Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,207,977 | 0 | C | A | 13.9% | 641.3 / 17.3 | 217 | intergenic (‑518/+182) | iraM/ycgX | RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor/DUF1398 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (53/123); new base A (39/2); total (92/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-15 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |