Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,299,282 | 0 | C | T | 6.0% | 1364.2 / 48.6 | 382 | V318I (GTT→ATT) | mqo | malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (187/172); new base T (14/9); total (201/181) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.20e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
AGAGGTGGTGGTGGAACTCATTAGATCCCACAATGAACCGTTTTTGAGGAATTTGGTTGAGAAGGTGGCAAATGGCCCAAACAGCACTACGCGTTTACCGTCCAGAACGCGGGTATCGATATGCGGAACCGACATCGGTGGTGCGCCAACGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACTGTCCGCCCACCGGGAAACCGGCGTAGTCTTTCGCTTCCGGAATCCCCGATTCCTGTAACAGCTTCAGCGCCGCACCGCCCG > CP009273/2299133‑2299431 | agagGTGGTGGTGGAACTCATTAGATCCCACAATGAACCGTTTTTGAGGAATTTGGTTGAGAAGGTGGCAAATGGCCCAAACAGCACTACGCGTTTACCGTCCAGAACGCGGGTATCGATATGCGGAACCGACATCGGTGGTGCGCCAAc < 2:2918025/150‑1 (MQ=255) gagGTGGTGGTGGAACTCATTAGATCCCACAATGAACCGTTTTTGAGGAATTTGGTTGAGAAGGTGGCAAATGGCCCAAACAGCACTACGCGTTTACCGTCCAGAACGCGGGTATCGATATGCGGAACCGACATCGGTGGTGCGCCAACg < 2:1369763/150‑1 (MQ=255) gtggtggtgGAACTCATTAGATCCCACAATGAACCGTTTTTGAGGAATTTGGTTGAGAAGGTGGCAAATGGCCCAAACAGCACTACGCGTTTACCGTCCAGAACGCGGGTATCGATATGCGGAACCGACATCGGTGGTGCGCCAACGGAt > 1:986611/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |