Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,936,672 | 0 | C | A | 15.4% | 897.5 / 111.8 | 277 | intergenic (‑168/‑24) | ygdI/csdA | DUF903 family verified lipoprotein/cysteine sulfinate desulfinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (146/88); new base A (19/24); total (165/112) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.87e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
TTAATAAATCTTAATAGTATTGATTAACAGGCTAAAATTAACGCCTAACACTATTCAGCATATGTTACTTACGCGGCTTCGCCAGGATATCCAGATAATTCTGATGGTTAGCACTCTCCTTGTATCAAAGTGAATTTTGCGTCACGATCGGTGCATCAAGCCGAGGAGTACCATGAACGTTTTTAATCCCGCGCAGTTTCGCGCCCAGTTTCCCGCACTACAGGATGCGGGCGTCTATCTCGACAGCGCCGCGACCGCGCTTAAACCTGAAGCCGTGGTTGAAGCCACCCAACAGTT > CP009273/2936524‑2936820 | ttAATAAATCTTAATAGTATTGATTAACAGGCTAAAATTAACGCCTAACACTATTCAGCATATGTTACTTACGCGGCTTCGCCCGGATATCCAGATAATTCTGATGGTTAGCACTCTCCTTGTATCAAAGTGAATTTTGCGTCACGATc > 2:1327907/1‑149 (MQ=255) ttAATAAATCTTAATAGTATTGATTAACAGGCTAAAATTAACGCCTAACACTATTCAGCATATGTTACTTACGCGGCTTCGCCAGGATATCCAGATAATTCTGATGGTTAGCACTCTCCTTGTATCAAAGTGAATTTTGCGTCACGATc < 2:726477/149‑1 (MQ=255) ttAATAAATCTTAATAGTATTGATTAACAGGCTAAAATTAACGCCTAACACTATTCAGCATATGTTACTTACGCGGCTTCGCCAGGATATCCAGATAATTCTGATGGTTAGCACTCTCCTTGTATCAAAGTGAATTTTGCGTCACGATc < 1:518167/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |