Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,513,778 | G→T | 11.1% | T165T (ACG→ACT) | curA → | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,513,778 | 0 | G | T | 11.1% | 976.0 / 61.5 | 268 | T165T (ACG→ACT) | curA | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (115/122); new base T (20/11); total (135/133) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
TTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGCCGAACAACTGGCGAAAGCGT > CP009273/1513630‑1513926 | ttGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACg < 1:2135977/149‑1 (MQ=255) tGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACgg > 1:2876323/1‑149 (MQ=255) tGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACgg < 1:3916315/149‑1 (MQ=255) tcatcCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACTGTGGGGc > 1:26493/1‑149 (MQ=255) catcCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCa < 1:3250006/149‑1 (MQ=255) cGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATc > 2:1658784/1‑149 (MQ=255) cGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATc < 1:4339213/149‑1 (MQ=255) aaaaTCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGc < 1:2250853/149‑1 (MQ=255) aaaaTCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGc < 2:2696323/149‑1 (MQ=255) aaTCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCaa > 1:2203611/1‑149 (MQ=255) aTCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCaaa > 2:1700475/1‑149 (MQ=255) tCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAAc < 2:878876/149‑1 (MQ=255) ccATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACt < 1:994138/149‑1 (MQ=255) cATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACtt < 1:1161646/149‑1 (MQ=255) tCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCTACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTaa > 2:224395/1‑149 (MQ=255) tGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAgg < 1:2783353/149‑1 (MQ=255) ggTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGt < 1:108802/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTAAATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGtt < 2:3487943/149‑1 (MQ=255) tCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCTCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAAAGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCACTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACATAAAGGTTg > 2:3255152/1‑149 (MQ=255) cGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGc > 1:2509986/1‑149 (MQ=255) cGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGc < 2:3906396/149‑1 (MQ=255) tGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCaga < 2:2931581/149‑1 (MQ=255) ggTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAgt < 1:304029/149‑1 (MQ=255) tgtgCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAgtgg > 1:2111517/1‑149 (MQ=255) tgtgCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAgtgg < 2:526626/149‑1 (MQ=255) tgCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAgtggtg < 1:4765362/149‑1 (MQ=255) tgCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAgtggtg < 1:2151603/149‑1 (MQ=255) tgCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAgtggtg < 2:2203314/149‑1 (MQ=255) gCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGtggtgg < 1:3966425/149‑1 (MQ=255) gCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGtggtgg < 2:330644/149‑1 (MQ=255) gCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGtggtgg < 2:4825656/149‑1 (MQ=255) cTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTggg > 2:4256737/1‑149 (MQ=255) aGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACTGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTggggg > 2:1307099/1‑149 (MQ=255) gggATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTACAGAGGGCGACACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGt < 1:3099976/149‑1 (MQ=255) gggATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGt > 1:2477292/1‑149 (MQ=255) ggttGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAATGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTa > 1:2014458/4‑149 (MQ=255) aTGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACTGGAACTGTGTGGGCGACTGTTGGGCAAATCGGCAAACTTATAGGTTGCAGTGTGGTGGGGGTAGc < 2:113691/149‑1 (MQ=255) aTGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGc < 1:4713385/149‑1 (MQ=255) tGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGcc < 1:561032/149‑1 (MQ=255) aGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTg > 2:456876/1‑149 (MQ=255) ggCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTgg > 2:4736114/1‑149 (MQ=255) gCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGgc > 2:26231/1‑149 (MQ=255) tttACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGgcgc > 1:1389322/1‑149 (MQ=255) tACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCgg < 1:730346/149‑1 (MQ=255) ccGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGaa > 2:3920014/1‑149 (MQ=255) cGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGaaa > 2:3194140/1‑149 (MQ=255) cTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGaaaaa > 2:4041084/1‑149 (MQ=255) cTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGaaaaa > 1:3585377/1‑149 (MQ=255) tatGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATgcc > 1:796414/1‑149 (MQ=255) tatGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATgcc > 2:5224604/1‑149 (MQ=255) tGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATgccgc < 1:5120797/149‑1 (MQ=255) gCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCAt < 2:4744375/149‑1 (MQ=255) gCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCAt < 2:2569652/149‑1 (MQ=255) cTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGc < 1:1717797/149‑1 (MQ=255) cTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGc > 1:3382971/1‑149 (MQ=255) cTGTATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTAc < 1:3300229/149‑1 (MQ=255) cTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACTGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTAc > 1:4041263/1‑149 (MQ=255) cTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTAc < 1:1899952/149‑1 (MQ=255) cTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTAc < 1:1896309/149‑1 (MQ=255) gATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGa < 2:1957956/149‑1 (MQ=255) gATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGa < 2:619201/149‑1 (MQ=255) atatCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAg > 2:379097/1‑149 (MQ=255) atCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGgt > 1:1594497/1‑149 (MQ=255) atCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGgt > 2:4411601/1‑149 (MQ=255) tCGGTCAGCCTAAAGAGGGTGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGgtg > 2:5141598/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACTGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGgtgt < 1:1257624/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGgtgt > 1:1503237/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGtt < 1:4060315/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTa < 2:2604890/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTa < 2:2016466/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTa > 2:1873384/1‑149 (MQ=255) tCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAg < 2:1888183/149‑1 (MQ=255) aGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGc < 1:3478898/149‑1 (MQ=255) gCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCt > 1:1029864/1‑149 (MQ=255) ccTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCtt < 1:236821/149‑1 (MQ=255) tAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCg > 1:3727652/1‑149 (MQ=255) aaGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGAt < 1:4454212/149‑1 (MQ=255) aaGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGAt < 1:4513787/149‑1 (MQ=255) aaGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGAt > 2:24751/1‑149 (MQ=255) agagGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACTGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATg > 1:496142/1‑149 (MQ=255) gagGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGt < 1:930210/149‑1 (MQ=255) aaCGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTg > 2:3947817/1‑149 (MQ=255) cGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGAt < 2:1928678/149‑1 (MQ=255) gTTGGTGGTAGCTGCGGCTACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATc < 1:2739252/149‑1 (MQ=255) gTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATc > 2:2294402/1‑149 (MQ=255) gtggtAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACTGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATcacca < 1:5249386/149‑1 (MQ=255) tggtAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATACCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATcaccac > 1:2068652/1‑149 (MQ=255) ggtAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCAcg > 2:3601270/1‑149 (MQ=255) tAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCAcgcg < 2:4919241/149‑1 (MQ=255) tGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGgatg < 2:4418941/149‑1 (MQ=255) cggcgACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGgatgat < 1:3699588/149‑1 (MQ=255) gctaCAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGAttt < 2:3029540/146‑1 (MQ=255) cgACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGAtttt < 2:2735212/149‑1 (MQ=255) cgACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGAtttt < 2:2735024/149‑1 (MQ=255) aCAGGACCAGTGGGGGCGACTGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGc > 1:3838663/1‑149 (MQ=255) aGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGCCg < 2:1588160/149‑1 (MQ=255) ggACCAGTGGGGGCGACTGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGCCGa > 2:1616624/1‑149 (MQ=255) aCGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGCCGAACAACTGGCGAAAGc < 2:2848252/149‑1 (MQ=255) cGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGCCGAACAACTGGCGAAAGCg < 1:419935/149‑1 (MQ=255) ggTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGCCGAACAACTGGCGAAAGCGt < 2:1182991/149‑1 (MQ=255) | TTGGCGATCATCCGCAAAATCCATCGTGGTCGCTGGGTGTGCTAGGGATGCCAGGCTTTACCGCTTATATGGGCCTACTGGATATCGGTCAGCCTAAAGAGGGCGAAACGTTGGTGGTAGCTGCGGCGACAGGACCAGTGGGGGCGACGGTGGGGCAAATCGGCAAACTTAAAGGTTGCAGAGTGGTGGGGGTAGCCGGTGGCGCGGAAAAATGCCGCCATGCTACCGAGGTGTTAGGCTTCGATGTTTGTCTTGATCACCACGCGGATGATTTTGCCGAACAACTGGCGAAAGCGT > CP009273/1513630‑1513926 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |