| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 339,660 | C→T | 5.2% | intergenic (+16/‑227) | yahK → / → yahL | aldehyde reductase, NADPH‑dependent, Zn‑containing, broad specificity/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 339,660 | 0 | C | T | 5.2% | 915.2 / 22.0 | 250 | intergenic (+16/‑227) | yahK/yahL | aldehyde reductase, NADPH‑dependent, Zn‑containing, broad specificity/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (98/139); new base T (6/7); total (104/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
TTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTA > CP009273/339512‑339808 | gcgcCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGATTGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATAccc < 2:867231/149‑1 (MQ=255) cgcCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCt < 2:1849408/149‑1 (MQ=255) cgcCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCt < 2:2896530/149‑1 (MQ=255) gcCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtg > 1:2131985/1‑149 (MQ=255) gcCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtg > 1:1950245/1‑149 (MQ=255) cGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtgtg < 2:968931/149‑1 (MQ=255) cGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtgtg < 2:1105775/149‑1 (MQ=255) cGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCtgtg > 2:1969483/1‑149 (MQ=255) gAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTgg < 1:1575011/149‑1 (MQ=255) aaCATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGt > 2:3971874/1‑149 (MQ=255) aCATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGtt < 1:3213571/149‑1 (MQ=255) tGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTaa < 1:24604/149‑1 (MQ=255) tGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTaa < 2:4280371/149‑1 (MQ=255) ggCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAAc < 1:1547738/149‑1 (MQ=255) gCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACa > 2:2232732/1‑149 (MQ=255) gCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACa > 1:1163600/1‑149 (MQ=255) tCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACatat < 2:1837358/149‑1 (MQ=255) cGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTCGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATAtt < 1:3288972/149‑1 (MQ=255) gTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTa < 1:363056/149‑1 (MQ=255) tGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTaa > 1:1819551/1‑149 (MQ=255) gCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACt > 1:417877/1‑149 (MQ=255) tGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTc < 2:1216856/149‑1 (MQ=255) tGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTc < 1:4458817/149‑1 (MQ=255) agaTGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCa > 1:3885393/1‑149 (MQ=255) agaTGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCa > 1:3885301/1‑149 (MQ=255) tgatTCGTGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATAGGTTTTTTATCTATAATCGCTCACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACtt < 2:4593342/149‑1 (MQ=255) atTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTaa < 2:1766138/149‑1 (MQ=255) ttCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAAc < 1:1345901/149‑1 (MQ=255) cGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACtt < 1:1414286/149‑1 (MQ=255) ccGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTa < 2:4609952/149‑1 (MQ=255) aaaTTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAg > 1:3544151/1‑149 (MQ=255) aaTTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATCTCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAgg > 2:2525641/1‑149 (MQ=255) ttAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGgag > 1:108485/1‑149 (MQ=255) ttAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATAAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGgag < 1:2891378/149‑1 (MQ=255) aaTGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGTTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGagag < 1:2655276/149‑1 (MQ=255) tGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCg > 2:2578944/1‑149 (MQ=255) gAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACAGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGa < 1:3165717/149‑1 (MQ=255) gCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAaat < 2:1362746/149‑1 (MQ=255) tGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAatat < 2:2284956/149‑1 (MQ=255) gCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCaa < 1:643258/149‑1 (MQ=255) cGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCaaa < 1:746796/149‑1 (MQ=255) gAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAg < 1:3651088/149‑1 (MQ=255) gAATGCTGCGCGGTGATGAGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGATAGCGAAATAATATCAAAg < 1:4240654/149‑1 (MQ=255) tgctgcGCGGTGATGTGAAATATCGCTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAg > 2:1728935/1‑149 (MQ=255) cgcgGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTa < 2:113827/149‑1 (MQ=255) gcgGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTaa > 2:710215/1‑149 (MQ=255) ggTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTaaaa < 1:2409316/149‑1 (MQ=255) tGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAAcc > 1:3950245/1‑149 (MQ=255) tGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAAcc < 1:3747190/149‑1 (MQ=255) tGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAAcc < 2:206382/149‑1 (MQ=255) tGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAAcc > 1:3613092/1‑149 (MQ=255) gATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCt < 1:887497/149‑1 (MQ=255) aTGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCta < 1:286168/149‑1 (MQ=255) aTGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCta < 2:445807/149‑1 (MQ=255) tgtgAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCtat < 2:3204903/149‑1 (MQ=255) tgtgAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCtat > 1:1364851/1‑149 (MQ=255) tgtgAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCtat < 1:3691448/149‑1 (MQ=255) gtgAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCtata < 2:1580843/149‑1 (MQ=255) gAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAAc < 2:2131985/149‑1 (MQ=255) aaTATCGTGTTGTTATCTATAATCTCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGATCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGt < 2:3576123/149‑1 (MQ=255) tatCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaa < 1:4147128/149‑1 (MQ=255) atCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaa < 2:850081/149‑1 (MQ=255) tctttttGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaat < 2:516663/146‑1 (MQ=255) tCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaat < 2:451939/149‑1 (MQ=255) tCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaat < 1:453876/149‑1 (MQ=255) tCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaat < 1:1948914/149‑1 (MQ=255) cGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaatt < 2:189009/149‑1 (MQ=255) cGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaatt < 1:2764824/149‑1 (MQ=255) tttGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaatttaa < 1:1304179/149‑1 (MQ=255) ttGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaatttaaa > 1:2325008/1‑149 (MQ=255) gTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGtaaatttaaatt > 2:2341029/1‑149 (MQ=255) ttATCTATAATCGCACACTATCAGACTGAAAAAATTAATTAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTg < 2:2725713/149‑1 (MQ=255) ttATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTg > 2:505966/1‑149 (MQ=255) aTCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGtt > 2:3156249/1‑149 (MQ=255) gATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTaaa < 1:4580627/149‑1 (MQ=255) aaTCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTa > 2:1218508/1‑149 (MQ=255) aaTCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTa > 1:1141643/1‑149 (MQ=255) aaTCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTa < 2:3849310/149‑1 (MQ=255) aTCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTaa > 2:1464683/1‑149 (MQ=255) aTCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTaa < 2:3918917/149‑1 (MQ=255) tCGCACACTAACAGACTTAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAAc < 1:3318669/149‑1 (MQ=255) tCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAAc < 2:576310/149‑1 (MQ=255) tCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAAc < 1:135064/149‑1 (MQ=255) cacaCTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGcc < 2:3114129/149‑1 (MQ=255) cTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATATCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTcc < 2:735503/149‑1 (MQ=255) cTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTcc < 1:4390691/149‑1 (MQ=255) aCAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGt > 1:2321958/1‑149 (MQ=255) cAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTa > 2:4223927/1‑149 (MQ=255) cAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTa < 2:2641767/149‑1 (MQ=255) cTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTAcaca > 1:1022680/1‑149 (MQ=255) cTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTAcaca > 1:3907675/1‑149 (MQ=255) tGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACaa > 1:2106218/1‑149 (MQ=255) tGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACaa < 1:2046104/149‑1 (MQ=255) aaaaaaTTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATa > 1:1684440/1‑149 (MQ=255) aaataCCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACgtt < 2:2053147/149‑1 (MQ=255) aataCCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACgtta < 2:4330965/149‑1 (MQ=255) aataCCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACgtta > 1:2615176/1‑149 (MQ=255) aataCCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACgtta < 2:3375603/149‑1 (MQ=255) aCCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACgttagtt > 1:1670245/1‑149 (MQ=255) cccTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACgttagtta < 2:386727/149‑1 (MQ=255) | TTGCGCCGAACATGGCATCGTGGCTGATATAGAGATGATTCGGGCCGATCAAATTAATGAAGCCTATGAGCGAATGCTGCGCGGTGATGTGAAATATCGTTTTGTTATCGATAATCGCACACTAACAGACTGAAAAAATTAATAAATACCCTGTGGTTTAACATATTAACTTCGCTCTCCACTTAACTTTTTAGTTAAGGAGAGCGAAATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTA > CP009273/339512‑339808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |