| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 339,660 | C→T | 5.5% | intergenic (+16/‑227) | yahK → / → yahL | aldehyde reductase, NADPH‑dependent, Zn‑containing, broad specificity/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 339,660 | 0 | C | T | 5.5% | 1297.0 / 40.8 | 361 | intergenic (+16/‑227) | yahK/yahL | aldehyde reductase, NADPH‑dependent, Zn‑containing, broad specificity/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (165/176); new base T (14/6); total (179/182) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.83e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 | |||||||||||
Only 100 of 371 total aligned reads displayed.
TTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTAT > CP009273/339511‑339809 | tttGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATAc < 2:117091/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATAcc < 2:4819777/150‑1 (MQ=255) cgcCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtg > 1:3710817/1‑150 (MQ=255) cgcCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtg < 2:4865541/150‑1 (MQ=255) gcCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCtgt > 1:1362085/1‑150 (MQ=255) gcCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtgt > 2:5024388/1‑150 (MQ=255) cGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTgg < 1:945276/150‑1 (MQ=255) gAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGt < 2:1390111/150‑1 (MQ=255) gAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGt > 1:4599481/1‑150 (MQ=255) aaCATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGtt < 1:2071223/150‑1 (MQ=255) aaCATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGtt < 1:3248233/150‑1 (MQ=255) cATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACata < 1:1011334/150‑1 (MQ=255) aTCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACatat < 2:4144900/150‑1 (MQ=255) aTCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACatat > 2:1278625/1‑150 (MQ=255) tGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAAc > 1:798265/1‑150 (MQ=255) ggCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGCAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATTTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACt < 2:3074398/150‑1 (MQ=255) gCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACtt > 1:313342/1‑150 (MQ=255) cTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTc < 1:3335628/150‑1 (MQ=255) tGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCg > 2:3667490/1‑150 (MQ=255) tGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCg > 2:5613417/1‑150 (MQ=255) tataGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGctc > 1:4560701/1‑150 (MQ=255) tataGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGctc > 1:1729536/1‑150 (MQ=255) ataGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGctct > 1:3198234/1‑150 (MQ=255) ataGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGctct > 2:344267/1‑150 (MQ=255) agagATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTcc < 2:2523435/150‑1 (MQ=255) gatgatTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGACTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACt < 2:1919835/150‑1 (MQ=255) atTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAAc > 2:1560356/1‑150 (MQ=255) ttCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACt < 1:1429124/150‑1 (MQ=255) ccGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAg > 2:3292234/1‑150 (MQ=255) tCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTaa < 2:2650306/150‑1 (MQ=255) cAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAg > 1:2853349/1‑150 (MQ=255) aaaTTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGGTAAgg > 1:2412708/1‑150 (MQ=255) aaTTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGga > 2:4425150/1‑150 (MQ=255) aaTTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGga < 1:5597684/150‑1 (MQ=255) aTTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGgag < 1:2258744/150‑1 (MQ=255) aaTGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGc < 2:1663951/150‑1 (MQ=255) aaTGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGc > 2:2984164/1‑150 (MQ=255) aaTGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGc < 2:4941849/150‑1 (MQ=255) aTGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCg > 2:78757/1‑150 (MQ=255) aTGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCg < 2:2881718/150‑1 (MQ=255) tGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGa < 2:21456/150‑1 (MQ=255) aaGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGaaa > 2:2263022/1‑150 (MQ=255) aGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAaat > 2:4382989/1‑150 (MQ=255) gCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAaata < 2:4766980/150‑1 (MQ=255) aTGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAatat > 1:3414070/1‑150 (MQ=255) gAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGt > 1:625444/1‑150 (MQ=255) gAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGt > 1:3476791/1‑150 (MQ=255) gAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGt > 1:2205890/1‑150 (MQ=255) gAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAAATTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGt > 2:267682/1‑150 (MQ=255) aaTGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTa > 1:4166943/1‑150 (MQ=255) ctgctgcGCGGTGCTGGGAACTATCGTTTTGTTATCGCTAATCGCACACTAACAGACTGACAAAATTAAGAAATACCCTGTGGTTGAACATCTGACCTGCGCTCTCCACTTAACTTTGTAGTGAAGGAGAGCGAAATACTATCAAAGTAg < 2:3352933/149‑1 (MQ=255) gctgcGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCa > 2:837022/1‑150 (MQ=255) tgcGCGGAGATGTGAAATATCGTGTTGTTATCGATAAACGCACAATACCAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTATAACAAATTAACTACTATCTCCACTTGAATATTTAGTTAATTATAGCGAAATAAGATCAAAGTATCAGt > 2:5402540/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTaa > 1:4919695/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGAACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTaa < 1:463534/150‑1 (MQ=255) gcgGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTaaa < 1:1792307/150‑1 (MQ=255) gcgGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTaaa < 2:3165971/150‑1 (MQ=255) gcgGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTaaa < 2:574856/150‑1 (MQ=255) cgGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTaaaa < 1:733451/150‑1 (MQ=255) cgGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTaaaa > 1:5346329/1‑150 (MQ=255) gTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAAcc < 1:1367407/150‑1 (MQ=255) tGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAAcat > 2:3524272/1‑148 (MQ=255) aTGAGAAATATCGTTTTTTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCtat < 1:5281806/150‑1 (MQ=255) gtgAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATaa > 2:409760/1‑150 (MQ=255) gtgAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATaa > 1:5130058/1‑150 (MQ=255) gAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACg < 1:3519797/150‑1 (MQ=255) aaTATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGta > 2:3325920/1‑150 (MQ=255) aaTATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGta > 2:467121/1‑150 (MQ=255) tatCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTACCAGACTGAAAAAATTTATAAATACCCTGTGGGTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaa < 2:2088951/150‑1 (MQ=255) atCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaat < 2:1241677/150‑1 (MQ=255) atCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaat < 1:4341625/150‑1 (MQ=255) atCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaat < 1:3823413/150‑1 (MQ=255) ttGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaatttaaat > 2:730162/1‑150 (MQ=255) tGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaatttaaatt > 1:1846670/1‑150 (MQ=255) tGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaatttaaatt > 1:1969905/1‑150 (MQ=255) tGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaatttaaatt < 2:510233/150‑1 (MQ=255) gTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTg > 1:3666765/1‑150 (MQ=255) ttATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATATCGTAAATTTAAATTGt < 1:3894117/150‑1 (MQ=255) aTCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTa > 2:617235/1‑150 (MQ=255) tCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTaa < 2:1088047/150‑1 (MQ=255) tAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTa > 2:3728278/1‑150 (MQ=255) tAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTa < 1:3585628/150‑1 (MQ=255) cacaCTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGccc > 1:4096873/1‑150 (MQ=255) acacTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCt > 2:2621312/1‑150 (MQ=255) acacTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCt > 1:2622682/1‑150 (MQ=255) cacTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACTTAAATTTAAATTGTTAAATTAACTCCCTc > 1:5032276/1‑150 (MQ=255) cacTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTc > 2:757554/1‑150 (MQ=255) tAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAg > 1:3013902/1‑150 (MQ=255) tAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAg < 1:1092763/150‑1 (MQ=255) aaCAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGt > 1:2747267/1‑150 (MQ=255) aaCAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGt > 2:2823874/1‑150 (MQ=255) aCAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTa > 2:1848765/1‑150 (MQ=255) aCAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTa > 1:1509441/1‑150 (MQ=255) gACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTacac > 2:195331/1‑150 (MQ=255) cTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACaa < 2:5298754/150‑1 (MQ=255) cTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACaa < 2:2483309/150‑1 (MQ=255) taataaATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCacac > 2:4236795/1‑150 (MQ=255) aataCCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACgttag > 1:1586394/1‑150 (MQ=255) taCCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACgttagtt > 2:2498583/1‑150 (MQ=255) cccTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTAt > 1:5438966/1‑150 (MQ=255) | TTTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTAT > CP009273/339511‑339809 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |