Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,520,863 | G→T | 6.8% | D187Y (GAC→TAC) | yfeH → | putative inorganic ion transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,520,863 | 0 | G | T | 6.8% | 1088.8 / 34.0 | 291 | D187Y (GAC→TAC) | yfeH | putative inorganic ion transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (114/155); new base T (8/14); total (122/169) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
CTGCTGGGGATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCGTGGTGGTCA > CP009273/2520716‑2521010 | tgGGGATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTgg > 1:4317393/1‑149 (MQ=255) gggATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGgt < 2:3615970/149‑1 (MQ=255) gATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGgtgt < 1:5082250/149‑1 (MQ=255) gATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGgtgt < 1:2460730/149‑1 (MQ=255) aTTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTGTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTc > 1:3203279/1‑149 (MQ=255) ttttCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTcg > 2:1616973/1‑149 (MQ=255) ttCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTcgcg > 1:856827/1‑149 (MQ=255) ttCCTTTCACCATTGATGGTTGGACTGGTGATGAATGTTCACGTTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTTCTGCCGTTTGAGTTGGGGCATCTTTACCGTCCGTGGATTGGTTAATTGGTTTcgcg > 1:2603741/1‑149 (MQ=255) tCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATaa > 2:209645/1‑149 (MQ=255) aCCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATaaaa > 2:4703806/1‑149 (MQ=255) cATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATaaaaaa < 2:1159617/149‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAAt > 2:1707551/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAAt > 1:4809209/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATg < 1:4604568/149‑1 (MQ=255) tGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATgg < 2:4558475/149‑1 (MQ=255) gCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTCAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTGTGTGTTTGGGCATCATTCCCGCCCCAGGATTGGTGAATGGGTTTCTCCCCaaaaaaaaatcc > 1:443564/1‑145 (MQ=255) tggttggtCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGAtt < 2:3542408/149‑1 (MQ=255) tggttggtCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGAtt > 1:4290035/1‑149 (MQ=255) gttggtCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGc < 1:4622783/149‑1 (MQ=255) ttggtCTGGTAATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCg > 2:3703161/1‑149 (MQ=255) tCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGaaaa < 1:826440/149‑1 (MQ=255) gTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGa < 2:5021733/149‑1 (MQ=255) tgatgaATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGAc > 2:2994190/1‑149 (MQ=255) tgatgaATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGAc > 1:1654773/1‑149 (MQ=255) tgatgaATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGAGTGGTGACAGGGTGTCGCGCAATAAAAAAATGATTTCGAAAACAGAc > 1:2371516/1‑149 (MQ=255) gatgaATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGAcc < 1:3248737/149‑1 (MQ=255) gaATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGa > 2:2683841/1‑149 (MQ=255) gaATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGa > 1:3833846/1‑149 (MQ=255) tGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGt < 2:3344939/149‑1 (MQ=255) ttCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCCGCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCACTAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTcc > 1:1299941/1‑149 (MQ=255) ttCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTcc < 1:2185187/149‑1 (MQ=255) cACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCAt < 2:1347865/149‑1 (MQ=255) aCGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCAtt < 1:3043063/149‑1 (MQ=255) gTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTg > 2:1814688/1‑149 (MQ=255) gggCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGATGGGGCATCATTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAAGAACAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATACtggtggtgg > 2:3940233/1‑149 (MQ=255) gCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGtt < 1:3482652/149‑1 (MQ=255) aGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTta < 1:2202778/149‑1 (MQ=255) aGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTta < 2:1050125/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATAc < 1:2269089/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATAc > 1:2909848/1‑149 (MQ=255) ttGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACa < 2:3505492/149‑1 (MQ=255) ttGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACa > 2:3468959/1‑149 (MQ=255) tGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAg < 1:357421/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGtt < 2:948922/149‑1 (MQ=255) aGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCCGACGTCCATTCTGGTGGGGGTTTATACAGCGTTc > 2:1415755/1‑149 (MQ=255) ggTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCa < 2:4777791/149‑1 (MQ=255) gTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAg < 1:3691779/149‑1 (MQ=255) ggTAAAATTATGCTGCTACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGa < 1:136731/149‑1 (MQ=255) ggTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGa > 2:1281303/1‑149 (MQ=255) ggTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTGTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGa < 1:4908292/149‑1 (MQ=255) aaTTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCcg > 1:332224/1‑149 (MQ=255) tATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCcgtcg > 2:3165690/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACAGACCAGACGTCCATTCTGGTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCcgtcgt > 1:3252741/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAAATGACCAGACGTCCATTCGGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCcgtcgt > 1:4111768/1‑149 (MQ=255) gctgcAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCCTCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTa > 1:786516/1‑149 (MQ=255) ctgcAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTaa < 1:4717649/149‑1 (MQ=255) ctgcAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTaa < 1:4163639/149‑1 (MQ=255) aCTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTa < 1:1586820/149‑1 (MQ=255) aCTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTa < 1:4282412/149‑1 (MQ=255) ctgctgctgCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTAt > 2:520193/1‑149 (MQ=255) gctgctgcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCt < 1:2553143/149‑1 (MQ=255) gctgctgcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCt < 1:4553122/149‑1 (MQ=255) ctgcCGTTTGTGGTGGGGCATCTGTCCCGGCCGGGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAAGAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCa < 2:4617969/149‑1 (MQ=255) tgcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAAAAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATTGTATAAGGCAt > 1:997229/1‑149 (MQ=255) gcCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATa < 2:4340151/149‑1 (MQ=255) gattGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAg < 2:4107848/147‑1 (MQ=255) gTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAg > 1:3790401/1‑149 (MQ=255) tttGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGt < 2:331597/149‑1 (MQ=255) tttGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGt > 2:4228841/1‑149 (MQ=255) tgtgTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTg < 2:2330506/149‑1 (MQ=255) tgtTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGc > 1:4801178/1‑149 (MQ=255) ttGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTg < 2:4530831/149‑1 (MQ=255) tGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTgg < 1:520193/149‑1 (MQ=255) ggggCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTggg > 1:1014015/1‑149 (MQ=255) ggggCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTggg > 1:1839472/1‑149 (MQ=255) gggCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTgggg < 2:277573/149‑1 (MQ=255) gggCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTgggg > 2:482749/1‑149 (MQ=255) cATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATc < 1:2683841/149‑1 (MQ=255) cATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATc < 1:1408867/149‑1 (MQ=255) aTCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCa > 2:603981/1‑149 (MQ=255) aTCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCa > 2:2875396/1‑149 (MQ=255) cTTTCCCGGCCGTGGATTGGTTACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCAtt < 2:2603741/149‑1 (MQ=255) ttCCCGGCCGTGGATGGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGc < 2:1591330/149‑1 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCt < 1:3442651/149‑1 (MQ=255) cccGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTg < 1:1715818/149‑1 (MQ=255) cGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGtt > 1:1707447/1‑149 (MQ=255) cGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGtt < 2:2649718/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTa > 2:4209221/1‑149 (MQ=255) gCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTa < 2:3681990/149‑1 (MQ=255) cGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATc < 2:4270433/149‑1 (MQ=255) cGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATc > 2:872577/1‑149 (MQ=255) gTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCg > 1:4466902/1‑149 (MQ=255) gTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCg < 1:2096026/149‑1 (MQ=255) ggATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCgtg < 2:2455195/149‑1 (MQ=255) aTTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCgtggt < 1:2062329/149‑1 (MQ=255) aTTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCgtggt < 2:5076809/149‑1 (MQ=255) ttGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCgtggtg < 2:2580171/149‑1 (MQ=255) ggTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCGTggtggt > 1:3379127/1‑149 (MQ=255) gTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCGTGGTGGTc > 1:436595/1‑149 (MQ=255) gTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCGTGGTGGTc < 2:3971530/149‑1 (MQ=255) | CTGCTGGGGATTTTCCTTTCACCATTGCTGGTTGGTCTGGTGATGAATGTTCACGGTGCAGGGGGCAGCCTTGAGCAGGTCGGTAAAATTATGCTGCAACTGCTGCTGCCGTTTGTGTTGGGGCATCTTTCCCGGCCGTGGATTGGTGACTGGGTGTCGCGCAATAAAAAATGGATTGCGAAAACTGACCAGACGTCCATTCTGTTGGTGGTTTATACAGCGTTCAGCGAAGCCGTCGTTAATGGTATCTGGCATAAAGTTGGCTGGGGATCATTGCTGTTTATCGTGGTGGTCA > CP009273/2520716‑2521010 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |