| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,651,665 | 0 | G | T | 75.2% | 675.3 / inf | 387 | G210G (GGC→GGA) | hscA | DnaK‑like molecular chaperone specific for IscU |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/51); new base T (185/105); total (231/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.99e-03 | |||||||||||
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Only 100 of 387 total aligned reads displayed.
GCTACGATCAGGAATGCCCGCCTGCTCGCGAATGTAATCCGCCAGCAGATGGTCGAAATCATCGCCGCCGAGCGCGGAATCACCGCCGGTTGCCAGCACTTCAAACACGCCGCGACTTAAGCGCAGAATGGAAATATCAAACGTCCCGCCACCGAGGTCATAAACGGCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTTAAGTAAGCGCAGGACGTGAAGGCCCGCCAGACGCGCCGCGTCTTTGGTGCCCTGACGCTGGGCATCGT > CP009273/2651518‑2651813 | gCTACGATCAGGAATGCCCGCCTGCTCGCGAATGTAATCCGCCAGCAGATGGTCGAAATCATCGCCGCCGAGCGCGGAATCACCGCCGGTTGCCAGCACTTCAAACACGCCGCGACTTAAGCGCAGAATGGAAATATCAAACGTCCCTcc < 1:3572646/150‑1 (MQ=255) cTACGATCAGGAATGCCCGCCTGCTCGCGAATGTAATCCGCCAGCAGATGGTCGAAATCATCGCCGCCGAGCGCGGAATCACCGCCGGTTGCCAGCACTTCAAACACGCCGCGACTTAAGCGCAGAATGGAAATATCAAACGTCCCTCCa > 1:3775497/1‑150 (MQ=255) gATCAGGAATGCCCGCCTGCTCGCGAATGTAATCCGCCAGCAGATGGTCGAAATCATCGCCGCCGAGCGCGGAATCACCGCCGGTTGCCAGCACTTCAAACACGCCGCGACTTAAGCGCAGAATGGAAATATCAAACGTCCCTCCACCGa > 1:677610/1‑150 (MQ=255) 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gTCCCTCCACCGAGGTCATAAACGGCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTTAAGTAAGCGCAGGACGTGAAGGCCCGCCAGACGCGCCGCGTCTTTGGTGCCCTGACGCTGGGCa > 1:1243017/1‑150 (MQ=255) gTCCCTCCACCGAGGTCATAAACGGCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTTAAGTAAGCGCAGGACGTGAAGGCCCGCCAGACGCGCCGCGTCTTTGGTGCCCTGACGCTGGGCa < 1:2206390/150‑1 (MQ=255) | GCTACGATCAGGAATGCCCGCCTGCTCGCGAATGTAATCCGCCAGCAGATGGTCGAAATCATCGCCGCCGAGCGCGGAATCACCGCCGGTTGCCAGCACTTCAAACACGCCGCGACTTAAGCGCAGAATGGAAATATCAAACGTCCCGCCACCGAGGTCATAAACGGCGATCACGCCTTCCTGACCGGAATCCAGCCCGTAGGCGATAGCCGCAGCGGTCGGTTCGTTAAGTAAGCGCAGGACGTGAAGGCCCGCCAGACGCGCCGCGTCTTTGGTGCCCTGACGCTGGGCATCGT > CP009273/2651518‑2651813 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |