| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,642,571 | T→G | 6.3% | L93V (TTG→GTG) | arsB → | arsenite/antimonite transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,642,571 | 0 | T | G | 6.3% | 690.4 / 5.8 | 239 | L93V (TTG→GTG) | arsB | arsenite/antimonite transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (103/115); new base G (18/3); total (121/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.30e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
GGGTGATATTCCGGTGGTGTGGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGTTCGTGATGGC > CP009273/3642423‑3642719 | gggTGATATTCCGGTGGTGTGGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCt < 1:3157440/149‑1 (MQ=255) ggTGATATTCCGGTGGTGTGGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCtt < 2:3397438/149‑1 (MQ=255) gTGATATTCCGGTGGTGTGGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTg < 1:1205039/149‑1 (MQ=255) gTGATATTCCGGTGGTGTGGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTg < 2:602806/149‑1 (MQ=255) atTCCGGTGGTGTGGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGtt > 1:1922750/1‑149 (MQ=255) ttCCGGTGGTGTGGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGttt > 1:2060266/1‑149 (MQ=255) tCCGGTGGTGTGGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTa < 2:3853169/149‑1 (MQ=255) gtgtGGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGAt > 2:2037421/1‑149 (MQ=255) tgGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCATGATTGt > 1:1724391/1‑149 (MQ=255) ggAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTc < 1:3143159/149‑1 (MQ=255) gAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTcc < 2:2061694/149‑1 (MQ=255) atCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCAGCt > 1:3635740/1‑149 (MQ=255) tCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTc < 1:3562831/149‑1 (MQ=255) tCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTc < 2:4554198/149‑1 (MQ=255) tCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGt > 2:3753213/1‑149 (MQ=255) tCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTACTGCTCGGt > 2:841184/1‑149 (MQ=255) ggAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGtgct < 1:1189313/149‑1 (MQ=255) aCGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGcc > 1:1866151/1‑149 (MQ=255) cgACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGtt < 1:2236177/149‑1 (MQ=255) gACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTACTGGTCGTGGTCGCTTTCAGTTTAACAGGATTTTACAGCTAGGTGCAGCCGttt > 1:492590/1‑148 (MQ=255) ggCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTgccg > 2:173910/1‑149 (MQ=255) tGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGccc < 2:3011427/149‑1 (MQ=255) gCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCt < 1:3190703/149‑1 (MQ=255) cGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTg < 1:130680/149‑1 (MQ=255) gTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGACTGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGt < 2:2837428/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGc > 1:2954488/1‑149 (MQ=255) tCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTTcc > 1:3459880/1‑149 (MQ=255) tCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCGTGCTGTTTACCAGGATTTTACAGCTCGGGGCTGACCGTGACGCCCGGTTTTcc > 1:4399791/1‑149 (MQ=255) gCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCaa > 2:4152503/1‑149 (MQ=255) gCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCaa < 1:938626/149‑1 (MQ=255) ccGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCAGGAATGTCCTGCTCCGTGCTGCCGTTGCCGCCCGGGTTGCCaaa > 1:851404/1‑148 (MQ=255) ccGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCGTGGTGTTTTACATGATTGTACAGCGCGGTTCTGGCGTTGCCGCCCAGTTTTCCaaa > 1:590690/1‑148 (MQ=255) cGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAatg < 1:1008366/149‑1 (MQ=255) cGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCATGTTTGCCAatg < 1:3546388/149‑1 (MQ=255) gTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAatga < 2:3636470/149‑1 (MQ=255) tCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAatgat < 2:656043/149‑1 (MQ=255) tCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAatgat < 1:4289823/149‑1 (MQ=255) tCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAatgat < 1:1230721/149‑1 (MQ=255) cATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCAGTTTGCCAatgatg > 2:3985117/1‑149 (MQ=255) aTTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATgg < 1:160651/149‑1 (MQ=255) ttATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGAGggc > 2:4428827/1‑149 (MQ=255) tATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTTTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATggcg > 1:2494391/1‑149 (MQ=255) aGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCt < 2:114403/149‑1 (MQ=255) 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gAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGAt > 1:3852569/1‑149 (MQ=255) gAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAAAGATTGCGCGGCGCGTATTTTGACACCGAt > 1:2623267/1‑149 (MQ=255) aGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGAtt < 1:3309060/149‑1 (MQ=255) aGTCCGGCTTTTTTGAAGGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGAtt < 2:2466691/149‑1 (MQ=255) gTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTg < 1:4361229/149‑1 (MQ=255) gTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTg > 2:3077355/1‑149 (MQ=255) ggCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCGGTTTACCTGGATTGTCCATCTCGGTGCTGCCGTTTCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGAGCGGCGCTTATTTTGAAACAGATTGTAAt > 2:1905333/1‑149 (MQ=255) gCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATc > 2:2709168/1‑149 (MQ=255) gCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCGGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCGGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACCCCGATTGTCATc > 2:918708/1‑149 (MQ=255) ttttttGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTAACTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCAGTTTTCCAATGATGGCGCGGCGCGTATTTTGACACCCATTGTCATCGc > 1:1404812/1‑149 (MQ=255) tttttGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGcc < 2:3779045/149‑1 (MQ=255) ttttGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCa < 2:2552188/149‑1 (MQ=255) tGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCAtgc < 1:4562670/149‑1 (MQ=255) tGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCAtgc < 1:2294430/149‑1 (MQ=255) aTGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCAtgctgc < 2:1655316/149‑1 (MQ=255) 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< 2:2129401/149‑1 (MQ=255) ggcgCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCtt < 2:3537389/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCAGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGGTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCtgt > 2:1301920/1‑147 (MQ=255) gcTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAg < 1:2505241/149‑1 (MQ=255) tGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGTTGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAggg > 1:780909/1‑149 (MQ=255) gCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGt < 1:3644994/149‑1 (MQ=255) 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aaTGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCAGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCGGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATATTGACACCGATTGTCATCGCCAAGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCt > 2:2653124/1‑149 (MQ=255) cgtggtcgCGTGCTGTTGACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGtt < 1:802205/149‑1 (MQ=255) gtggtcgCTTGCTGTTTACCAGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCGTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGTTc > 2:481753/1‑149 (MQ=255) ggtcgCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGTTCGt > 2:3699083/1‑149 (MQ=255) ggtcgCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGTTCGt < 1:2602940/149‑1 (MQ=255) ggtcgCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGTTCGt > 2:2272825/1‑149 (MQ=255) tcgCTTGCTGTTTACCTTGATTGTCCTTCTCGGTGCTGCCGTTTCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCAGCAGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCAATAAGCTGGCGTTAGTGa > 2:153014/1‑149 (MQ=255) gCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGTTCGTGATg < 2:3993118/149‑1 (MQ=255) gCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGTTCGTGATg < 2:1207887/149‑1 (MQ=255) ttGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGTTCGTGATggc > 2:728824/1‑149 (MQ=255) ttGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGTTCGTGATggc > 2:1407313/1‑149 (MQ=255) | GGGTGATATTCCGGTGGTGTGGAATATCGTCTGGAACGCGACGGCTGCGTTTATCGCCGTCATTATCATCAGCCTGCTGCTGGATGAGTCCGGCTTTTTTGAATGGGCGGCGCTGCACGTCTCACGCTGGGGTAATGGTCGTGGTCGCTTGCTGTTTACCTGGATTGTCCTGCTCGGTGCTGCCGTTGCCGCCCTGTTTGCCAATGATGGCGCGGCGCTTATTTTGACACCGATTGTCATCGCCATGCTGCTGGCTTTAGGGTTCAGTAAAGGCACTACGCTGGCGTTCGTGATGGC > CP009273/3642423‑3642719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |