| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,915,397 | A→C | 7.2% | N5K (AAT→AAG) | atpB ← | F0 sector of membrane‑bound ATP synthase, subunit a |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,915,397 | 0 | A | C | 7.2% | 905.4 / 53.1 | 275 | N5K (AAT→AAG) | atpB | F0 sector of membrane‑bound ATP synthase, subunit a |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (131/124); new base C (7/13); total (138/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
ACAGACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAACACCAACAT > CP009273/3915249‑3915545 | acaGACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCata < 1:2810418/149‑1 (MQ=255)acaGACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATAGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCAACAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGACGGTTATTCAGGTGGTGTCCTAAGTAATCCTGCGGCGTCata > 2:3416516/1‑149 (MQ=255) aGACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGACTGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATAtt > 1:1745089/1‑149 (MQ=255) aGACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCtt < 2:92696/149‑1 (MQ=255) aCCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCTCTAGTGTTTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCTGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATAtttt < 2:2339416/149‑1 (MQ=255) aCCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATAtttt > 2:1359269/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATACACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGATGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATAtttt > 1:3766333/1‑149 (MQ=255) cccAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTc < 2:2533229/149‑1 (MQ=255) cccAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTc < 1:2368740/149‑1 (MQ=255) ccaccGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGcc > 2:4659315/1‑149 (MQ=255) ccaccGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGcc > 1:1467470/1‑149 (MQ=255) ccaccGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGcc < 2:2605576/149‑1 (MQ=255) caccGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCa < 1:4538318/149‑1 (MQ=255) accGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCat < 1:4135033/149‑1 (MQ=255) cGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCatga > 2:3553291/1‑149 (MQ=255) cGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATCTTCTGAAGCCatga < 2:161487/149‑1 (MQ=255) gagaAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCatgat < 1:1813702/149‑1 (MQ=255) agaagaACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCatgatg > 1:1136889/1‑149 (MQ=255) agaagaACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCatgatg > 2:1655229/1‑149 (MQ=255) agaagaACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCatgatg > 1:2498988/1‑149 (MQ=255) agaaCATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCt < 2:3011578/149‑1 (MQ=255) agaaCATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCt > 1:2264230/1‑149 (MQ=255) aaCATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCttt > 2:4599551/1‑149 (MQ=255) aaCATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCttt < 1:2438234/149‑1 (MQ=255) aCATGGAGTCAATAGTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCtttt < 1:621477/149‑1 (MQ=255) ggAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTAccc < 2:4568849/149‑1 (MQ=255) gAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCt < 1:1282966/149‑1 (MQ=255) tatTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTtgttgt > 1:4189910/1‑149 (MQ=255) attgattgTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTgttgtt > 2:1165629/1‑149 (MQ=255) gattgTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAAt > 2:2930935/1‑149 (MQ=255) gattgTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAAt < 2:118725/149‑1 (MQ=255) attgTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAAtt > 2:2429803/1‑149 (MQ=255) attgTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAAtt < 1:815284/149‑1 (MQ=255) gTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACa > 2:74731/1‑149 (MQ=255) cAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGcc > 2:1468768/1‑149 (MQ=255) cAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGcc > 1:3055222/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCgg > 1:3466025/1‑149 (MQ=255) aGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTg > 2:4335765/1‑149 (MQ=255) tGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCa > 2:1922016/1‑149 (MQ=255) ggggggTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATc < 1:1377092/149‑1 (MQ=255) gggggTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCt < 2:3131186/149‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGaa > 1:4211576/1‑149 (MQ=255) ttttGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAacc > 1:4640204/1‑149 (MQ=255) ttGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAaccac < 1:3283090/149‑1 (MQ=255) ccaccaGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCa > 1:3397217/1‑149 (MQ=255) ccaGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCaaaa > 2:531968/1‑149 (MQ=255) caGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAAc < 2:1004673/149‑1 (MQ=255) gCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAAccc < 2:4202266/149‑1 (MQ=255) gCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAAGTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAAccc < 2:1977310/149‑1 (MQ=255) gagaATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCAc < 1:936025/149‑1 (MQ=255) gaATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGt < 2:3744439/149‑1 (MQ=255) aTGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTaa > 1:741507/1‑149 (MQ=255) aTGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTaa > 1:4068050/1‑149 (MQ=255) aCGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGAt > 1:1608193/1‑149 (MQ=255) aCGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGAt < 2:2861664/149‑1 (MQ=255) aCGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGAt < 1:2224217/149‑1 (MQ=255) aCGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGAt > 2:2231852/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCa < 1:3329164/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCa > 1:389087/1‑149 (MQ=255) cAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAg > 1:1177605/1‑149 (MQ=255) cAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAg < 2:3722612/149‑1 (MQ=255) tCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGc > 2:1762470/1‑149 (MQ=255) tCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGc > 2:1493382/1‑149 (MQ=255) gCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGa > 1:167720/1‑149 (MQ=255) cTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGaa < 2:2498988/149‑1 (MQ=255) aaGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATAc < 1:2874204/149‑1 (MQ=255) aaGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATAc < 1:534060/149‑1 (MQ=255) aGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATAcc > 1:2966180/1‑149 (MQ=255) aGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATAcc > 2:1696843/1‑149 (MQ=255) aGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATAcc < 1:158742/149‑1 (MQ=255) ggTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCg > 1:437928/1‑149 (MQ=255) tATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCt < 1:4031356/149‑1 (MQ=255) aTTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCtt > 2:4271180/1‑149 (MQ=255) ttCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCttt > 1:624621/1‑149 (MQ=255) ttCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCttt < 1:1887639/149‑1 (MQ=255) ttCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCttt > 2:1058327/1‑149 (MQ=255) aGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTaaa > 1:247239/1‑149 (MQ=255) ggtggtGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTCACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTaaaa > 2:3925189/1‑149 (MQ=255) ggtggtGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTaaaa > 1:3702255/1‑149 (MQ=255) ggtggtGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTaaaa > 2:2083488/1‑149 (MQ=255) ggtggtGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTaaaa < 2:2808960/149‑1 (MQ=255) ggtggtGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTaaaa > 2:4425460/1‑149 (MQ=255) gtggtgTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAAc < 2:4066494/149‑1 (MQ=255) gtgtCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGc < 1:202429/149‑1 (MQ=255) gtgtCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGc > 2:4360397/1‑149 (MQ=255) tgtCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGcc < 1:3705844/149‑1 (MQ=255) tCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCaa < 1:4391174/149‑1 (MQ=255) ccTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAAc < 2:662227/149‑1 (MQ=255) cTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACg > 2:3084317/1‑149 (MQ=255) tATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGc > 1:1918087/1‑149 (MQ=255) aTGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGcc < 1:3826990/149‑1 (MQ=255) aTGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGcc < 1:4332511/149‑1 (MQ=255) tAATCCTGCGGCGTCATCTTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGccacc > 2:1118012/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGccaccac > 2:1420633/1‑149 (MQ=255) tGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCATTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGt < 2:3362448/149‑1 (MQ=255) gcggcgTAATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTa < 1:3659730/149‑1 (MQ=255) gcgTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAaca > 2:272806/1‑149 (MQ=255) cgTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAacac > 1:3896688/1‑149 (MQ=255) cgTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAacac < 1:1067750/149‑1 (MQ=255) tatTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAACACCAACa < 2:3118588/149‑1 (MQ=255) | ACAGACCCAGCACCACCGAGAAGAACATGGAGTCAATATTGATTGTCCAGAAGGTGGCTGGGGGGTTTTGTGGATCCACCAGCGAGAATGTACGCAGGTCCAGCTGAAGGTTATTCAGGTGGTGTCCTATGTAATCCTGCGGCGTCATATTTTCTGAAGCCATGATGCCTTTTACCCTTTGTTGTTAATTACAGCCGGTGCCAGTATCTGAACCACCAGCACCAAAACCCACGTAACGATCAGCGGCAAGAATACCGCCTTTAAAACCGCCAACGCCACCACCAGTAACACCAACAT > CP009273/3915249‑3915545 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |