Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 1,748,094 | T→A | 16.3% | intergenic (‑7/+14) | ydhV ← / ← ydhY | putative oxidoreductase subunit/putative 4Fe‑4S ferridoxin‑type protein; FNR, Nar, NarP‑regulated protein; putative subunit of YdhYVWXUT oxidoreductase complex |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,748,094 | 0 | T | A | 16.3% | 732.5 / 125.6 | 251 | intergenic (‑7/+14) | ydhV/ydhY | putative oxidoreductase subunit/putative 4Fe‑4S ferridoxin‑type protein; FNR, Nar, NarP‑regulated protein; putative subunit of YdhYVWXUT oxidoreductase complex |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (133/77); new base A (24/17); total (157/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.99e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
CTGGCGGTACTTCGTCATACATAATTTTGTAGCCGAAGCCCATGCCACCGACAAAACTTTTAAACTTACTGGAATCTTCGAGGGTAATATTTCCTGTCGTGAGATTGACTCTTAATATATTACCTGTCCAACCGTTAGCCATGATTTTTTCCTTTGCAAGATTCACACAGTAATATCTTTCCACTCGATAATTTTTAACGCCCCTGTTGGGCAGGCGTTTGCGCATTCACCGCATAACACACATTTCGAGGATTTTTTACTTTCGGTATTTACGGTGGCCATCATCCACGGGCATGC > CP009273/1747946‑1748242 | cTGGCGGTACTTCGTCATACATAATTTTGTAGCCGAAGCCCATGCCACCGACAAAACTTTTAAACTTACTGGAATCTTCGAGGGTAATATTTCCTGTCGTGAGATTGACTCTTAATATATTACCTGTCCAACCGTTAGCCATGAttttt < 1:3318049/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTACTTCGTCATACATAATTTTGTAGCCGAAGCCCATGCCACCGACAAAACTTTTAAACTTACTGGAATCTTCGAGGGTAATATTTCCTGTCGTGAGATTGACTCTTAATATATTACCTGTCCAACCGTTAGCCATGAttttt > 1:2849098/1‑149 (MQ=255) cTTCGTCATACATAATTTTGTAGCCGAAGCCCATGCCACCGACAAAACTTTTAAACTTACTGGAATCTTCGAGGGTAATATTTCCTGTCGTGAGATTGACTCTTAATATATTACCTGTCCAACCGTTAGCCATGATTTTTTCCTTTGCa > 1:2703551/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |