Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 738,149 | 0 | G | A | 9.4% | 880.9 / 57.4 | 267 | intergenic (‑137/‑134) | dtpD/ybgI | dipeptide and tripeptide permease D/NIF3 family metal‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (113/129); new base A (10/15); total (123/144) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
GTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGATTGCATAAATATACATTAGCTGAAGCGTGATGATATAAACAATTTGCGTCTTTTGGCGTCGGGTTTGTTTCTTAATATGTCAAAAGATTGGCTATCGACGAACTGGCGAGGTAACGCTATGTTAACGGTGTAGCTATCAGAATACGGAAGGCGCGAAGATGAAAAACACCGAA > CP009273/738001‑738297 | gtgtTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGATTGCATAAATATACATTAGCTGAAg > 1:2688149/1‑149 (MQ=255) ttATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGATTGCATAAATATACATTAGCTGAAGCGtg < 1:2461138/149‑1 (MQ=255) tATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGATTGCATAAATATACATTAGCTGAAGCGtga < 1:861294/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |