| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,260,296 | G→T | 12.2% | N43K (AAC→AAA) | tdcA ← | tdc operon transcriptional activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,260,296 | 0 | G | T | 12.2% | 768.3 / 66.0 | 222 | N43K (AAC→AAA) | tdcA | tdc operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (102/93); new base T (10/17); total (112/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
AAGACATACCGCTTATCTCATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTACGTTAATTA > CP009273/3260148‑3260442 | aagaCATACCGCTTATCTCATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCg > 1:5242389/1‑149 (MQ=255)aagaCATACCGCTTATCTCATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCg > 1:764594/1‑149 (MQ=255) agaCATACCGCTTATCTCATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGt < 1:2223826/149‑1 (MQ=255) aTACCGCTTATCTCATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAAt > 2:2612767/1‑149 (MQ=255) tACCGCTTATCTCATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATg > 2:4292700/1‑149 (MQ=255) cTTATCTCATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGAtttt > 1:2558807/1‑149 (MQ=255) aTCTCATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACt < 1:1332758/149‑1 (MQ=255) tctcATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTg > 2:1648755/1‑149 (MQ=255) ctcATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACTGa < 2:3761489/149‑1 (MQ=255) tcATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGAc > 2:3806470/1‑149 (MQ=255) aaCCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACTGACGGCCg > 2:326848/1‑149 (MQ=255) cATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGtt > 1:111019/1‑149 (MQ=255) tttttCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGt > 1:2459702/1‑149 (MQ=255) tttcatttcaCGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTa < 2:4435162/149‑1 (MQ=255) catttcaCGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAAcc < 2:3159513/149‑1 (MQ=255) catctcaCGGGGACTGGCGTCGGAACGGGAGCGTAACCATTGACCGGCAGGTGTTACTGGTACACCGGTATTTTGCCGCACCACTAATTCCACACCACAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAAcc < 2:2848692/149‑1 (MQ=255) aCGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAAtt < 2:1803078/149‑1 (MQ=255) gggTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCt > 2:543100/1‑149 (MQ=255) ggTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCtt > 1:5133572/1‑149 (MQ=255) gTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCttt > 2:1328726/1‑149 (MQ=255) tAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCtttt < 2:2892097/149‑1 (MQ=255) aTGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGc < 1:276675/149‑1 (MQ=255) aTGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGc < 1:2902010/149‑1 (MQ=255) tGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCa > 1:96226/1‑149 (MQ=255) tGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCa < 2:2515047/149‑1 (MQ=255) ggATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCag > 1:3427939/1‑149 (MQ=255) aTTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCagcc < 2:4066301/149‑1 (MQ=255) aTTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCagcc < 1:4633236/149‑1 (MQ=255) ggAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCagccgagc > 2:3875671/1‑149 (MQ=255) gAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCagccgagcc > 2:3030559/1‑149 (MQ=255) gggAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATa < 2:2375408/149‑1 (MQ=255) ggAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAg < 2:3578399/149‑1 (MQ=255) ggAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAg < 2:5199662/149‑1 (MQ=255) ggAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAg > 2:800378/1‑149 (MQ=255) gagaGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGa > 2:2038721/1‑149 (MQ=255) gagaGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGa < 1:3203085/149‑1 (MQ=255) tAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCAc > 1:191517/1‑149 (MQ=255) tAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCAc < 2:3350282/149‑1 (MQ=255) aaCAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACt < 2:3955902/149‑1 (MQ=255) aCAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACtt < 1:3546757/149‑1 (MQ=255) cAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTc < 1:2858515/149‑1 (MQ=255) ttGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTaa < 1:3411013/149‑1 (MQ=255) tGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAAt < 2:701754/149‑1 (MQ=255) gACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATg > 2:4787636/1‑149 (MQ=255) gACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATg > 1:2060610/1‑149 (MQ=255) gACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATg > 2:761613/1‑149 (MQ=255) cGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACt < 2:3427695/149‑1 (MQ=255) ggCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACtt > 1:4521681/1‑149 (MQ=255) aGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAAGTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCt < 2:706882/149‑1 (MQ=255) gtTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGaaa > 1:3926450/1‑149 (MQ=255) aaTGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGAc > 1:2315970/1‑149 (MQ=255) aaTGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGAc > 2:3092734/1‑149 (MQ=255) aTGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACt > 1:1479855/1‑149 (MQ=255) ttACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTAcc < 1:665552/149‑1 (MQ=255) tACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCa > 1:2826624/1‑149 (MQ=255) acacCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAg > 2:1020175/1‑149 (MQ=255) acacCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAg > 2:4971899/1‑149 (MQ=255) cacCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAgg < 1:5170161/149‑1 (MQ=255) acCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGt > 2:297328/1‑149 (MQ=255) ccGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGtg < 2:2232956/149‑1 (MQ=255) ccGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGtg > 2:391559/1‑149 (MQ=255) cGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGtgc < 2:2912761/149‑1 (MQ=255) ggTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGtgct < 1:4049059/149‑1 (MQ=255) ttttCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGtt > 1:4875933/1‑149 (MQ=255) ttCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGtttt < 1:542895/149‑1 (MQ=255) ttCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGtttt < 1:1079016/149‑1 (MQ=255) ccGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCATCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCg > 1:1116740/1‑149 (MQ=255) gCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGga > 2:3685442/1‑149 (MQ=255) caccacTAATTCCACACCAAACTAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGgaa < 2:2110763/149‑1 (MQ=255) caccacTAAGTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGgaa < 1:2688786/149‑1 (MQ=255) acTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGgaagaag > 1:4867317/1‑149 (MQ=255) cTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGgaagaaga < 2:4255144/149‑1 (MQ=255) cTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGgaagaaga < 2:4255185/149‑1 (MQ=255) tAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGgaagaagaa < 2:892150/149‑1 (MQ=255) aaTTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAAt < 1:3144343/149‑1 (MQ=255) aaTTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAAt < 2:1897632/149‑1 (MQ=255) aaTTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAAt < 2:1126045/149‑1 (MQ=255) ccACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTg < 2:1635341/149‑1 (MQ=255) acCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCa > 2:1763600/1‑149 (MQ=255) acCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCa > 2:1763142/1‑149 (MQ=255) ccAAAATAATCTTCAATATCTTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCGGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCAt > 1:492815/1‑149 (MQ=255) ccAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCAt > 2:4127993/1‑149 (MQ=255) ccAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCAt > 2:1509934/1‑149 (MQ=255) cAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATa > 2:3274247/1‑149 (MQ=255) aaaaTAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATaa < 2:502755/149‑1 (MQ=255) aaaTAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATaaa > 1:4448651/1‑148 (MQ=255) aaaTAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAAc > 2:4341277/1‑149 (MQ=255) aaaTAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACAACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAAc > 2:537617/1‑149 (MQ=255) ataatCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGa < 1:214197/149‑1 (MQ=255) ataatCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGa > 1:3634080/1‑149 (MQ=255) taatCGTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGAc < 2:4015170/149‑1 (MQ=255) cTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTAc < 2:764594/149‑1 (MQ=255) tCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTACGt < 1:2720395/149‑1 (MQ=255) aaTATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTACGTTa > 2:3140101/1‑149 (MQ=255) atatCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTACGTTaa > 2:4577353/1‑149 (MQ=255) tatCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTACGTTAAt > 1:2974438/1‑149 (MQ=255) tatCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTACGTTAAt > 1:4300305/1‑149 (MQ=255) tatCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTACGTTAAt > 1:4842979/1‑149 (MQ=255) tatCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTACGTTAAt > 1:629816/1‑149 (MQ=255) tCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTACGTTAATTa > 1:1530080/1‑149 (MQ=255) | AAGACATACCGCTTATCTCATTAACCATATTTTTCATTTCACGGGTAATGGATTCGGAACGGGAGAGTAACAATTGACCGGCAGGTGTTAATGTTACACCGGTATTTTTCCGCACCACTAATTCCACACCAAAATAATCTTCAATATCGTTAATGATTTTACTGACGGCCGGTTGAGTTAACCCTAATTCTTTTGCAGCCGAGCCGATAGAACCACTTCTAATGACTTCCTGAAAGACTACCAGGTGCTGCGTTTTCGGAAGAAGAATAGTGCTCATAACGACCTACGTTAATTA > CP009273/3260148‑3260442 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |