| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 158,967 | C→A | 8.7% | H126N (CAT→AAT) | hrpB → | putative ATP‑dependent helicase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 158,967 | 0 | C | A | 8.7% | 1130.5 / 60.8 | 300 | H126N (CAT→AAT) | hrpB | putative ATP‑dependent helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (130/144); new base A (15/11); total (145/155) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
AGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGT > CP009273/158819‑159112 | gCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTAAt < 2:4097758/149‑1 (MQ=255) gCGATACCGTAGGCTACCGGATGAGTGCGCAAAACTGCGTCGGTAAGAATACCCGCATGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTTCTGACGCTCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGAGATCCTTGATGAATTTCAt > 2:4269200/1‑149 (MQ=255) gATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGa < 2:92373/149‑1 (MQ=255) gATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGAGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTAATGa < 1:2219319/149‑1 (MQ=255) aTACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAg > 2:548958/1‑149 (MQ=255) ccGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAgcgc > 1:326381/1‑149 (MQ=255) cGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCa < 1:1341045/149‑1 (MQ=255) ttGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGc < 1:667482/149‑1 (MQ=255) tGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGTAGTGGTTACCGTAGGCGTGCTGACGCGCATGCTCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCt < 2:3962693/149‑1 (MQ=255) tGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCt > 1:1167442/1‑149 (MQ=255) tACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCa > 2:485963/1‑149 (MQ=255) ccGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAgg < 1:4560822/149‑1 (MQ=255) gcAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgt < 2:3324180/149‑1 (MQ=255) gcAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTAATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgt > 1:4029196/1‑149 (MQ=255) cAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgtt < 1:3631494/149‑1 (MQ=255) cAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgtt > 1:4225978/1‑149 (MQ=255) aaCTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgttggc < 1:3202031/149‑1 (MQ=255) aaCTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgttggc < 1:2312270/149‑1 (MQ=255) aCTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATttggcgttggcg > 1:1729163/1‑149 (MQ=255) gTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGtt < 1:738689/149‑1 (MQ=255) cGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGTGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTAc < 2:813008/149‑1 (MQ=255) ggCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTc > 1:792665/1‑149 (MQ=255) gAATACCCGCCTGGAAGTGGGTCCCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATGTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGAtg < 2:4197132/149‑1 (MQ=255) aaTACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGAtgt > 2:2966439/1‑149 (MQ=255) tACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGc > 2:2251940/1‑149 (MQ=255) cccGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGcaa < 2:3870724/149‑1 (MQ=255) cccGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGcaa > 2:3151315/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGcaac < 1:397490/149‑1 (MQ=255) gCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGcaacaa < 1:176514/149‑1 (MQ=255) ccTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAg < 1:3002606/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAgg < 1:3076389/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAgg < 1:2606598/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAgg < 2:4296863/149‑1 (MQ=255) tGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGt > 2:121250/1‑149 (MQ=255) tGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGt < 1:2667433/149‑1 (MQ=255) ggAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTc < 2:913030/149‑1 (MQ=255) gAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCt < 1:3270602/149‑1 (MQ=255) gTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCg > 2:2645476/1‑149 (MQ=255) gTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtga < 1:2851103/149‑1 (MQ=255) gTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtga < 1:4305347/149‑1 (MQ=255) ttACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGAGTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtgat > 2:2472026/1‑149 (MQ=255) tACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtgatg > 1:2998976/1‑149 (MQ=255) aCCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtgatga < 2:4601422/149‑1 (MQ=255) aCCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTAATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtgatga > 1:1892022/1‑149 (MQ=255) ccGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATTCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGAc < 2:3554839/149‑1 (MQ=255) cGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGCTTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGAcc > 2:2859345/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGAcc > 1:567202/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCt < 2:1989677/149‑1 (MQ=255) gAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCt < 2:3691613/149‑1 (MQ=255) aaGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCtt > 1:1978990/1‑149 (MQ=255) aGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTa > 2:4345927/1‑149 (MQ=255) gCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTaaa < 2:217309/149‑1 (MQ=255) tGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAActg > 2:3751968/1‑149 (MQ=255) cATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGTGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGt < 1:1775534/149‑1 (MQ=255) cATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGTGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGt < 1:1775579/149‑1 (MQ=255) cATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGt < 2:637396/149‑1 (MQ=255) cATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGt < 1:1685454/149‑1 (MQ=255) gATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCgg > 2:1117347/1‑149 (MQ=255) gATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCgg < 1:2887505/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGc > 1:2276992/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCt < 1:1396046/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCt < 1:2395707/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCt < 1:2943070/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCt < 1:954406/149‑1 (MQ=255) aGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAcc > 2:1077775/1‑149 (MQ=255) aGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAcc < 2:2379605/149‑1 (MQ=255) gCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAccc > 2:3289567/1‑149 (MQ=255) cGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCt < 2:4024434/149‑1 (MQ=255) gACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 2:2453955/1‑149 (MQ=255) gACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa < 1:4662206/149‑1 (MQ=255) aCCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGAc < 2:1679228/149‑1 (MQ=255) cGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAAc < 2:2729042/149‑1 (MQ=255) cGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAAc > 1:2686977/1‑149 (MQ=255) gAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGa > 1:2552065/1‑149 (MQ=255) gAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGa > 1:1568904/1‑149 (MQ=255) tGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGc > 1:373149/1‑149 (MQ=255) tGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGc < 2:3637337/149‑1 (MQ=255) tGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTAATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGc < 1:2147409/149‑1 (MQ=255) gAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCt > 1:4151701/1‑149 (MQ=255) aGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCtt < 2:3058883/149‑1 (MQ=255) aGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCtt > 2:4388142/1‑149 (MQ=255) gtgtTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcag > 2:1346689/1‑149 (MQ=255) gtTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagca > 1:351054/1‑149 (MQ=255) gtTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagca > 2:1820219/1‑149 (MQ=255) ttGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCaa > 1:3558199/1‑149 (MQ=255) tGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCaaa < 2:3822612/149‑1 (MQ=255) tGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCaaa < 2:2139855/149‑1 (MQ=255) aCTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAAtgc < 2:2809792/149‑1 (MQ=255) ggTGATCCTTGTTGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTAGGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAAtgctgc < 2:1279668/149‑1 (MQ=255) tGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCa > 2:3179456/1‑149 (MQ=255) gATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAg > 2:1001231/1‑149 (MQ=255) tCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGaa < 1:3356677/149‑1 (MQ=255) tCCTTGATGAATTTAATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGaa > 1:273522/1‑149 (MQ=255) tgatgaATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAgcgc < 1:1625720/149‑1 (MQ=255) atgaATTTAATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCt < 1:864529/149‑1 (MQ=255) aaTTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTgtc > 1:3128464/1‑149 (MQ=255) tttCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTgtcgt > 1:2913953/1‑149 (MQ=255) tttCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTgtcgt > 2:1670322/1‑149 (MQ=255) tttCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTgtcgt > 1:4630704/1‑149 (MQ=255) tttAATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTgtcgt > 2:2607349/1‑149 (MQ=255) | AGGCGATACCGTTGGCTACCGGATGCGTGCGCAAAACTGCGTCGGGCCGAATACCCGCCTGGAAGTGGTTACCGAAGGCGTGCTGACGCGCATGATCCAGCGTGACCCGGAACTGAGCGGTGTTGGACTGGTGATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCGT > CP009273/158819‑159112 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |