Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 1,136,758 | T→A | 10.7% | A1022A (GCA→GCT) | rne ← | fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA‑binding protein/RNA degradosome binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,136,758 | 0 | T | A | 10.7% | 818.5 / 74.9 | 244 | A1022A (GCA→GCT) | rne | fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA‑binding protein/RNA degradosome binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (107/111); new base A (13/13); total (120/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CCAGGGCTTGATTACTTTGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAGCGCGCGTCATTGGCGCGGTAGCGTGGTTATGCTCAACGGTGACCTCAGGTTCGACCGCAGCTACCGTTTCAACTTCTGCTGCGACTTCAGCGACTACTGGCGCGGCAGGTTGAGCAAC > CP009273/1136610‑1136904 | ccAGGGCTTGATTACTTTGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGt > 2:4023970/1‑149 (MQ=255) cAGGGCTTGATTACTTTGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTg > 1:1683019/1‑149 (MQ=255) aGGGCTTGATTACTTTGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGc > 2:2424629/1‑149 (MQ=255) aGGGCTTGATTACTTTGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGc < 2:2168697/149‑1 (MQ=255) gCTTGATTACTTTGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTc < 1:4057160/149‑1 (MQ=255) cTTGATTACTTTGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTcc > 2:315652/1‑149 (MQ=255) cTTGATTACTTTGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTcc > 1:752035/1‑149 (MQ=255) cTTTGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACata > 2:3316988/1‑149 (MQ=255) tttGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACatat > 2:2053443/1‑149 (MQ=255) tttGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACatat > 1:2712485/1‑149 (MQ=255) tttGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACatat < 2:3768281/149‑1 (MQ=255) ttGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATAtt < 1:3015670/149‑1 (MQ=255) ttGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATAtt < 2:2004844/149‑1 (MQ=255) ttGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATAtt < 1:470644/149‑1 (MQ=255) tGAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTc < 1:3866637/149‑1 (MQ=255) gAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTcc < 2:48961/149‑1 (MQ=255) gAGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGAGCCTCCGGAACATATTcc < 1:1978380/149‑1 (MQ=255) aGCTAATTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCg < 1:1994160/149‑1 (MQ=255) 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aaTTATTACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGc > 1:1861624/1‑149 (MQ=255) attattACTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCt > 2:1773787/1‑149 (MQ=255) ttattaCTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTg > 1:2403820/1‑149 (MQ=255) ttaCTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAg > 2:154853/1‑149 (MQ=255) cTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAgcgc > 2:4626575/1‑149 (MQ=255) cTCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAgcgc > 2:273485/1‑149 (MQ=255) tCAACAGGTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAgcgcg > 1:1539526/1‑149 (MQ=255) ggTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAGCGCGCGTCAt < 1:3370172/149‑1 (MQ=255) ggTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAGCGCGCGTCAt > 1:943127/1‑149 (MQ=255) gTTGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAGCGCGCGTCAtt > 1:4173515/1‑149 (MQ=255) ttGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAGCGCGCGTCATTg < 2:2585875/149‑1 (MQ=255) tGCGGACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAGCGCGCGTCATTgg < 2:1725163/149‑1 (MQ=255) ggACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAGCGCGCGTCATTGgcgc < 2:1954919/149‑1 (MQ=255) ggACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAGCGCGCGTCATTGgcgc < 2:4279880/149‑1 (MQ=255) gACGCGCAGGAGCGGCAGAGGCATGATGTGTTGCCGTATGACCACCTGCGGCACCTTTACCTTCGAAGGCAAAAGTAGGGCGCTGCCAGTCACTGTGACGCGGTGCCTCCGGAACATATTCCGGTGCTGGAGCGCGCGTCATTGGcgcg > 2:3555431/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |