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGATTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTctct > 2:3731066/3‑150 (MQ=255) gATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACt < 2:3198596/150‑1 (MQ=255) gATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACt > 1:1903154/1‑150 (MQ=255) aTGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTg < 1:1187716/150‑1 (MQ=255) aTGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATAACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTg > 2:645565/1‑150 (MQ=255) aTGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATAACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTg > 2:644493/1‑150 (MQ=255) gTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGaaa > 1:612784/1‑150 (MQ=255) gTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGaaa > 1:3465736/1‑150 (MQ=255) cTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAg > 2:145847/1‑150 (MQ=255) tAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGcc > 2:1039209/1‑150 (MQ=255) agctatACCTCTCCGGCGAAGTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGTCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTTTTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCt < 2:3910207/145‑1 (MQ=255) tACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGc > 1:2087749/1‑150 (MQ=255) ctctCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTAt > 2:2989394/1‑150 (MQ=255) ctcGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTg < 2:1792067/150‑1 (MQ=255) ggCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTcc < 2:5221409/150‑1 (MQ=255) gcgcATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTccg < 2:5175460/150‑1 (MQ=255) cgcATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTccgc > 1:4861558/1‑150 (MQ=255) gtgGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCg < 1:2304061/150‑1 (MQ=255) gggCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGc < 1:5058325/150‑1 (MQ=255) ccAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCAtt < 2:2399574/150‑1 (MQ=255) ccAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGGGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCAtt < 2:4167530/150‑1 (MQ=255) cAGTATTTCGGTTGGCGTATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATtg < 2:2917347/150‑1 (MQ=255) gTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATtgat < 1:4071810/150‑1 (MQ=255) gTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATtgat > 2:557597/1‑150 (MQ=255) gTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATtgat > 1:1547478/1‑150 (MQ=255) gTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATtgat < 1:747010/150‑1 (MQ=255) gTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATtgan < 2:4328648/150‑2 (MQ=255) tATTTCGGTTGTCGAATGACCTTCTTCGCGAAAGGTATTGGGGCGCTTATCAACCTTTTGTGACTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCACAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGACTCACGCTATTGTTCAGCCGCCCGGCATttatg > 1:420699/1‑150 (MQ=255) tATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATtgatg < 1:4363918/150‑1 (MQ=255) tttCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAg < 2:753725/150‑1 (MQ=255) tttCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAg > 1:978775/1‑150 (MQ=255) tttCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAg < 2:4017937/150‑1 (MQ=255) tCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCa > 1:4260443/1‑150 (MQ=255) ggTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCatt > 1:4361216/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCattt < 1:4767640/150‑1 (MQ=255) ttGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCattta > 1:1669161/1‑150 (MQ=255) gCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCatttattt < 1:3502898/150‑1 (MQ=255) gAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGt > 1:351995/1‑150 (MQ=255) gACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAAc < 2:900899/150‑1 (MQ=255) ccTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACtg < 1:5526142/150‑1 (MQ=255) ccTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATAACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACtg < 2:2568474/150‑1 (MQ=255) cttcttCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACtgt > 2:5057103/1‑150 (MQ=255) tcttcGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCACTAACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGAAGAGCATTAATTTGTTAACTgtgg > 1:2251525/1‑150 (MQ=255) ttcGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTgtggtg < 2:3575060/150‑1 (MQ=255) cgATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTg > 1:3826567/1‑150 (MQ=255) cgATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTg < 2:1723603/150‑1 (MQ=255) cgATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTg < 1:88309/150‑1 (MQ=255) gATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGt > 1:5398358/1‑150 (MQ=255) aTTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTc < 1:5004649/150‑1 (MQ=255) ttGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGACCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGATCCGCCGCCCGGCATAGATGAGCATTTAGTTGTTAACTGTGGTGGTTGtaa > 2:2887487/1‑148 (MQ=255) tGGTATTGGGGCGCTTATAACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTTGTTGTCAc > 1:2893856/1‑150 (MQ=255) tGGTATTGGGGCGCTTATAACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCAc > 1:2375451/1‑150 (MQ=255) tATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGc > 1:465004/1‑150 (MQ=255) aTTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGcc < 1:5251184/150‑1 (MQ=255) tGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCa > 2:196800/1‑150 (MQ=255) tGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCa > 2:3491116/1‑150 (MQ=255) tGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCa > 2:3379418/1‑150 (MQ=255) tGGGGCGCTTATCACCCTTTTCTGCCTGATTAAGATACTTCCCATACAGCCCCGTGAGCCTTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCAGCTATTGTTCCGCCTCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGACACCGCCCa > 2:140755/1‑150 (MQ=255) ggggCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCAt < 2:122587/150‑1 (MQ=255) gggCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCAtt > 1:1804792/1‑150 (MQ=255) cgcTTATAACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTaca < 2:873945/150‑1 (MQ=255) gcTTATCACCCATTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGAGAGCAAACCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTacac > 2:2085873/1‑150 (MQ=255) tATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAGAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGc > 1:1292057/1‑150 (MQ=255) aTCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCa > 1:1050488/1‑150 (MQ=255) cACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATa < 1:5594186/150‑1 (MQ=255) | CCGGCCGGGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATA > CP009273/1611675‑1611970 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |