| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,210,957 | C→A | 6.9% | intergenic (‑26/‑288) | bluF ← / → ycgZ | anti‑repressor for YcgE, blue light‑responsive; FAD‑binding; has c‑di‑GMP phosphodiesterase‑like EAL domain, but does not degrade c‑di‑GMP/RcsB connector protein for regulation of biofilm and acid‑resistance |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,210,957 | 0 | C | A | 6.9% | 982.9 / 38.8 | 259 | intergenic (‑26/‑288) | bluF/ycgZ | anti‑repressor for YcgE, blue light‑responsive; FAD‑binding; has c‑di‑GMP phosphodiesterase‑like EAL domain, but does not degrade c‑di‑GMP/RcsB connector protein for regulation of biofilm and acid‑resistance |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (125/116); new base A (9/9); total (134/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.63e-01 | |||||||||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
CAGTAAGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAATGATGCAATAT > CP009273/1210809‑1211105 | cAGTAAGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGc < 1:847154/149‑1 (MQ=255)cAGTAAGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGc < 1:596491/149‑1 (MQ=255) aGTAAGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCg > 2:1343675/1‑149 (MQ=255) aGTAAGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCg > 2:4150118/1‑149 (MQ=255) gTAAGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCga < 2:2446369/149‑1 (MQ=255) gTAAGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCga > 1:2675320/1‑149 (MQ=255) aGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATTGGTGATGCGagag > 2:4082112/1‑149 (MQ=255) aGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGagag > 1:4650330/1‑149 (MQ=255) aGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGagag > 1:2309036/1‑149 (MQ=255) gATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGt < 1:4049709/149‑1 (MQ=255) aTCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAAGGGGTGAGGCGAGAGTa > 1:2275792/1‑149 (MQ=255) tCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTCATGGGTGAGGAGAGAGTaa > 2:678054/1‑149 (MQ=255) tCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTaa > 2:4673947/1‑149 (MQ=255) tCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTaa < 2:3728038/149‑1 (MQ=255) tCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGAGAGAGTaa < 2:524846/149‑1 (MQ=255) tCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGAGAGAGTaa < 2:4060955/149‑1 (MQ=255) ccTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGa > 2:2278310/1‑149 (MQ=255) cTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGAc < 2:82431/149‑1 (MQ=255) cTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGAc < 2:2780645/149‑1 (MQ=255) gTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACgg > 1:3305418/1‑149 (MQ=255) tACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATCAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTa > 1:4492097/1‑149 (MQ=255) aCGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGAGAGAGTAAGACGGTaa < 2:931412/149‑1 (MQ=255) gTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGAGAGAGTAAGACGGTAACa < 2:879658/149‑1 (MQ=255) tCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAg > 1:4226116/1‑149 (MQ=255) aGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGAc < 1:865508/149‑1 (MQ=255) gACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACa > 1:289030/1‑149 (MQ=255) aCTGCATGTTACTGAGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACATTTTAGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGTTTTGTAAGCATTAACATTCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACat < 2:370139/149‑1 (MQ=255) cTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACata < 2:2541545/149‑1 (MQ=255) cTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACata > 1:1491862/1‑149 (MQ=255) cTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACata < 2:3499482/149‑1 (MQ=255) gCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATAtc < 2:1091878/149‑1 (MQ=255) gCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATAtc < 2:3427183/149‑1 (MQ=255) gCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATAtc < 2:3344573/149‑1 (MQ=255) gCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGtc < 1:3786842/149‑1 (MQ=255) gATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTCATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGtctt > 1:2923626/1‑149 (MQ=255) tttGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGtctttc < 1:502847/149‑1 (MQ=255) ttGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGtctttct > 1:1793932/1‑149 (MQ=255) ttGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGtctttct < 1:2757747/149‑1 (MQ=255) ttGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGtctttct > 1:1982687/1‑149 (MQ=255) ttGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGtctttct < 1:2708506/149‑1 (MQ=255) cgaTCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCTCGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCtttt < 2:262184/147‑1 (MQ=255) cTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCtttt < 1:1928211/149‑1 (MQ=255) cTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCtttt > 2:2088306/1‑149 (MQ=255) tATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTCATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTa > 2:2306875/1‑149 (MQ=255) tCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAAt > 1:1695907/1‑149 (MQ=255) cGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATa < 2:288691/149‑1 (MQ=255) gAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATAc > 2:4252507/1‑149 (MQ=255) gAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATAc < 1:1018039/149‑1 (MQ=255) ccATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCaaa > 2:2236567/1‑149 (MQ=255) ttcttcGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACAt > 1:3758177/1‑149 (MQ=255) ttcttcGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACAt < 2:1453862/149‑1 (MQ=255) tcttcGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATa > 2:2652653/1‑149 (MQ=255) gttttttttGTGTGGTTCTTCGTCTCGTTTATGGCTAAGATATTTTTGGGTTGTTAGCTTTAACAATCCTGGGTATTGGGTGAGGCGAGAGTAAGTCGGTTTGAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTATTAGGAAAACATAAGCGt < 2:1301132/147‑1 (MQ=255) tttttttGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGttt > 1:460254/1‑149 (MQ=255) tttGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCttt > 2:2982469/1‑149 (MQ=255) tttGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCttt < 2:4307236/149‑1 (MQ=255) tttGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCttt < 2:491245/149‑1 (MQ=255) ttGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGGCATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTa < 2:2117492/149‑1 (MQ=255) ttGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTAAGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTa < 1:4306270/149‑1 (MQ=255) gACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACa > 2:3359771/1‑149 (MQ=255) cAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACAtt < 1:1199900/149‑1 (MQ=255) cAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGAGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACAtt < 1:572523/149‑1 (MQ=255) aGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTg > 2:3889871/1‑149 (MQ=255) gTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGAt < 2:201499/149‑1 (MQ=255) ttCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATa > 1:3411090/1‑149 (MQ=255) cgtcACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATaaaaaa < 2:4408512/149‑1 (MQ=255) tcACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATg > 1:1807397/1‑149 (MQ=255) aCGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGa > 2:220173/1‑149 (MQ=255) gCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGa < 1:2236567/149‑1 (MQ=255) tACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAac < 2:3049143/149‑1 (MQ=255) cGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAacac < 2:1167788/149‑1 (MQ=255) taaataaGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAg > 1:928259/1‑149 (MQ=255) taaataaGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAg > 1:3909697/1‑149 (MQ=255) aaataaGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGAGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGt > 1:4173735/1‑149 (MQ=255) taaGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTgg > 2:1800899/1‑149 (MQ=255) taaGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTgg > 2:1830559/1‑149 (MQ=255) aaGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGc > 2:2592947/1‑149 (MQ=255) ttttAAGAATTAACAATCCAGGGTAATGTGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATATTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGaaaa < 1:3522217/146‑1 (MQ=255) gtAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAAt < 1:1283696/149‑1 (MQ=255) tAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATc > 2:3290712/1‑149 (MQ=255) gCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTg > 2:4537527/1‑149 (MQ=255) cATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGt > 1:3061438/1‑149 (MQ=255) cAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGAt < 2:1491862/149‑1 (MQ=255) aaTCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGAtt < 1:1088248/149‑1 (MQ=255) aaTCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGAtt > 2:3253325/1‑149 (MQ=255) cAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCa > 1:1656417/1‑149 (MQ=255) ggTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGtt > 1:4400352/1‑149 (MQ=255) ggTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGtt > 1:4196339/1‑149 (MQ=255) gTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTa > 1:2423079/1‑149 (MQ=255) aaTGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTaaa > 1:3247994/1‑149 (MQ=255) tGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAatg < 2:460254/149‑1 (MQ=255) tGGGTGAGGAGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAatg > 2:1982453/1‑149 (MQ=255) gggTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTACTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGAATGTCAGTTAAatga > 2:3561840/1‑149 (MQ=255) aGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATCTCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAATGATGCaa < 2:3820949/149‑1 (MQ=255) aGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAATGATGCaa < 1:3101830/149‑1 (MQ=255) ggCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAATGATGCAat < 1:2035829/149‑1 (MQ=255) ggCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAATGATGCAat > 2:2574672/1‑149 (MQ=255) ggCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAATGATGCAat > 1:2180572/1‑149 (MQ=255) ggCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAATGATGCAat < 1:1541596/149‑1 (MQ=255) gCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAATGATGCAata > 1:4020372/1‑149 (MQ=255) | CAGTAAGATCCCTGTTACGTCAGACTGCATGTTCCTGCGATTTGCTATCGAAACCATTTCTTCGATTTTTTTGACAGGTTCGTCGTCACGTATATGGCTACGATAAATAAGGGTGGTAAGCATTAACAATCCAGGGTAATGGGTGAGGCGAGAGTAAGACGGTAACAGACATATCTTCTTGTGTCTTTCTTTTAATACCAAAACATAACCGTTTCTTTACATTGATAAAAAATGGAAAAAGTTGAACACTAGTTGGCGAAAAATCTTGTATAGATTGTCAGTTAAATGATGCAATAT > CP009273/1210809‑1211105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |