| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,094,183 | G→A | 6.9% | intergenic (‑96/+80) | ansB ← / ← yggN | periplasmic L‑asparaginase 2/DUF2884 family putative periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,094,183 | 0 | G | A | 6.9% | 966.8 / 40.1 | 276 | intergenic (‑96/+80) | ansB/yggN | periplasmic L‑asparaginase 2/DUF2884 family putative periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (134/123); new base A (7/12); total (141/135) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
CCACTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTT > CP009273/3094035‑3094331 | ccacTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGgag < 1:4172116/149‑1 (MQ=255) cacTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGgaga > 2:320811/1‑149 (MQ=255) acTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGAt < 1:2517806/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |