| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,053,424 | T→A | 5.8% | W105R (TGG→AGG) | argP → | transcriptional regulator for arginine transport and DNA replication genes; replication initiation inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,053,424 | 0 | T | A | 5.8% | 877.1 / 32.4 | 251 | W105R (TGG→AGG) | argP | transcriptional regulator for arginine transport and DNA replication genes; replication initiation inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (112/124); new base A (7/8); total (119/132) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
ACCGCCGCGCCCGACGGAACAAGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGTGAGTATTCAACATCAGGCGCTGCCGAGTTGT > CP009273/3053276‑3053573 | ccgccgCGCCCGACGGAACAAGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTgg < 2:4260147/150‑1 (MQ=255) gccgcGCCCGACGGAACAAGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGtt < 2:86462/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGACGGAACAAGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCt < 2:4966125/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGACGGAACAAGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCt < 2:4883830/150‑1 (MQ=255) cccGACGGAACAAGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTcc > 2:213863/1‑150 (MQ=255) gAACAAGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTg < 1:3028325/150‑1 (MQ=255) aCAAGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGc < 1:583031/150‑1 (MQ=255) cAAGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCt < 2:5371354/150‑1 (MQ=255) aatggCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGAGGTTGCTTCCTGCACTGGCTc > 2:5522164/4‑150 (MQ=255) aaGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGAGGTTGCTTCCTGCACTGGCTc > 2:2725998/1‑150 (MQ=255) gggCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCt > 1:1733476/1‑150 (MQ=255) cAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCtgtg < 1:3588695/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCt < 1:254194/150‑1 (MQ=255) tgctgGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTg < 1:2648919/150‑1 (MQ=255) ctgGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAACCCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGAt < 2:1806681/150‑1 (MQ=255) ctgGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGAt < 2:3571744/150‑1 (MQ=255) ctgGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGGTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGAt < 1:106457/150‑1 (MQ=255) tgGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGAtt < 1:2099114/150‑1 (MQ=255) ggCTCTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTc < 2:3299158/150‑1 (MQ=255) ggCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTc < 2:147464/150‑1 (MQ=255) ggCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTc < 2:156200/150‑1 (MQ=255) ggCACTGCTGCGCCAGGTGGAGGTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTGCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTc < 2:3298883/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGcc > 2:3383575/1‑150 (MQ=255) aCTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGcc > 2:192956/1‑150 (MQ=255) ctgctgCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCt < 2:1741400/150‑1 (MQ=255) tgcGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTGCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATcc < 2:4978176/150‑1 (MQ=255) gcCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGcc > 1:700192/1‑150 (MQ=255) cAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGccag > 2:2305868/1‑148 (MQ=255) cAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTc < 1:4591333/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTc > 2:3864031/1‑150 (MQ=255) aGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCa > 2:5203375/1‑150 (MQ=255) aGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCa < 2:3549661/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCaa > 1:4432967/1‑150 (MQ=255) gTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAAc > 1:5171544/1‑150 (MQ=255) tGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACt < 2:623243/150‑1 (MQ=255) ggAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACtt > 2:5148122/1‑150 (MQ=255) ggAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGAGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACtt < 1:4060213/150‑1 (MQ=255) gAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTg > 2:3638885/1‑150 (MQ=255) aGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGc > 1:4959661/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGAGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGTTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAg < 1:915927/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAgg > 2:2104991/1‑150 (MQ=255) gCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGt < 2:4182716/150‑1 (MQ=255) gCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGt > 1:5436109/1‑150 (MQ=255) cTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTa > 1:4335649/1‑150 (MQ=255) cTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTa < 1:1397207/150‑1 (MQ=255) gaagaaGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGAGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTagaa < 2:792453/150‑1 (MQ=255) gaagaaGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGAAGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTAGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTagaa > 2:759896/1‑150 (MQ=255) aagaagAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTagaag < 2:3444245/150‑1 (MQ=255) aagaagAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTagaag < 1:3727594/150‑1 (MQ=255) aagaGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATg < 2:4604685/150‑1 (MQ=255) agagTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGa > 2:5362977/1‑150 (MQ=255) agagTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGa > 2:4875426/1‑150 (MQ=255) tGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTCTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAAcc > 1:835070/1‑150 (MQ=255) ggCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAAccc < 2:2946769/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCg < 1:454436/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCg < 1:3312758/150‑1 (MQ=255) tGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCa > 1:5072060/1‑150 (MQ=255) gCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTc < 2:1661739/150‑1 (MQ=255) 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ctgctTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTc < 1:3410122/150‑1 (MQ=255) ctgctTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTc < 1:4511764/150‑1 (MQ=255) tgctTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCg < 2:20168/150‑1 (MQ=255) tgctTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCg < 1:987629/150‑1 (MQ=255) gctTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCgg > 1:2327092/1‑150 (MQ=255) tttCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGgcg < 1:2239862/150‑1 (MQ=255) tttCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGgcg > 1:3662195/1‑150 (MQ=255) tttCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGgcg < 1:4789732/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGt > 2:5594322/1‑150 (MQ=255) cTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGTg > 1:5558239/1‑150 (MQ=255) 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tCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGTGAGTATTCAACATCAGGCGCt < 1:5597560/150‑1 (MQ=255) tCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGTGAGTATTCAACATCAGGCGCt < 2:2521741/150‑1 (MQ=255) tGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGTGAGTATTCAACATCAGGCGCTGc > 1:3619887/1‑150 (MQ=255) cGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGTGAGTATTCAACATCAGGCGCTGCCGa < 2:4479558/150‑1 (MQ=255) cGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGTGAGTATTCAACATCAGGCGCTGCCGa < 1:3218474/150‑1 (MQ=255) 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gTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGTGAGTATTCAACATCAGGCGCTGCCGAGttg < 1:4838343/150‑1 (MQ=255) tGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGTGAGTATTCAACATCAGGCGCTGCCGAGttgt > 2:2866055/1‑150 (MQ=255) | ACCGCCGCGCCCGACGGAACAAGGGCAAAAACTGCTGGCACTGCTGCGCCAGGTGGAGTTGCTGGAAGAAGAGTGGCTGGGCGATGAACAAACCGGTTCGACTCCGCTGCTGCTTTCACTGGCGGTCAACGCCGACAGTCTGGCGACGTGGTTGCTTCCTGCACTGGCTCCTGTGTTGGCTGATTCGCCTATCCGCCTCAACTTGCAGGTAGAAGATGAAACCCGCACTCAGGAACGTCTGCGCCGCGGCGAAGTGGTCGGCGCGGTGAGTATTCAACATCAGGCGCTGCCGAGTTGT > CP009273/3053276‑3053573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |