| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,197,027 | G→T | 5.9% | M25I (ATG→ATT) | ymfI → | e14 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,197,027 | 0 | G | T | 5.9% | 1024.8 / 31.1 | 269 | M25I (ATG→ATT) | ymfI | e14 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (103/150); new base T (4/12); total (107/162) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 | |||||||||||
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |