| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,601,014 | T→C | 49.8% | intergenic (+194/‑199) | prfC → / → osmY | peptide chain release factor RF‑3/periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,601,014 | 0 | T | C | 49.8% | 8.5 / inf | 293 | intergenic (+194/‑199) | prfC/osmY | peptide chain release factor RF‑3/periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (72/75); new base C (72/74); total (144/149) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
CTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGC > CP009273/4600866‑4601161 | tccttATGAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGacat < 2:4192650/149‑1 (MQ=255) ttattaGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAg < 2:4465469/149‑1 (MQ=255) tattaGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGt < 2:2657172/149‑1 (MQ=255) tattaGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGt < 1:2842267/149‑1 (MQ=255) attaGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTa > 1:3778846/1‑149 (MQ=255) attaGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTa > 2:59316/1‑149 (MQ=255) attaGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAAAAAAGTGATGACAATTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTa > 1:4349451/1‑149 (MQ=255) ttaGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTAt < 2:240788/149‑1 (MQ=255) aGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCt > 1:104963/1‑149 (MQ=255) aGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCt > 2:4200431/1‑149 (MQ=255) gCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTa > 1:1796847/1‑149 (MQ=255) cgcgTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTaaa < 2:4409439/149‑1 (MQ=255) cGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTaaa < 2:480116/149‑1 (MQ=255) cGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTaaa > 1:3305284/1‑149 (MQ=255) cGCTTACGGAATGCTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTaaa < 1:2002862/149‑1 (MQ=255) cTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGc < 1:141673/149‑1 (MQ=255) aCGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGt > 1:4558456/1‑149 (MQ=255) aaTGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGAt > 1:764175/1‑149 (MQ=255) aTGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGAtt > 2:1578140/1‑149 (MQ=255) aTGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGAtt > 2:2573185/1‑149 (MQ=255) tGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTg < 2:1498654/149‑1 (MQ=255) gTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGt < 1:1351258/149‑1 (MQ=255) tAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTc > 2:572372/1‑149 (MQ=255) tAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTc < 1:3919316/149‑1 (MQ=255) aCATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTAcc < 1:1287631/149‑1 (MQ=255) tttGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATtaat < 2:206870/149‑1 (MQ=255) ttGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATtaata < 1:1724375/149‑1 (MQ=255) gCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAAc > 1:4317369/1‑149 (MQ=255) cTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACt > 2:354573/1‑149 (MQ=255) tATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGa > 1:125385/1‑149 (MQ=255) tGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGAtt < 1:4072390/149‑1 (MQ=255) ttttCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCa > 1:42758/1‑149 (MQ=255) tttCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCag > 2:1286849/1‑149 (MQ=255) ttCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCaga < 2:300840/149‑1 (MQ=255) gCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGc < 1:264567/149‑1 (MQ=255) gCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGc > 1:603407/1‑149 (MQ=255) gCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGc > 1:1490136/1‑149 (MQ=255) gATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGt > 2:710077/1‑149 (MQ=255) tatCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTaa < 1:2562654/149‑1 (MQ=255) tatCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTaa < 1:2308738/149‑1 (MQ=255) atCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAAt < 2:1433548/149‑1 (MQ=255) tCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATg < 2:1766790/149‑1 (MQ=255) cccGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATgg < 2:1716590/149‑1 (MQ=255) cccGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATgg < 1:3111877/149‑1 (MQ=255) gCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGtt > 1:2554239/1‑149 (MQ=255) ggTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTAt > 1:1004971/1‑149 (MQ=255) gTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTAAGAGGCTGTAATGTTCGTTAtt > 1:3435588/1‑149 (MQ=255) tCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATtcat > 1:2498381/1‑149 (MQ=255) tCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATtcat < 2:2434771/149‑1 (MQ=255) tCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATtcat > 2:1936424/1‑149 (MQ=255) tCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATtcat > 2:4271030/1‑149 (MQ=255) aaTTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACt < 2:3721299/149‑1 (MQ=255) aTTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTc > 2:3506977/1‑149 (MQ=255) aTTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTc > 2:4386776/1‑149 (MQ=255) gtgATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATCCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATc < 1:3457330/149‑1 (MQ=255) tgATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCg > 1:2103406/1‑149 (MQ=255) gATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGc < 2:3589154/149‑1 (MQ=255) aTCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCt > 2:73569/1‑149 (MQ=255) tCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCtt > 2:3420046/1‑149 (MQ=255) tCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCtt > 2:2278457/1‑149 (MQ=255) cTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCttt < 2:3835057/149‑1 (MQ=255) cTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCttt < 1:2258084/149‑1 (MQ=255) tttAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGa < 2:3893020/149‑1 (MQ=255) aaCAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATgg < 2:3480505/149‑1 (MQ=255) aaCAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGAAACTAAAGCAGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCACAGGCTGTAATGGTCGTTATTAAACACTCATCGCTTTTGTGATgg > 2:1632299/1‑149 (MQ=255) aCAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGc > 2:3201983/1‑149 (MQ=255) aGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGAcc < 1:273087/149‑1 (MQ=255) aGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGAcc < 1:3608922/149‑1 (MQ=255) gatgaCATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCAtt > 2:667976/1‑149 (MQ=255) gatgaCATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCAtt > 2:2878110/1‑149 (MQ=255) aCATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACt > 2:1033680/1‑149 (MQ=255) aCATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACt > 2:1123160/1‑149 (MQ=255) cATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTTTGATGGCGACCATTTACtt > 1:18306/1‑149 (MQ=255) cATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACtt < 1:1873595/149‑1 (MQ=255) cATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACtt < 1:4207314/149‑1 (MQ=255) tttCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATTGCGACCATTGACTTCt > 2:1849700/1‑149 (MQ=255) tttCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCt > 2:1171181/1‑149 (MQ=255) gACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTaga > 2:201632/1‑149 (MQ=255) aCGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTagag > 1:4235540/1‑149 (MQ=255) ggCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAggg < 2:1539410/149‑1 (MQ=255) ggCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAggg > 2:4309302/1‑149 (MQ=255) ttAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGaa > 1:3496057/1‑149 (MQ=255) tAAATACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAg < 2:4085973/149‑1 (MQ=255) aaaTACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGt < 1:367654/149‑1 (MQ=255) aaTACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGtc < 2:4580359/149‑1 (MQ=255) aTACCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGtct > 1:4493283/1‑149 (MQ=255) aCCGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGtctct > 2:1058746/1‑149 (MQ=255) cGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTcc < 1:3334610/149‑1 (MQ=255) cGTTCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTcc < 1:998213/149‑1 (MQ=255) ttCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCt < 2:219710/149‑1 (MQ=255) ttCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCt < 2:1091299/149‑1 (MQ=255) tCAATGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTa < 1:4668551/149‑1 (MQ=255) cAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTAt > 1:2778780/1‑149 (MQ=255) aaTGCGTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTAtt > 1:3382326/1‑149 (MQ=255) tGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCa < 1:1185839/149‑1 (MQ=255) gTAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCa > 2:3765743/1‑149 (MQ=255) tAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCaa < 1:3199443/149‑1 (MQ=255) tAGACATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCaa < 1:863263/149‑1 (MQ=255) gATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATg > 1:1100292/1‑149 (MQ=255) atatCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCAATTCAGCAATGc > 1:1688173/1‑149 (MQ=255) | CTTCCTTATTAGCCGCTTACGGAATGTTCTTAAAACATTCACTTTTGCTTATGTTTTCGCTGATATCCCGAGCGGTTTCAAAATTGTGATCTATATTTAACAAAGTGATGACATTTCTGACGGCGTTAAATACCGTTCAATGCGTAGATATCAGTATCTAAAGCCGTCGATTGTCATTCTACCGATATTAATAACTGATTCAGAGGCTGTAATGGTCGTTATTCATCACTCATCGCTTTTGTGATGGCGACCATTGACTTCTGTAGAGGGTGAAGTCTCTCCCTATTCAGCAATGC > CP009273/4600866‑4601161 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |