Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 13,327 | G→T | 6.3% | V389L (GTA→TTA) | dnaK → | chaperone Hsp70, with co‑chaperone DnaJ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 13,327 | 0 | G | T | 6.3% | 1057.3 / 32.9 | 275 | V389L (GTA→TTA) | dnaK | chaperone Hsp70, with co‑chaperone DnaJ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (153/104); new base T (12/6); total (165/110) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.26e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
GTTGGTGGTCAGACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGAAAAACACCACTATCCCGACCAAGCACAGCCAGGTGTTCTCTACCGCTGAAGACAACCAGTCTGCGGTAACCAT > CP009273/13180‑13475 | gTTGGTGGTCAGACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGt > 1:3921996/1‑149 (MQ=255) gTTGGTGGTCAGACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGt > 2:3697687/1‑149 (MQ=255) tggtggTCAGACTCGTATGCCAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTAc < 2:1353962/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |