Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,553,563 | T→G | 17.1% | intergenic (+138/‑53) | intZ → / → yffL | CPZ‑55 prophage; putative phage integrase/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,553,563 | 0 | T | G | 17.1% | 638.4 / 148.7 | 276 | intergenic (+138/‑53) | intZ/yffL | CPZ‑55 prophage; putative phage integrase/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (127/101); new base G (33/14); total (161/115) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.50e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.53e-01 |
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
GAACCGGAATGAATAATTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCGGGGGCGGTATGAGAAACAAG > CP009273/2553414‑2553712 | gAACCGGAATGAATAATTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAattatt < 1:2638583/150‑1 (MQ=255) aCCGGAATGAATAATTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAattattcc < 2:1303559/150‑1 (MQ=255) cGGAATGAATAATTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAattattccat > 2:5330339/1‑150 (MQ=255) ggAATGAATAATTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAattattccatt > 2:1027304/1‑150 (MQ=255) ggAATGAATAATTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAattattccatt > 1:2421510/1‑150 (MQ=255) atgaatAATTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAattattccattatt > 2:2387165/1‑150 (MQ=255) aataatTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAAttattccattattcca > 2:680085/1‑150 (MQ=255) aataatTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTGTTTCGCTAAttattccattattcca > 1:4629116/1‑150 (MQ=255) ataatTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCaa > 2:3576103/1‑150 (MQ=255) ataatTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCaa > 1:3038386/1‑150 (MQ=255) atTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTa > 2:1968510/1‑150 (MQ=255) atTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTAGTCCATTATTCCAATTa < 1:5669881/150‑1 (MQ=255) tAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAg < 1:2982572/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGa > 2:5239998/1‑150 (MQ=255) gCTTTTTTGCAAATCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAAt < 1:2356900/150‑1 (MQ=255) gCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAAt < 1:2331684/150‑1 (MQ=255) ttttttGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATaa > 1:3662973/1‑150 (MQ=255) ttttGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAat > 2:4829474/1‑150 (MQ=255) ttgtGCAACGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTCTTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAat < 1:3814490/147‑1 (MQ=255) tttGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAatt < 1:1739629/150‑1 (MQ=255) ttGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAatta > 2:1457686/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCa > 1:2303649/1‑150 (MQ=255) cgcAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAatat > 2:2115026/1‑150 (MQ=255) cAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCa > 1:4478915/1‑150 (MQ=255) aaTTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCaa > 1:4892702/1‑150 (MQ=255) aTTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCAATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAg > 2:3408847/1‑150 (MQ=255) ttttGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTAAATATCAAGa > 2:3912881/1‑150 (MQ=255) tttGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGaa < 2:5027938/150‑1 (MQ=255) ttGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAAc < 2:1977484/150‑1 (MQ=255) ttGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAAc < 2:4562966/150‑1 (MQ=255) tGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACt > 2:4079144/1‑150 (MQ=255) cATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTa > 1:1890765/1‑150 (MQ=255) gTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATcaa > 2:3168315/1‑148 (MQ=255) tataAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCAt > 1:1030379/1‑150 (MQ=255) tataAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCAt > 1:734154/1‑150 (MQ=255) ataAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATg > 1:4037933/1‑150 (MQ=255) taAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGt > 1:1336187/1‑150 (MQ=255) aGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGttt > 2:1888193/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCa > 1:4962532/1‑150 (MQ=255) tgttttgtGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACg > 2:2803638/1‑150 (MQ=255) gttttgtGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGTTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAATAACTTAAATCCATGTTTGCAACGa > 1:1936182/1‑150 (MQ=255) ttttgtGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGaa > 2:1756645/1‑150 (MQ=255) ttttgtGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGaa > 1:5408432/1‑150 (MQ=255) tttgtGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGaaa < 2:3449676/150‑1 (MQ=255) tgtgtgGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGa < 1:1468363/150‑1 (MQ=255) tgtgtgGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGa > 1:3295611/1‑150 (MQ=255) gtgtgGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGTTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGAt > 1:2711810/1‑150 (MQ=255) gtgtgGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGAt > 1:1287772/1‑150 (MQ=255) gtgGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAAGATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATcc < 2:2040713/150‑1 (MQ=255) tgGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCa < 2:2336346/150‑1 (MQ=255) ggTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCag < 1:255387/150‑1 (MQ=255) ttAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGt < 1:1577890/150‑1 (MQ=255) ttAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGt > 1:3296556/1‑150 (MQ=255) tAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGtt > 1:2646910/1‑150 (MQ=255) aaCTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTc < 2:2191428/150‑1 (MQ=255) aaCTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAACTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTc < 2:1694321/150‑1 (MQ=255) aaCTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTc > 2:828359/1‑150 (MQ=255) cTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGa > 1:903709/1‑150 (MQ=255) tATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCTGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGaa < 2:5632149/150‑1 (MQ=255) aTCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGaaa < 2:3940430/150‑1 (MQ=255) aTCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGaaa > 2:4347630/1‑150 (MQ=255) cACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAAt < 1:2391523/150‑1 (MQ=255) aCCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATa < 2:4407336/150‑1 (MQ=255) ccTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAg < 1:3576103/150‑1 (MQ=255) cTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAgg < 1:344698/150‑1 (MQ=255) tGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGa > 2:1062766/1‑150 (MQ=255) gATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGTCAATCGGAt > 1:4168927/1‑150 (MQ=255) aTAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATc > 2:3710254/1‑150 (MQ=255) aaCCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAAcaca > 1:5068989/1‑150 (MQ=255) ccTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACaaa > 1:514957/1‑150 (MQ=255) gTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGTTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATaa < 1:277312/150‑1 (MQ=255) gTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATaa > 2:1811864/1‑150 (MQ=255) aTTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATaaaa > 2:378289/1‑150 (MQ=255) ttCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAAGAGGATCAACACAAATAAAAg > 1:2952040/1‑150 (MQ=255) ttCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATACATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAg > 1:81292/1‑150 (MQ=255) tctaTTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGc < 2:4296555/147‑1 (MQ=255) tCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGc < 1:5330823/150‑1 (MQ=255) aaTTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGccc > 2:2614252/1‑150 (MQ=255) aaTTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGccc > 1:1761320/1‑150 (MQ=255) aaTTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGccc > 1:3453664/1‑150 (MQ=255) aTTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAATAGcccc > 2:4935233/1‑150 (MQ=255) tttGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGccccc < 2:5365388/150‑1 (MQ=255) ggATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAAtg < 1:386856/150‑1 (MQ=255) gATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAAtgg < 2:2499562/150‑2 (MQ=255) aTTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAAtgct < 2:4686742/150‑1 (MQ=255) tCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAAtgctgc < 1:2090419/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAACATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCaa > 2:2019536/1‑150 (MQ=255) gTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCaa > 1:4809800/1‑150 (MQ=255) gTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCaa > 2:2266618/1‑150 (MQ=255) gTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATGCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCaa > 2:3677639/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACa > 1:3949374/1‑150 (MQ=255) tcttttTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCgggg > 1:1126634/1‑150 (MQ=255) tcttttTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCgggg < 1:5531587/150‑1 (MQ=255) tttttCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCGGGGGc > 1:523784/1‑150 (MQ=255) ttttCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCGGGGGCg < 1:3793122/150‑1 (MQ=255) tCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCGGGGGCGGTa < 1:1442585/150‑1 (MQ=255) tCGCTAATTATTCCATTATTCCAACTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCGGGGGCGGTa > 1:5190663/1‑150 (MQ=255) attattccattattccAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCGGGGGCGGTATGAGaa > 1:649651/1‑150 (MQ=255) tattccattattccaATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCGGGGGCGGTATGAGAAAc < 1:2179512/150‑1 (MQ=255) attccattattccaATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCGGGGGCGGTATGAGAAACa < 2:4895083/150‑1 (MQ=255) | GAACCGGAATGAATAATTAAGCGGCTTTTTTGCAAAGCGCAATTTTGCATTTTGTATAAGTATTTGTTTTGTGTGGTTTAACTATCACCTGATAAGAAACCTGTATTCAATTTGCCGGATTCGTCCGGCTTTTCTTTTTCGCTAATTATTCCATTATTCCAATTAAGTGGAATAAATTATTCAATATCAAGAACTTAAATCCATGTTTGCAACGAAAGATCCAGAGTTCGAAAATAGGATCAACACAAATAAAAGCCCCCGGAATGCTGCAACATGCCGGGGGCGGTATGAGAAACAAG > CP009273/2553414‑2553712 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |