| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,492,803 | G→T | 7.4% | intergenic (+243/‑4) | cysG → / → yhfL | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase/small lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,492,803 | 0 | G | T | 7.4% | 927.5 / 36.5 | 244 | intergenic (+243/‑4) | cysG/yhfL | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase/small lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (110/116); new base T (6/12); total (116/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
TGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGC > CP009273/3492655‑3492950 | gggTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGt > 1:1847786/1‑149 (MQ=255) gggTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGt > 2:4709992/1‑149 (MQ=255) gTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTaa > 2:1488795/1‑149 (MQ=255) gTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTaa > 2:4431804/1‑149 (MQ=255) atatTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATg > 1:3161127/1‑149 (MQ=255) tatTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGa > 2:1546269/1‑149 (MQ=255) ttCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAAc < 2:1112521/149‑1 (MQ=255) ttCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAAc > 2:4080206/1‑149 (MQ=255) aCCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGACTGTAAATGAACaaa > 1:4063610/1‑149 (MQ=255) ccGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAAt < 2:4195396/149‑1 (MQ=255) gTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAAttt > 1:4623298/1‑149 (MQ=255) aCAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATttatt < 1:866378/149‑1 (MQ=255) aGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTaa < 1:3598499/149‑1 (MQ=255) gCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTaaa < 2:1372937/149‑1 (MQ=255) gACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGt > 1:2774396/1‑149 (MQ=255) aCTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGtt > 2:2237742/1‑149 (MQ=255) aCTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGtt < 2:3168885/149‑1 (MQ=255) tACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCa < 2:3176471/149‑1 (MQ=255) aCAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCAc > 1:5239723/1‑149 (MQ=255) aaaaTTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTg > 1:3973388/1‑149 (MQ=255) aaGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGt > 2:4672472/1‑149 (MQ=255) aGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTg > 2:251110/1‑149 (MQ=255) ttCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTa > 1:2206739/1‑149 (MQ=255) tCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATTTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTAc < 1:1265000/149‑1 (MQ=255) cGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATTTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACt < 2:2748208/149‑1 (MQ=255) cTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTAc < 1:3079543/149‑1 (MQ=255) cTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTAc < 2:5213321/149‑1 (MQ=255) gACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGt < 2:5110180/149‑1 (MQ=255) aCGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGtt < 2:2142160/149‑1 (MQ=255) gCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTaa > 2:3421665/1‑149 (MQ=255) gCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTaa > 1:1618220/1‑149 (MQ=255) ttAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCa < 1:260258/149‑1 (MQ=255) tAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCAt < 2:3936203/149‑1 (MQ=255) tAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGATAACTGCAt > 2:3354777/1‑149 (MQ=255) aaTATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGt < 2:1018711/149‑1 (MQ=255) aaTATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGt > 2:483701/1‑149 (MQ=255) tatTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTAc < 2:1450960/149‑1 (MQ=255) tatTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTAc < 1:1808342/149‑1 (MQ=255) tatTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTAc < 1:171731/149‑1 (MQ=255) ttCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTg > 2:725008/1‑149 (MQ=255) ccTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGt < 1:594632/149‑1 (MQ=255) cTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTc < 1:2971470/149‑1 (MQ=255) cTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTc < 2:3626207/149‑1 (MQ=255) cTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTc < 1:3709901/149‑1 (MQ=255) tGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCa < 1:3649053/149‑1 (MQ=255) tATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCata < 2:1658420/149‑1 (MQ=255) aTCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCatat < 1:361838/149‑1 (MQ=255) ttCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGaa > 1:1464550/1‑149 (MQ=255) ttCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGaa > 1:538651/1‑149 (MQ=255) cTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGaaaa < 1:818827/149‑1 (MQ=255) cTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGaaaa < 2:1877042/149‑1 (MQ=255) ttAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAAc > 1:3829144/1‑149 (MQ=255) gAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATTTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGa < 2:3523227/149‑1 (MQ=255) gTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGa > 1:4096603/1‑149 (MQ=255) tcttctTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGaa < 2:4525777/149‑1 (MQ=255) tCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGaa > 2:1115366/1‑149 (MQ=255) cTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAAc < 2:5038007/149‑1 (MQ=255) cTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAAc < 2:1750332/149‑1 (MQ=255) tatTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCtt < 2:2423193/149‑1 (MQ=255) tatTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCtt < 2:3759143/149‑1 (MQ=255) atTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTa < 2:4384108/149‑1 (MQ=255) tataATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACt > 1:3239990/1‑149 (MQ=255) tataATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACt > 1:5050427/1‑149 (MQ=255) aaTCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTAcc > 1:3363630/1‑149 (MQ=255) aTCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACct < 2:613994/149‑1 (MQ=255) tCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACctg < 2:1947418/149‑1 (MQ=255) tCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACctg > 1:2741193/1‑149 (MQ=255) aaTGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACctgct < 1:1058669/149‑1 (MQ=255) aTGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACctgctg > 2:2573689/1‑149 (MQ=255) tGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCtgctgc > 1:4878833/1‑149 (MQ=255) tGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCtgctgc > 2:3690389/1‑149 (MQ=255) atatTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCAcc > 1:610587/1‑149 (MQ=255) tatTAATTAATATATAATACATAGGGAATTTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCAccc < 1:1961917/149‑1 (MQ=255) tatTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAGTGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCAccc < 2:266152/149‑1 (MQ=255) tatTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCAccc < 2:1973013/149‑1 (MQ=255) attaattaATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCg > 1:2342385/1‑149 (MQ=255) ttaattaaTATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCgg < 1:1002528/149‑1 (MQ=255) ttaattaaTATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCgg > 1:1941553/1‑149 (MQ=255) taattaatATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGc < 2:665077/149‑1 (MQ=255) ttaatATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAat < 1:4431804/149‑1 (MQ=255) atatatAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCActttc > 2:1284317/1‑149 (MQ=255) atatatAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAatttc < 2:539068/149‑1 (MQ=255) atataATACATAGGGAATTTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAatttcta < 2:3995766/149‑1 (MQ=255) atataATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAatttcta < 1:1702340/149‑1 (MQ=255) atataATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAatttcta < 2:2925005/149‑1 (MQ=255) ataataCATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAatttctatt < 2:3973388/149‑1 (MQ=255) taataCATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAatttctattt > 2:3393612/1‑149 (MQ=255) taataCATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAatttctattt < 1:4254990/149‑1 (MQ=255) aataCATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAatttctatttc < 1:4906310/149‑1 (MQ=255) aataCATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAatttctatttc > 1:3994905/1‑149 (MQ=255) taCATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAAtttctatttcta > 1:813849/1‑149 (MQ=255) cATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTaaa < 2:2793063/149‑1 (MQ=255) cATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTaaa > 2:4185162/1‑149 (MQ=255) tAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAAt > 1:3549237/1‑149 (MQ=255) gggAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCa > 1:766895/1‑149 (MQ=255) ggAATTTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCAt < 1:1831298/149‑1 (MQ=255) ggAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCAt < 2:1087936/149‑1 (MQ=255) ggAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCAt < 1:4709992/149‑1 (MQ=255) aaTGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTg > 1:150005/1‑149 (MQ=255) aTGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTgg > 1:1596273/1‑149 (MQ=255) | TGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGC > CP009273/3492655‑3492950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |